New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 3948771 = | 88 (1.070) | 3 (0.040) | 3/250 | NT | 3.7% | coding (1199/1521 nt) | yifB | magnesium chelatase family protein and putative transcriptional regulator |
? | NC_000913 | 3948803 = | 73 (0.940) | coding (1167/1521 nt) | yifB | magnesium chelatase family protein and putative transcriptional regulator | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GTTTGCAGAATTGGCGTATTTCCGGACTATCCAGCCAGGCATTCAGTTTATTCTGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAACGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTTGAGATAACGTAATGTCTGTTCTGGCGTGCAGCGGTTATGGTTTCCCTGATAATGTCCGGTAGGGCTGGGATTCATCGCCG > NC_000913/3948655‑3948945 | gtatGCAGAATTGGCGGATATCCGGACTATCCAGCCAGGCATTCAGTTTATTCTGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAACGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAAAGCCgggg < 2:233555/146‑1 (MQ=255) gTTTGCAGAATTGGCGTATTTCCGGACTATCCAGCCAGGCATTCAGTTTATTCTGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAACGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCgggg < 8:161024/149‑1 (MQ=255) tttGCAGAATTGGCGTATTTCCGGACTATCCAGCCAGGCATTCAGTTTATTCTGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAACGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCggggg < 2:184744/149‑1 (MQ=255) ttatcagggaaaccataaccgctgcacgccagaacagacattacgttatctcaaccggctctcggggccctttctcgaccgcttcgatctctcactggagatcccattaccacccCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCggggg > 1:222765‑M1/116‑149 (MQ=255) tGCAGAATTGGCGTATTTCCGGACTATCCAGCCAGGCATTCAGTTTATTCTGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAACGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCgggggg < 8:350199/148‑1 (MQ=255) cAGATTTGGCGTATTACCTGACTATCCAGCCAGGCATTCAGTTTATTCTGCCGCTTAACTTGGCGCTCTCTGGCGTCCATTACGCGTTGTGTAACGGTTGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGggtg < 6:60879/148‑1 (MQ=255) aGAATTGGCGTATTTCCGGACTATCCAGCCAGGCATTCAGTTTATTCTGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAACGGTGGAGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGggtgg > 7:272525/1‑148 (MQ=255) gCGTATTTCCGGACTATCCAGCCAGGCATTCAGTTTAGTCTGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCCTTGTTTAACGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGa > 8:294425/1‑149 (MQ=255) aTTTCCGGACTATCCAGCCAGGCATTCAGTTTTTACTGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAAGGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCAATACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGGGGTAATGGGAtctc > 5:56185/1‑149 (MQ=255) cgtaCTATCCAGCCAGGAATTCAGTTTATTCTGCCTCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAACGGTTGCGCTTCTTTCTCCCGGCACTACAGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGt < 5:326333/145‑1 (MQ=255) gACTATCCAGCCAGGCATTCAGTTTATTCTGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAACGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGt > 3:198391/1‑146 (MQ=255) tATCCAGCCAGGCATTCAGTTTATTCTGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAACGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAg > 1:133309/1‑142 (MQ=255) tATCCAGCCAGGCATTCAGTTTATTCTGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAACGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAg < 2:133309/142‑1 (MQ=255) tCCAGCCAGGCATTCAGTTTATTCTGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAACGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGAt < 1:55808/148‑1 (MQ=255) tCCAGCCAGGCATTCAGTTTATTCTGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAACGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGAt < 7:225364/148‑1 (MQ=255) tCCAGCCAGGCATTCAGTTTATTCTGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAACGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATc < 8:57066/149‑1 (MQ=255) tCCAGCCAGGCATACACTTTATTCTGCCGCTTAAATAGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTAGTTTAAAGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGCATCTCCAGTga > 6:135360/1‑143 (MQ=255) agccagGCATTCAGTTTATTCTGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAACGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGaa < 5:58739/149‑1 (MQ=255) agccagGCATTCAGTTTATTCTGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAACGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGaa < 1:194296/149‑1 (MQ=255) 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aTTCTGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAACGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGcc > 8:7527/1‑149 (MQ=255) ttCTGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAACGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGcc < 4:142563/148‑1 (MQ=255) ttCTGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAACGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCCCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGcc < 7:368385/148‑1 (MQ=255) tGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAACGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAg > 7:272753/1‑141 (MQ=255) tGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAACGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAg < 8:272753/141‑1 (MQ=255) 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tttAACGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTTGAGATAACGTAATGTCTGTTCTGGCGTGCAGc > 1:50507/1‑149 (MQ=255) ggTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTTGAGATAACGTAATGTCTGTTCTGGCGGGCAGCGGTTAt < 2:55272/149‑1 (MQ=255) gTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTTGAGATAACGTAATGTCTGTTCTGGCGTGCAGCGGTTATg < 8:148250/149‑1 (MQ=255) tGGGGCTGCTTTCTCCCGGCAGTACCGTTTTACTCAACATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGAGGTCGAGAAAGGGGCCCGAGAGCCGGTTGAGATAACGTAATGTCTGTTCTGGCGTGCAGCGGTTATgg < 8:272525/149‑1 (MQ=255) tGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTTGAGATAACGTAATGTCTGTTCTGGCGTGCAGCGGTTATgg > 1:164342/1‑149 (MQ=255) 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ccGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTTGAGATAACGTAATGTCTGTTCTGGCGTGCAGCGGTTATGGTTTCCCTGATAATGTCCGGTAggg < 2:18134/149‑1 (MQ=255) cGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTTGAGATAACGTAATGt < 1:318039/99‑1 (MQ=255) cGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTTGAGATAACGTAATGt > 2:318039/1‑99 (MQ=255) ttttTCTCAAATTGGCGGGGGGGGGGTATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTGGAGATAACGTAATGTCTGTTCTGGCGTGCAGCGGTTATGGTTTCCCTGATAATGTCCGGTAGGGCTg < 5:213182/149‑1 (MQ=255) aCTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTTGAGATAAGGTAATGTCTGTTCTGGCGTGCAGCGGTTATGGTTGCCCTGATAATGTCCGGTAGGGCTGGGa < 3:310431/148‑1 (MQ=255) aCTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGGCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTTGAGATAACGTACTGTCTGTTCTGGCGTGCAGCGGTTAGGGTTTCCCTGATAATGTCCGGTAGGGCTGGGa < 1:23189/148‑1 (MQ=255) cTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTTGAGATAACGTAATGTCTGTTCTGGCGTGCAGCGGTTATGGTGTCCCTGATAATGTCCGGTAGGGCTGGGAtt > 1:149358/1‑149 (MQ=255) cTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGAGCGAAGCGGTCGAGATAGGGCGCCGAGAGCCGGTTGAGATAAGGTAATGTCTGTTCTGGCGTGCATCGGTTATGGTTTCCCTGATAATGTCCGGTAGGGCTGGGAt < 7:364693/148‑1 (MQ=255) aaaaTGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGGGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCTGTTGAGTTAACGTAATGTCTGTTCTGGCGTGCAGCGGTTATGTTTTCCCTGATAATGTCCGGTAGGGCTGGGATTCAt < 5:135360/149‑1 (MQ=255) aaaaTGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTTGAGATAACGTAATGTCTGTTCTGGCGTGCAGCGGTTATGGTTTCCCTGATAAt < 4:236693/127‑1 (MQ=255) aaaaTGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTTGAGATAACGTAATGTCTGTTCTGGCGTGCAGCGGTTATGGTTTCCCTGATAAt > 3:236693/1‑127 (MQ=255) aaaaTGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTTGAGATAACGTAATGTCTGTTCTGGCGTGCAGCGGTTATGGTTTCCCTGATAATGTCCGGTAGGGCTGGGAt > 6:99240/1‑145 (MQ=255) aaaaTGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTTGAGATAACGTAATGTCTGTTCTGGCGTGCAGCGGTTATGGTTTCCCTGATAATGTCCGGTAGGGCTGGGAt < 5:99240/145‑1 (MQ=255) aaaaTGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTTGAGATAACGTAATGTCTGTTCTGGCGTGCAGCGGTTATGGTTTCCCTGATAATGTCCGGTAGGGCTGGGATTCAt > 8:362283/1‑149 (MQ=255) aaaaTGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCAGACAGCCGGTAGAGATAACTTATAGTCTGTTCTGGCGAGCAGCGGTTATGGTTTCCCTGATAATGTACGGTAGGGCTGGGATTCAt > 8:258675/1‑149 (MQ=255) aaaaTGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGGGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTTGAGATAACGTAATGTCTGTTCTGGCGTGCAGCGGTTATGGTTTCCCTGATAATGTCCGGTAGGGCTGGGATTCa < 7:292068/148‑1 (MQ=255) aaaTGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTTGAGATAACGTAATGTCTGTTCTGGCGTGCAGCGGTTATGGTTTCCCTGATAATGTCCGGTAGGGCTGGGATTCATc > 3:325425/1‑149 (MQ=255) tgccgggGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTTGAGATAACGTAATGTCTGTTCTGGCGTGCAGCGGTTATGGTTTCCCTGATAATGTCCGGTAGGGCTGGGATTCATcgcc < 8:17376‑M2/142‑1 (MQ=255) gccgggGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTTTAGATAACGTAATGTCTGTTCTGGCGTGCAGAGGTTATGGTTTCCCTGATAATGTCCGGTAGGGCTGGGATTCATcgccg > 6:218375‑M2/7‑149 (MQ=255) | GTTTGCAGAATTGGCGTATTTCCGGACTATCCAGCCAGGCATTCAGTTTATTCTGCCGCTTAAATTGGCGCTCTCTGGCGGCCATTACGCGTTGTTTAACGGTGGCGCTGCTTTCTCCCGGCACTACCGTTTTACTCAAAATGCCGGGGGGTGGTAATGGGATCTCCAGTGAGAGATCGAAGCGGTCGAGAAAGGGCCCCGAGAGCCGGTTGAGATAACGTAATGTCTGTTCTGGCGTGCAGCGGTTATGGTTTCCCTGATAATGTCCGGTAGGGCTGGGATTCATCGCCG > NC_000913/3948655‑3948945 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |