| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,371,933 | T→A | 5.2% | L9I (TTA→ATA) | ycjN → | putative ABC sugar transporter periplasmic binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,371,933 | 0 | T | A | 5.2% | 362.8 / 6.4 | 115 | L9I (TTA→ATA) | ycjN | putative ABC sugar transporter periplasmic binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (57/52); new base A (3/3); total (60/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.75e-01 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
ATTCAGCATGTAAATATTACTAATCTGCATGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGCCGTTATCAGTAAATTGATTGCCCGTTTTGAAAAAGAAAACCC > NC_000913/1371785‑1372081 | atTCAGCATGTAAATATTACTAATCTGCATGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGt > 1:101288/1‑149 (MQ=255) cAGCATGTAAATATTACTAATCTGCATGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAGATCGAAAATCGTGCTGATaa > 6:149475/1‑148 (MQ=255) aGCATGTAAATATTACTAATCTGCATGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAGATCGAAAATCGTGCTGATaac < 5:149475/149‑3 (MQ=255) aGCATGTAAATATTACTAATCTGCATGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCGAAAATCGTGCTGATaac < 7:122728/149‑3 (MQ=255) tGTAAATATTACTAATCTGCATGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCa < 5:9037/149‑1 (MQ=255) gTAAATATTACTAATCTGCATGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCAc > 2:88513/1‑149 (MQ=255) tAAATATTACTAATCTGCATGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCAc < 2:100712/148‑1 (MQ=255) aaTATTACTAATCTGCATGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTgg < 4:7934/149‑1 (MQ=255) atatTACTAATCTGCATGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAACAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGt < 2:144009/149‑1 (MQ=255) ttACTAATCTGCCTGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTc < 2:363543/149‑1 (MQ=255) ttACTAATCTGCATGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGttt > 5:341059/1‑148 (MQ=255) ttACTAATCTGCATGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTc < 1:81168/149‑1 (MQ=255) aCTAATCTGCATGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTTGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCAt > 4:222359/1‑149 (MQ=255) cTAATCTGCATGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCAt < 2:101288/148‑1 (MQ=255) aTCTGCATGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATgcgc > 4:304777/1‑149 (MQ=255) aTCTGCATGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATgcgc < 1:270674/149‑1 (MQ=255) aTCTGCATGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATgc < 6:334475/147‑1 (MQ=255) cATGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATc < 2:56195/126‑1 (MQ=255) cATGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGccc < 6:341059/146‑1 (MQ=255) cATGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGa < 6:334800/149‑1 (MQ=255) gTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGAttt < 4:127943/148‑1 (MQ=255) tCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGAttt > 2:361394/1‑147 (MQ=255) gATCTGATTAGTGTAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGTCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGATCATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCt < 1:133311/149‑1 (MQ=255) gATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTa > 1:173444/1‑147 (MQ=255) aTTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGt < 4:89841/145‑1 (MQ=255) aTTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaaa < 8:182846/148‑1 (MQ=255) aGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAaagaa < 1:175355/148‑1 (MQ=255) gTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAaagaag > 8:166159/1‑148 (MQ=255) tGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAaagaa > 4:214110/1‑146 (MQ=255) tGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAaagaa < 3:214110/146‑1 (MQ=255) tGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAagaaga > 7:330007/1‑148 (MQ=255) aatttGATATATTGTGTAATGAAATAACGCTGCGACCCTGGCAGTTTATGTGGATTAAATAAAAATGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGaaa < 3:336600/145‑1 (MQ=255) gATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTg < 6:176971/106‑1 (MQ=255) gATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTg > 5:176971/1‑106 (MQ=255) atatatTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTCGCATTTTATGTTGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGATATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTg < 7:96304/131‑1 (MQ=255) atatTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACg > 1:355461/1‑148 (MQ=255) tatTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGaa > 4:362478/1‑149 (MQ=255) atTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAAt > 4:114174/1‑149 (MQ=255) gggTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTa > 4:47773/1‑149 (MQ=255) ggTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTAt > 4:220873/1‑149 (MQ=255) tAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGAGTAAATAAAAAGGAACAACTCTTGATTAACTCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTAATGCGCCCTTATTTCAGGCTTTAAAGAAGAAAAAAAAACGAATGTaac > 2:293076/1‑146 (MQ=255) gAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATc > 1:353275/1‑148 (MQ=255) gAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATc > 2:301756/1‑148 (MQ=255) aaTAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGaa > 7:121658/1‑149 (MQ=255) aaCGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAAtt > 7:40651/1‑148 (MQ=255) aCGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGa > 1:144491/1‑144 (MQ=255) cGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTAt < 1:88513/149‑1 (MQ=255) cgcCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCAt > 4:67933/1‑86 (MQ=255) cgcCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCAt < 3:67933/86‑1 (MQ=255) cccTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCAttctt < 6:66746/149‑1 (MQ=255) cccTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCAttct > 5:66746/1‑148 (MQ=255) cTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGGTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCg > 3:26547/1‑149 (MQ=255) gCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATg > 4:134458/1‑120 (MQ=255) gCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATg < 3:134458/120‑1 (MQ=255) gCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCgg < 7:166159/147‑1 (MQ=255) gCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTg > 3:37941/1‑149 (MQ=255) gCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTg < 3:362478/149‑1 (MQ=255) aGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCg < 4:157370/144‑1 (MQ=255) aGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCg > 3:157370/1‑144 (MQ=255) aTGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAAt > 3:240713/1‑112 (MQ=255) aTGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAg > 5:2575/1‑148 (MQ=255) tgtgGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGa < 4:37941/149‑1 (MQ=255) gtgGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAg > 7:256991/1‑149 (MQ=255) ggATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAgcg > 4:229532/1‑149 (MQ=255) gATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTg < 6:50448/137‑1 (MQ=255) gATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAgcgc < 2:355461/149‑1 (MQ=255) aTTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAgcgc > 5:19039/1‑148 (MQ=255) ttAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAgcgc > 6:328655/1‑147 (MQ=255) ataaaAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGcc < 5:340630/149‑1 (MQ=255) ataaaAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGcc < 1:301756/149‑1 (MQ=255) taaaAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAAc > 1:123896/1‑96 (MQ=255) taaaAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAAc < 2:123896/96‑1 (MQ=255) taaaAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGCCg < 8:40651/149‑1 (MQ=255) taaaAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGCCg < 2:173444/149‑1 (MQ=255) taaaAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGCCg < 3:114174/149‑1 (MQ=255) taaaAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGCCg < 3:229532/149‑1 (MQ=255) taaaAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATAGTGCTGTTATCAGCAATTGTTTCATGAGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAAAGAATGTATCCATCGAATATATGCATTCTTCGGTGGAGCAGTAGCGCCAGGCCg > 5:56358/1‑149 (MQ=255) aaaaGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTAATCAGCACTTGTTTCAAGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAg < 5:151384/131‑1 (MQ=255) aaaGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGCCGTTa < 3:304777/149‑1 (MQ=255) ggAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAAt > 4:382653/1‑94 (MQ=255) ggAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAAt < 3:382653/94‑1 (MQ=255) ggAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGCCGTTATCa < 5:328655/149‑1 (MQ=255) aaCATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGCCGTTATCAg > 4:126446/1‑148 (MQ=255) aCATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAg < 6:317679/127‑1 (MQ=255) aCATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAg > 5:317679/1‑127 (MQ=255) tcATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGCCGTTATCAGTAAatt > 3:333672/1‑148 (MQ=255) aTGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCAGTCTTCGGTGGAGAAGGAGCGCCAGGCCGTTATCAGTAAattgat > 4:186228/1‑149 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGCCGTTATCAGTAAattgatttc < 3:222359/148‑3 (MQ=255) aaTCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGCCGTTATCAGTAAATTGATTGCCCGt > 6:250606/1‑149 (MQ=255) aTCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCa > 1:373115/1‑120 (MQ=255) aTCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGCCGTTATCAGTAAattgatt < 5:51804/142‑1 (MQ=255) aTCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGCCGTTATCAGTAAattgatt > 6:51804/1‑142 (MQ=255) aTCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGCCGTTATCAGTAAATTGATTGCCCGtt > 8:228940/1‑149 (MQ=255) tCAAAAATCGAGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGTCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCAACGAATTTATGCATTCTTCGGAGGAGCAGGAGCGCCAGGCCGGTATCAGGAAATTGATTGCCCGttt > 2:379111/1‑149 (MQ=255) gaaaccagTGCTGATAACAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGCCGTTATCAGTAAATTGATTGCCCGtttt > 8:257833/8‑148 (MQ=255) tGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGCCGTTATCAGTAAATTGATTGCCCGTTTTGAAAAAGa > 7:28415/1‑148 (MQ=255) cTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGCCGTTATCAGTAAATTGATTGCCCGTTTTGAAAAAGaaa < 6:2575/148‑1 (MQ=255) tGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGCCGTTATCAGTAAATTGATTGCCCGTTTTGAAAAAGAAAAc > 5:355415/1‑149 (MQ=255) tGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGCCGTTATCAGTAAATTGATTGCCCGTTTTGAAAAAGAAAAc > 1:288048/1‑149 (MQ=255) ttATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGCCGTTATCAGTAAATTGATTGCCCGTTTTGAAAAAGAAAAccc > 3:215776/1‑149 (MQ=255) | ATTCAGCATGTAAATATTACTAATCTGCATGGTCGGGATCTGATTAGTGAAGTTGATATATTGGGTAATGAAATAACGCTGCGCCCCTGGCAGGTTATGTGGATTAAATAAAAAGGAACATCTCATGATTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAAAGAAGAAAATAAAACGAATGTATCCATCGAATTTATGCATTCTTCGGTGGAGCAGGAGCGCCAGGCCGTTATCAGTAAATTGATTGCCCGTTTTGAAAAAGAAAACCC > NC_000913/1371785‑1372081 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |