| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 1825935 | 93 (1.070) | 5 (0.060) | 5/236 | NT | 5.3% | intergenic (‑310/+20) | spy/astE | periplasmic ATP‑independent protein refolding chaperone, stress‑induced/succinylglutamate desuccinylase |
| ? | NC_000913 | = 1825939 | 94 (1.180) | intergenic (‑314/+16) | spy/astE | periplasmic ATP‑independent protein refolding chaperone, stress‑induced/succinylglutamate desuccinylase | |||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
GAGAGTGATGAGAGAATATTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCTTATTTTTTCGAGCATTAATCCCGCGCGTAATCCCAACGCTACCAACGGATTAGGGAATAACACATACTCTACATCATGGGTTACGGTAAAACGTTCCTCTCCGTCCTGCGCCAGCAATGTTC > NC_000913/1825796‑1826082 | agagTGATGAGAGAATATTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATttctgc > 2:71327‑M2/1‑143 (MQ=255) tgatgaGAGAATATTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAAatcattctgcgggt < 4:5571‑M1/149‑15 (MQ=255) tgatgaGAGAATATTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAAatcattctgcggg > 3:5571‑M1/1‑135 (MQ=255) gatgaGAGAATATTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATttctgcgggt < 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aaTATTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAg > 3:49106/1‑149 (MQ=255) aaTATTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAg > 5:146585/1‑149 (MQ=255) atatTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGc < 8:170849/149‑1 (MQ=255) tatTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCt > 5:221019/1‑149 (MQ=255) aacaCAATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCTTAtttt > 7:84341/1‑149 (MQ=255) acacGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCTTAttttt < 1:243817/149‑1 (MQ=255) cacGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCTTAtttttt < 8:135164/149‑1 (MQ=255) acGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCTTATTTTTTc < 6:146585/149‑1 (MQ=255) gatgatTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCTTATTTTTTc > 8:225700/1‑147 (MQ=255) ttttGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCTTATTTTTTCGAGCAt > 8:76147/1‑148 (MQ=255) gCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATttctgcggtt < 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aagaaCTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCTTATTTTTTCGAGCATTAATCCCGCGCGTAATc < 7:225700/149‑1 (MQ=255) agaaCTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCTTATTTTTTCGAGCATTAATCCCGCGCGTAATcc < 4:239856/149‑1 (MQ=255) gaaCTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCTTATTTTTTCGAGCATTAATCCCGCGCGTAATcc > 2:356319/1‑148 (MQ=255) cTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCTTATTTTTTCGAGCATTAATCCCGCGCGTAATCCCAAc > 2:412640/1‑149 (MQ=255) cTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCTTATTTTTTCGAGCATTAATCCCGCGCGTAATCCCAAc < 3:234008/149‑1 (MQ=255) 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ccGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCTTATTTTTTCGAGCATTAATCCCGCGCGTAATCCCAACGCTACCAACGGATTAGGGAATAACACATACTCTACATCATGGGTTACGGTAAAACGTTCCTCTCCGTCCTGCGCCAGc > 3:104448/1‑148 (MQ=255) ccGCAGAATGATATCTGCGGGTAAGTATTAGCTTATTTTTTCGAGCATTAATCCCGCGCGTAATCCCAACGCTACCAACGGATTAGGGAATAACACATACTCTACATCATGGGTTACGGTAAAACGTTCCTCTCCGTCCTGCGCCAGc > 4:15512/1‑148 (MQ=255) gCAGAAatcattctgcgggtattaagttgctttcttataaattaatacagattaatcctggttatttgctttatttatcaccagtcatccggtatagttcttcataatctctgcaaaatcatcgtgttgtaatattctctcatcactct > 2:71327‑M1/1‑6 (MQ=255) gCAGAAatcattctgcgggtattaagttgctttcttataaattaatacagattaatcctggttatttgctttatttatcaccagtcatccggtatagttcttcataatctctgcaaaatcatcgtgttgtaatattctct < 4:194166‑M1/140‑135 (MQ=255) gCAGAAatcattctgcgggtattaagttgctttcttataaattaatacagattaatcctggttatttgctttatttatcaccagtcatccggtatagttcttcataatctctgcaaaatcatcgtgttgtaatattctct > 3:194166‑M1/1‑6 (MQ=255) gCAGAAatcattctgcgggtattaagttgctttcttataaattaatacagattaatcctggttatttgctttatttatcaccagtcatccggtatagttcttcataatctct < 1:155275‑M1/112‑107 (MQ=255) gCAGAAatcattctgcgggtattaagttgctttcttataaattaatacagattaatcctggttatttgctttatttatcaccagtcatccggtatagttcttcataatctct > 2:155275‑M1/1‑6 (MQ=255) gCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCTTATTTTTTCGAGCATTAATCCCGCGCGTAATCCCAACGCTACCAACGGATTAGGGAATAACACATACTCTACATCATGGGTTACGGTAAAACGTTCCTCTCCGTCCTGCGCCAGCAAt > 5:394582/1‑149 (MQ=255) aGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCTTATTTTTTCGAGCATTAATCCCGCGCGTAATCCCAACGCTACCAACGGATTAGGGAATAACACATACTCTACATCATGGGTTACGGTAAAACGTTCCTCTCCGTCCTGCGCCAGCAATGt > 7:56917/1‑149 (MQ=255) gAAatcattctgcgggtattaagttgctttcttataaattaatacagattattcatggttatttgctttatttatcaccagtaatccggtatagtcgttcataatctatgaaaaataatcgtgttgtaatattctataatcaatctcaa > 1:23899‑M1/1‑3 (MQ=255) gAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCTTATTTTTTCGAGCATTAATCCCGCGCGTAATCCCAACGCTACCAACGGATTAGGGAATAACACATACTCTACATCATgg < 1:274196/107‑1 (MQ=255) aaTGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCTGATTTTTTCGAGCATTAATCCCGCGCGTAATCCCAACGCTACCAACGGATTAGGGAATAACACATACTCTCCATCATGGGTTACGGTAAAACGTTACTCTCCGTCCTGCGCCAGCAATGTTc > 5:152320/1‑149 (MQ=255) | GAGAGTGATGAGAGAATATTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCTTATTTTTTCGAGCATTAATCCCGCGCGTAATCCCAACGCTACCAACGGATTAGGGAATAACACATACTCTACATCATGGGTTACGGTAAAACGTTCCTCTCCGTCCTGCGCCAGCAATGTTC > NC_000913/1825796‑1826082 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |