| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,597,123 | C→G | 5.5% | intergenic (+111/+27) | lgoD → / ← opgB | L‑galactonate oxidoreductase; L‑gulonate oxidoreductase/OPG periplasmic biosynthetic phosphoglycerol transferases I (membrane‑bound) and II (soluble) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,597,123 | 0 | C | G | 5.5% | 304.2 / 6.0 | 88 | intergenic (+111/+27) | lgoD/opgB | L‑galactonate oxidoreductase; L‑gulonate oxidoreductase/OPG periplasmic biosynthetic phosphoglycerol transferases I (membrane‑bound) and II (soluble) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (41/42); new base G (3/2); total (44/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.45e-01 | |||||||||||
TGAGTTAATTAAAGGCGTAATTACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTG > NC_000913/4596982‑4597270 | tGAGTTAATTAAAGGCGTAATTACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGa > 2:178403/1‑149 (MQ=255) aGTTAATTAAAGGCGTAATTACTTTCTGATAAGGCGAGCTTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGGTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGAcc < 1:70918/149‑1 (MQ=255) ttaattaaAGGCGTAATTACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGc < 8:271877/143‑1 (MQ=255) ttaattaaAGGCGTAATTACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGc > 7:271877/1‑143 (MQ=255) ttaattaaAGGCGTAATTACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTa > 7:156232/1‑149 (MQ=255) aattaaAGGCGTAATTACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTac < 6:168940/148‑1 (MQ=255) aattaaAGGCGTAATTACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTac < 5:255756/148‑1 (MQ=255) aattaaAGGCGTAATTACATTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTAGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGGTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCTac < 1:114700/148‑1 (MQ=255) attaaAGGCGTAATTACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGCCCTaca > 3:278024/1‑148 (MQ=255) ttaaAGGCGTAATTACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTAcaca > 6:248154/1‑149 (MQ=255) cGTAATTACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACAtcagtca < 8:57480/149‑1 (MQ=255) cGTAATTACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACAtcagtca < 4:15608/149‑1 (MQ=255) ttACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAAt > 8:264141/1‑149 (MQ=255) aCTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAAtt < 7:13287/148‑1 (MQ=255) tttCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTAcc > 5:75064/1‑149 (MQ=255) tttCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTAcc < 5:248154/149‑1 (MQ=255) tCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATTCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTAcc < 4:218930/147‑1 (MQ=255) tCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCt > 8:54515/1‑149 (MQ=255) gATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATg > 4:266114/1‑117 (MQ=255) gATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATg < 3:266114/117‑1 (MQ=255) aTAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTc < 2:322566/147‑1 (MQ=255) aTAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCa < 4:345102/148‑1 (MQ=255) gCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGc < 4:244553/112‑1 (MQ=255) gCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGc > 3:244553/1‑112 (MQ=255) attattAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCAc < 3:184389/149‑1 (MQ=255) tattaAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACtt > 1:103341/1‑149 (MQ=255) aaaGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGCACTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAAt > 6:55262/1‑149 (MQ=255) aaaGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAAt > 8:294962/1‑149 (MQ=255) ttGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTc > 8:41633/1‑148 (MQ=255) ccATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTccac < 8:282546/148‑1 (MQ=255) aTGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCTacac > 3:267713/1‑101 (MQ=38) aTGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCTacac < 4:267713/101‑1 (MQ=38) aTGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCAt < 1:157705/149‑1 (MQ=255) tGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTTTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATTCGACCTACACATCATTAAGGAATTACCCTTCACGTTGGACCACTTTAATTTCAACCATg > 2:83438/1‑149 (MQ=255) tGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTaa > 6:274523/1‑138 (MQ=255) tGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTaa < 5:274523/138‑1 (MQ=255) cGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATccc > 7:247346/1‑148 (MQ=255) 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tGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATAAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACgcgg > 6:370001/1‑149 (MQ=255) gcTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAgt < 8:363812/149‑1 (MQ=255) gTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGatat > 7:361597/1‑149 (MQ=255) gTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGatat > 7:367188/1‑149 (MQ=255) tttCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTc < 7:260520/139‑1 (MQ=255) tttCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTc > 8:260520/1‑139 (MQ=255) aataatGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTTCCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTccc < 1:178403/146‑1 (MQ=255) aataatGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATAtt < 2:272724/143‑1 (MQ=255) aataatGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATAtt > 1:272724/1‑143 (MQ=255) taatGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCgt > 4:75090/1‑149 (MQ=255) taatGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCgt < 8:367188/149‑1 (MQ=255) taatGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCgt < 8:361597/149‑1 (MQ=255) atGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCgttg < 7:41633/149‑1 (MQ=255) atGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCgttg > 1:278953/1‑149 (MQ=255) atGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCgttg < 1:83438/149‑1 (MQ=255) tgttgtAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAg < 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gtAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATTTTCCCTTCGTTGGTTgaga > 6:224494/1‑149 (MQ=255) tAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTgaga < 6:75064/148‑1 (MQ=255) tAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTgaga > 1:67985/1‑148 (MQ=255) ccGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGt > 2:224056/1‑149 (MQ=255) tAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTcc < 3:124413/149‑1 (MQ=255) 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2:369740/1‑149 (MQ=255) aGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGa > 7:47888/1‑97 (MQ=255) aGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGa < 8:47888/97‑1 (MQ=255) aGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAAt > 6:146051/1‑148 (MQ=255) gTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTAc > 7:84421/1‑149 (MQ=255) cACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAgt < 7:254375/149‑1 (MQ=255) cACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAgt < 4:278024/149‑1 (MQ=255) cACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAAGTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAgt < 5:55262/149‑1 (MQ=255) aCCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAgtg > 1:149753/1‑149 (MQ=255) ccTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAgtgtg > 6:111747/1‑149 (MQ=255) cTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCa > 6:145886/1‑143 (MQ=255) cTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCa < 5:145886/143‑1 (MQ=255) | TGAGTTAATTAAAGGCGTAATTACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTG > NC_000913/4596982‑4597270 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |