New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3649868 | 41 (1.120) | 6 (0.170) | 5/258 | 4.0 | 12.9% | coding (934/1290 nt) | arsB | arsenite/antimonite transporter |
? | NC_000913 | = 3649901 | 41 (1.160) | coding (967/1290 nt) | arsB | arsenite/antimonite transporter | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
AACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGGCGCGTTGTCCATTGATGGCAGCACGGCATCTGGCGTTATCAAAGAAGCGAT > NC_000913/3649725‑3650016 | aaCGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGTCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGGCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGc < 1:28923/148‑1 (MQ=255) aaCGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTgg < 6:17228/147‑1 (MQ=255) gcgGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGAt < 6:62476/149‑1 (MQ=255) gCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCt > 3:87058/1‑149 (MQ=255) aTTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCtgtg < 2:18282/149‑1 (MQ=255) aTACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGcc > 1:61609/1‑149 (MQ=255) gggTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGa > 4:61582/1‑149 (MQ=255) aaaGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCt > 7:73983/1‑149 (MQ=255) aaGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTc > 1:8288/1‑149 (MQ=255) cTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCtgt > 2:190782/1‑130 (MQ=255) cTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCtgt < 1:190782/130‑1 (MQ=255) cgcgGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTTTGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCg < 4:87058/148‑1 (MQ=255) gCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCt < 8:73983/149‑1 (MQ=255) aGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTc < 5:119477/149‑1 (MQ=255) tCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCctctct > 6:19318/1‑149 (MQ=255) gctcgGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCtatta < 2:8288/146‑1 (MQ=255) ctcgGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGaa < 5:105291/149‑1 (MQ=255) gCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCtctt > 1:143695/1‑135 (MQ=255) gCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCtctt < 2:143695/135‑1 (MQ=255) cATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAata < 5:19318/149‑1 (MQ=255) aTGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAatat > 5:52097/1‑149 (MQ=255) tCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGc < 8:84611/69‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGc > 7:84611/1‑69 (MQ=255) tggtggTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACg > 5:165269/1‑149 (MQ=255) tggtTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTa > 1:92942/1‑149 (MQ=255) ggCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATg > 4:94830/1‑132 (MQ=255) ggCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATg < 3:94830/132‑1 (MQ=255) gCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCtatt > 6:158749/1‑119 (MQ=255) gCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCtatt < 5:158749/119‑1 (MQ=255) ccTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCtattat > 2:42158/1‑120 (MQ=255) ccTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCtattat < 1:42158/120‑1 (MQ=255) ccTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGgcg > 4:5472/1‑149 (MQ=255) gATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGGCGCGTTGTCCATTGAt > 3:64800/1‑149 (MQ=255) aCGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGgcgc > 5:67586/1‑131 (MQ=255) aCGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGgcgc < 6:67586/131‑1 (MQ=255) cGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGGCGCGTTGTCCATTGATGgcagc > 4:129981/1‑149 (MQ=255) ggCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGGCGCGTTGTCCATTGATGGCAGCACGGCATCTg > 6:39344/1‑145 (MQ=255) ggCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGGCGCGTTGTCCATTGATGGCAGCACGGCATCTg < 5:39344/145‑1 (MQ=255) aaCGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGGCGCGTTGTCCATTGATGGCAGCACGGCATCTGGCGTTATCAaag > 5:80003/1‑148 (MQ=255) cGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGGCGCGTTGTCCATTGATGGCAGCACGGCATCTGGCGTTATCAaagaag < 6:80003/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGGCGCGTTGTCCATTGATGGCAGCACGGCATCTGGCGTTATCAAAGAAGCGAt < 6:52097/149‑1 (MQ=255) | AACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGGCGCGTTGTCCATTGATGGCAGCACGGCATCTGGCGTTATCAAAGAAGCGAT > NC_000913/3649725‑3650016 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |