New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 3375686 = | 92 (1.210) | coding (818/1368 nt) | dcuD | putative transporter | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
CGCTTTTGACAAAAAAGATAAAAATATCAATCACGAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAAC > NC_000913/3375519‑3375813 | cgcTTTTGACAAAAAAGATAAAAATATCAATCACGAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGa < 5:107325/149‑1 (MQ=255) gaccaccagcgttaccacgttggcaaagtgcgtacccatgccgtcaaaaaacgcctgcacatcgtccattgtttcgcgcaagttatgcttgcggaagaactcaacaaacatcgtcacagtcaaactcagtaacatcaccaccaccaGAt > 5:360341‑M1/147‑149 (MQ=255) gaccaccagcgttaccacgttggcaaactgcgtacccatgccgtcaaaaaacgcctgcacatcgtccattgtttcgcgcaagttatgcttgcggaagaactcaacaaacatcgtcacagtcaaactcagtaacatcaccaccaccaGAt > 2:342922‑M1/147‑149 (MQ=255) gaccaccagcgttaccacgttggcaaactgcgtacccatgccgtcaaaaaacgcctgcacatcgtccattgtttcgcgcaagttatgcttgcggaagaactcaacaaacatcgtcacagtcaaactcagtaacatcaccaccaccaGAt > 8:357032‑M1/147‑149 (MQ=255) cTTTTGACAAAAAATATAAAAATATCTATCACGAACAGGCTTAGCATAAACCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTAACCTCTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATg < 4:280805/149‑1 (MQ=255) accaccagcgttaccacgttggcaaactgcgtacccatgccgtcaaaaaacgcctgcacatcgtccattgtttcgcgcaagttatgcttgcggaagaactcaacaaacatcgtcacagtcaaactcagtaacatcaccaccaccaGATg < 8:311470‑M1/4‑1 (MQ=255) ttttGACAAAAAAGATAAAAATATCAATCACGAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCGGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATg > 6:289474/1‑148 (MQ=255) ttttGACAAAAAAGATAAAAATATCAATCACGAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATg > 5:320240/1‑148 (MQ=255) 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aatcaCGAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTggtggtggt < 3:202579/149‑1 (MQ=255) atcaCGAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTAGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTggtggtggt > 5:102359/1‑148 (MQ=255) atcaCGAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCAGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGgtggtggtg < 5:289474/149‑1 (MQ=255) tcaCGAACAGGCAGCTCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTAATACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGa < 6:285799/149‑1 (MQ=255) tcaCGAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGa > 5:170250/1‑149 (MQ=255) 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ccGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGa < 5:268137/149‑1 (MQ=255) ccGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGa > 8:363572/1‑149 (MQ=255) ttAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCCCGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGa > 5:327991/1‑149 (MQ=255) aaTCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGAt < 7:363572/148‑1 (MQ=255) aaTCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGAt < 4:34811/148‑1 (MQ=255) tCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGAGTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGAtgtt > 7:316159/1‑148 (MQ=255) tCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGAtgtg < 2:303799/149‑1 (MQ=255) tCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGAtgtg > 7:306250/1‑149 (MQ=255) tGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTAc > 6:336432/1‑75 (MQ=255) aTGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAg < 2:352917/147‑1 (MQ=255) gctcggctcgCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGcat > 7:234351/1‑147 (MQ=255) tcggctcgCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGttt > 5:329228/1‑149 (MQ=255) gctcgCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGtttttt < 4:22001/149‑1 (MQ=255) gCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGa < 6:170250/147‑1 (MQ=255) gCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACg > 4:172870/1‑149 (MQ=255) tGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACgg > 1:128774/1‑148 (MQ=255) tCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATg > 4:279305/1‑149 (MQ=255) cTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAAt < 4:301331/116‑1 (MQ=255) tCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATggg > 1:246806/1‑148 (MQ=255) tCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGttt > 7:311470/1‑149 (MQ=255) ggCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGc > 2:102570/1‑148 (MQ=255) gCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCa > 1:298578/1‑149 (MQ=255) tGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGGTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAAc > 2:235371/1‑149 (MQ=255) | CGCTTTTGACAAAAAAGATAAAAATATCAATCACGAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAAC > NC_000913/3375519‑3375813 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |