| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,128,454 | Δ1 bp | 5.2% | coding (616/1536 nt) | murJ → | putative lipid II flippase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,128,454 | 0 | C | . | 5.2% | 262.2 / 6.7 | 77 | coding (616/1536 nt) | murJ | putative lipid II flippase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/36); new base . (2/2); total (39/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GATTCCGGCGTTTGCTCCAACACTGCTTAACATCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCT > NC_000913/1128312‑1128601 | gATTCCGGCGTTTGCTCCAACACTGCTTAACATCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCAcc > 8:177519/1‑149 (MQ=255) aTTCCGGCGTTTGCTCCAACACTGCTTAACATCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCt < 7:177519/149‑1 (MQ=255) cGGCGTTTGCTCCAACACTGCTTAACATCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTg > 4:13224/1‑146 (MQ=255) ggCGTTTGCTCCAACACTGCTTAACATCAGCATGATTGGTTTCTCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTgaag > 6:168018/1‑148 (MQ=255) gCGTTTGCTCCAACACTGCTTAACATCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTgaagaa < 8:328711/149‑1 (MQ=255) tttGCTCCAACACTGCTTAACATCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTgaag > 7:97357/1‑144 (MQ=255) tGCTCCAACACTGCTTAACATCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATc < 7:270350/148‑1 (MQ=255) tGCTCCAACACTGCTTAACATCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATc < 5:67031/148‑1 (MQ=255) tCCAACACTGCTTAACATCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCg > 1:216368/1‑146 (MQ=255) tCCAACACTGCTTAACATCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCg > 2:316210/1‑146 (MQ=255) tCCAACACTGCTTAACATCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCg < 2:216368/146‑1 (MQ=255) tCCAACACTGCTTAACATCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCg < 1:316210/146‑1 (MQ=255) aaCACTGCTTAACATCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCTGCGTCCTTCTGCTGGGGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGc < 5:384111/149‑1 (MQ=255) aaCACTGCTTAACATCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGc > 6:32132/1‑149 (MQ=255) cacTGCTTAACATCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTg < 5:168018/149‑1 (MQ=255) acTGCTTAACATCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTgg < 2:163664/149‑1 (MQ=255) aaCATCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGcc > 6:244136/1‑149 (MQ=255) aaCATCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGAGTCACCGTACTTTAACCCACGGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTAGGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGc < 8:97357/148‑1 (MQ=255) aCATCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCcg > 3:202351/1‑149 (MQ=255) aTCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCcgcg > 4:250534/1‑149 (MQ=255) aTCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCcgcg > 7:405170/1‑149 (MQ=255) tCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCcgcg > 3:330231/1‑148 (MQ=255) tGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAAc < 8:405170/149‑1 (MQ=255) ttGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTc < 3:13224/149‑1 (MQ=255) ggttCGCGCTGGTGGCCGCACCGGACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCa < 8:180358/146‑1 (MQ=255) gTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCa < 6:175483/148‑1 (MQ=255) gTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCa < 2:109269/148‑1 (MQ=255) gTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCAc > 4:55089/1‑149 (MQ=255) gcgcTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGc > 1:98390/1‑149 (MQ=255) gcgcTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCGGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGGCGGCGGCGTCCTGCCGCTGGTGTATAAGCTACCGCCCCTGACGAAGCTCGGCAGGCTGGTCCTGCCGCGCATTACCTTCCACGATGc > 6:378652/1‑149 (MQ=255) cGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATgc > 7:135361/1‑149 (MQ=255) cACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATgcgc < 1:394457/149‑1 (MQ=255) cGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCgtg < 2:98390/149‑1 (MQ=255) cGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCgtg > 7:35368/1‑149 (MQ=255) tACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCgtggt < 4:202351/149‑1 (MQ=255) aCTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGc < 4:15351/108‑1 (MQ=255) cTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTA‑CGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCgtggtgc > 1:353689/1‑147 (MQ=255) cTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTA‑CGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGa > 1:347961/1‑148 (MQ=255) tttAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGa > 8:275603/1‑148 (MQ=255) tAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGaaa < 8:135361/148‑1 (MQ=255) tAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGaaa > 5:15476/1‑148 (MQ=255) aaCCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAAc < 5:226760/148‑1 (MQ=255) aaCCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAAc < 8:35368/148‑1 (MQ=255) ccACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCgtggt < 8:63182/140‑1 (MQ=255) ccACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGagattcg > 7:63182/1‑142 (MQ=255) aCCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATgg > 4:130840/1‑149 (MQ=255) ggcgctggcgTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGa > 2:121212/1‑149 (MQ=255) gctggcgTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATcc > 4:226305/1‑149 (MQ=255) tggcgTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGa < 1:18039/132‑1 (MQ=255) tggcgTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGa > 2:18039/1‑132 (MQ=255) gcgTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTg < 3:89598/148‑1 (MQ=255) gcgTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTg < 5:244136/148‑1 (MQ=255) gcgTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTg < 4:330231/148‑1 (MQ=255) gCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGGTGGGGGAGCCGCTAGCGCGCCTGAAGCAGATCGGCATGCTGGTGCTGCCGCGCAGTAACTTGCGCGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGGGAAACAGCTGGGACCGGCGATGCTGGGCGtctc > 4:152487/1‑149 (MQ=255) ttACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTA‑CGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCtgt < 2:347961/147‑1 (MQ=255) ttACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTA‑CGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCtgt < 2:353689/147‑1 (MQ=255) aCGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCTCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGa < 4:348147/148‑1 (MQ=255) aCGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGa < 6:261211/148‑1 (MQ=255) cGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGc < 3:250534/149‑1 (MQ=255) cGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGc > 3:47188/1‑149 (MQ=255) ggTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGc > 3:188068/1‑148 (MQ=255) tCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAg < 4:47188/149‑1 (MQ=255) ggcggcGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGc > 1:90331/1‑144 (MQ=255) gcggcgTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAGAtc < 4:188068/149‑1 (MQ=255) cggcgTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCTCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAGAtct > 8:414894/1‑149 (MQ=255) cggcgTCCTGCAGCTGGGGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACTATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGTGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAGAtct < 5:32132/149‑1 (MQ=255) gTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCAACGATGCCGGAGCAATGCTCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCt > 3:194619/1‑148 (MQ=255) cTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATTGGACCCTCGATCCTTGGCGTCTCTCTGAGCCAGATCTCCTTAat > 6:105479/1‑149 (MQ=255) aGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAatcatc < 3:130840/149‑1 (MQ=255) gtATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGAt > 6:381937/1‑93 (MQ=255) gtATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGAt < 5:381937/93‑1 (MQ=255) tCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCAttt > 8:371098/1‑149 (MQ=255) aGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAatcatc < 7:271556/137‑1 (MQ=255) aGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAatcatc > 8:271556/1‑137 (MQ=255) aGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCAttttt > 8:168776/1‑149 (MQ=255) gCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTg > 2:243654/1‑149 (MQ=255) aCCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCt > 4:233207/1‑149 (MQ=255) ccGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCt < 3:226305/148‑1 (MQ=255) | GATTCCGGCGTTTGCTCCAACACTGCTTAACATCAGCATGATTGGTTTCGCGCTGTTTGCCGCACCGTACTTTAACCCACCGGTGCTGGCGCTGGCGTGGGCTGTTACGGTCGGCGGCGTCCTGCAGCTGGTGTATCAGCTACCGCACCTGAAGAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCT > NC_000913/1128312‑1128601 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |