| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,671,938 | T→C | 5.1% | intergenic (+78/‑22) | ydgU → / → ydgD | stationary phase‑induced protein/putative peptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,671,938 | 0 | T | C | 5.1% | 250.5 / 2.9 | 80 | intergenic (+78/‑22) | ydgU/ydgD | stationary phase‑induced protein/putative peptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/38); new base C (2/2); total (40/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.67e-01 | |||||||||||
CTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTATTTTATGCGCACTGATTACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTTTGCAGATAAACCAGACGTTGCCAGATCGGCAAACGATGAGGTCAGCACCCTGTTTTTTGGTCATGA > NC_000913/1671794‑1672084 | cTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTATTTTATGCGCACTGATTACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAAt > 1:209231/1‑148 (MQ=255)cTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTATTTTATGCGCACTGATTACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAAt > 1:76904/1‑148 (MQ=255)cTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTATTTTATGCGCACTGATTACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAAt > 7:210656/1‑148 (MQ=255) gAGTTCATTCTGATCATCCTTATTTTATGCGCACTGATTACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTTTTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTAcc < 6:74936/148‑1 (MQ=255) gAGTTCATTCTGATCATCCTTATATTATGCGCACTGATTACAGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGAGTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTAcc > 6:354266/1‑148 (MQ=255) gAGTTCATTCGGATCATCCTTATTTTATGCGCACTGAATCCCCCCCGTTTTTATCTTTCCAGATTGAAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGGTTGCTTTTAATAATCATAATTAcc < 2:122446/148‑1 (MQ=255) aGTTCATTCTGATCATCCTTATTTTATGCGCACTGATTACCGGCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCACGTCTATAGTATTTATGAGGGTGTGCTTTTAATAATCATAATTACcca < 5:214286/149‑1 (MQ=255) cATTCTGATCATCCTTATTTTATGCGCACTGATTACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACccacca < 2:209231/148‑1 (MQ=255) ttCTGATCATCCTTATTTTATGCGCACTGATTACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCagag < 8:201279/149‑1 (MQ=255) cTGATCATCCTTATTTTATGCGCACTGATTACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAgt < 4:64025/148‑1 (MQ=255) gATCATCCTTATTTTATGCGCACTGATTACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAgtgt > 1:307213/1‑148 (MQ=255) atcatcCTTATTTTATGCGCACTGATTACCGCCCGTTATTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCAGATTTTACTCACACTTTCATCCCGTCCCGACTAAAGTATATATTAGGGTTTGCTATTAATAATCATAATTACCCACCAGAGtctg > 4:204398/1‑148 (MQ=255) atgcTTTTTTTATTCTCACTGATTAGCGCACGTTTTTATGTTTCGTTATTGTAGTTATCTGTTTTTTCTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTTTTTATGAGGGTTTGCTTTTAATTTTGATAATTACCCACCAGAGTGTGatat < 3:204398/146‑1 (MQ=255) cTTATTTTATGCGCACTGATTACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGc < 2:17268/148‑1 (MQ=255) cTTATTTTATGCGCACTGATTACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCg > 8:141551/1‑149 (MQ=255) aTTTTATGCGCACTGATTACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGt < 6:3414/147‑1 (MQ=255) ttttATGCGCACTGATTACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTAc < 3:267675/148‑1 (MQ=255) ttatATGCGCACTGATTACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTAc > 7:189847/4‑148 (MQ=255) ttATGCGCACTGATTACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAAc > 7:321090/1‑149 (MQ=255) cgcACTGATTACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTg < 2:76904/149‑1 (MQ=255) gcACTGATTACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGc > 8:303335/1‑149 (MQ=255) aCTGATTACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATaa < 8:235983/111‑1 (MQ=255) aCTGATTACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATaa > 7:235983/1‑111 (MQ=255) ttACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAgtg < 8:321090/149‑1 (MQ=255) tACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAgtgt > 6:296563/1‑149 (MQ=255) ccGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGtt < 7:303335/148‑1 (MQ=255) cGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACACACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTgg > 3:202135/1‑149 (MQ=255) cccGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCGCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCAt < 4:84293/98‑1 (MQ=255) cccGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTTTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAgtgt > 7:97707/1‑116 (MQ=255) cccGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTTTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAgtgt < 8:97707/116‑1 (MQ=255) cccGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCAt > 3:84293/1‑98 (MQ=255) ccGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTg > 2:167005/1‑149 (MQ=255) tttttATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCCCTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCACAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCaa > 3:17396/1‑149 (MQ=255) tttttATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCaa > 1:349951/1‑149 (MQ=255) tttttATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCACAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCaa > 3:12203/1‑149 (MQ=255) tttCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTg > 8:308829/1‑123 (MQ=255) tttCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTg < 7:308829/123‑1 (MQ=255) tCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTAccc < 8:103854/92‑1 (MQ=255) tCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGttt < 8:189847/146‑1 (MQ=255) tCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCAAAATTAccc > 7:103854/1‑92 (MQ=255) cTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGt > 7:329379/1‑149 (MQ=255) aTTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCt < 2:349951/148‑1 (MQ=255) aTTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCACAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACGATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTc < 4:12203/147‑1 (MQ=255) aTTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCACAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTc < 4:17396/147‑1 (MQ=255) ttATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTtgt < 7:141551/149‑1 (MQ=255) ttATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTGGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTtgt < 5:354266/149‑1 (MQ=255) tCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGtt > 1:159733/1‑149 (MQ=255) gATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTTTg > 2:232491/1‑148 (MQ=255) aTTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGttt < 2:307213/146‑1 (MQ=255) ttttACTCCCACTTTCATCCCGTCACGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTTTGCa < 4:61754/148‑1 (MQ=255) tCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGc > 1:303259/1‑111 (MQ=255) tCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGc < 2:303259/111‑1 (MQ=255) tCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTTTGCAGATaaa > 3:21266/1‑148 (MQ=255) cccACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTTTGCAGATAAAc > 8:64851/1‑148 (MQ=255) ccACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCt < 8:370614/128‑1 (MQ=255) ccACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCt > 7:370614/1‑128 (MQ=255) ccACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTTTGCAGATAAAc > 8:397905/1‑147 (MQ=255) tCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTTTGCAGATAAACCAGACGtt > 1:232154/1‑149 (MQ=255) aTCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTTTGCAGATAAACCAGACGTTGc < 1:232491/149‑1 (MQ=255) cgtcTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTTTGCAGATAAACCAGACGTTGCCAGATCgg > 5:14274/1‑148 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tATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTTTGCAGATAAACCAGACGTTGCCAGATCGGCAAACGATGAGGt < 4:21266/148‑1 (MQ=255) aGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGt > 5:61253/1‑73 (MQ=255) aGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGt < 6:61253/73‑1 (MQ=255) gggTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTgg > 5:292614/1‑70 (MQ=255) gggTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTgg < 6:292614/70‑1 (MQ=255) gggTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTTTg > 7:249085/1‑103 (MQ=255) gggTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTTTg < 8:249085/103‑1 (MQ=255) gTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTTTGCAGATAAACCAGACGTTGCCAGATCGGCAAACGATGAGGTTAGCAccc < 6:14274/149‑1 (MQ=255) gCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGGTATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTTTGCAGATAAACCAGACGTTGCCAGATCGGCAAACGATGAGGTCAGCACCCTGtt > 3:325788/1‑149 (MQ=255) gCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTTTGCAGATAAACCAGACGTTGCCAGATCGGCAAACGATGAGGTc < 3:293110/138‑1 (MQ=255) gCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTGTGCAGATAAGCCAGACGTTGCCAGATCGGGAAACGATGTGGTc > 4:293110/1‑138 (MQ=255) ttttAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTTTGCAGATAAACCAGACGTTGCCAGATCGGCAAACGATGAGGTCAGCACCCTGtttt > 7:10391/1‑149 (MQ=255) tCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTTTGCAGATAAACCAGACGTTGCCAGATCGGCAAACGATGAGGTCAGCACCCTGTTTTTTGGTCat > 8:67043/1‑148 (MQ=255) aTAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTTTGCAGATAAACCAGACGTTGCCAGATCGGCAAACGa > 1:272368/1‑118 (MQ=255) aTAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTTTGCAGATAAACCAGACGTTGCCAGATCGGCAAACGa < 2:272368/118‑1 (MQ=255) aTAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTTTGCAGATAAACCAGACGTTGCCAGATCGGCAAACGATGAGGTCAGCACCCTGTTTTTTGGTCatga < 2:159733/148‑1 (MQ=255) | CTTTGAGTTCATTCTGATCATCCTTATTTTATGCGCACTGATTACCGCCCGTTTTTATCTTTCCTGATTGTAGTTATCTGATTTTACTCCCACTTTCATCCCGTCCCGTCTATAGTATTTATGAGGGTTTGCTTTTAATAATCATAATTACCCACCAGAGTGTGATATGCGTACAACCATTGCTGTAGTGTTGGGTGCAATTAGTTTGACGTCTGCTTTTGTGTTTGCAGATAAACCAGACGTTGCCAGATCGGCAAACGATGAGGTCAGCACCCTGTTTTTTGGTCATGA > NC_000913/1671794‑1672084 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |