Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,011,632 | G→A | 5.2% | A58T (GCC→ACC) | yqeA → | putative amino acid kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,011,632 | 0 | G | A | 5.2% | 246.7 / 2.1 | 77 | A58T (GCC→ACC) | yqeA | putative amino acid kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/39); new base A (2/2); total (36/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.82e-01 |
CCTGGGCGGGAATGCGCTGGGCGATGACCTGGCCGGGCAAATGAAAGCGGTAAAAATTACTTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAGAGAAGAACTGCTTTCTCGGGGCATTAATAAACCTGTAG > NC_000913/3011484‑3011779 | ccTGGGCGGGAATGCGCTGGGCGATGACCTGGCCGGGCAAATGAAAGCGGTAAAAATTACTTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGCGACATGAAGTTATCGTCACTCATCGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAgg > 6:168108/1‑149 (MQ=255) gCGGGAATGCGCTGGGCGATGACCTGGCCGGGCAAATGAAAGCGGTAAAAATTACTTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCttt > 5:215751/1‑149 (MQ=255) gggAATGCGCTGGGCGATGACCTGGCCGGGCAAATGAAAGCGGTAAAAATTACTTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTg > 1:152865/1‑148 (MQ=255) gAATGCGCTGGGCGATGACCTGGCCGGGCAAATGAAAGCGGTAAAAATTACTTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAg > 5:295215/1‑149 (MQ=255) cgcTGGGCGATGACCTGGCCGGGCAAATGAAAGCGGTAAAAATTACTTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGa > 8:352932/1‑142 (MQ=255) cgcTGGGCGATGACCTGGCCGGGCAAATGAAAGCGGTAAAAATTACTTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGa < 7:352932/142‑1 (MQ=255) gcTGGGCGATGACCTGGCCGGGCAAATGAAAGCGGTTAAAATTACTTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCg > 3:239700/1‑149 (MQ=255) cTGGGCGATGACCTGGCCGGGCAAATGAAAGCGGTAAAAATTACTTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGc < 6:295215/149‑1 (MQ=255) tGGGCGATGACCTGGCCGGGCAAATGAAAGCGGTAAAAATTACTTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGc > 8:220246/1‑148 (MQ=255) ggCGATGACCTGGCCGGGCAAATGAAAGCGGTAAAAATTACTTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCaaa < 8:26681/149‑1 (MQ=255) cGATGACCTGGCCGGGCAAATGAAAGCGGTAAAAATTACTTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCaaaaa < 7:127489/149‑1 (MQ=255) gATGACCTGGCCGGGCAAATGAAAGCGGTAAAAATTACTTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAAc > 1:210125/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGGGCAAATGAAAGCGGTAAAAATTACTTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAgc > 6:17746/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGGGCAAATGAAAGCGGTAAAAATTACTTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAgc > 8:303674/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGGGCAAATGAAAGCGGTAAAAATTACCTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAgc < 2:312034/149‑1 (MQ=255) aaaTGAAAGCGGTAAAAATTACTTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAg < 6:176897/138‑1 (MQ=255) aaaTGAAAGCGGTAAAAATTACTTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAg > 5:176897/1‑138 (MQ=255) aaTGAAAGCGGTAAAAATTACATCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGAAATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAAGGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACAAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACACGCCaa < 5:168108/149‑1 (MQ=255) aGCGGTAAAAATTACTTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAAtgctgc < 2:363651/149‑1 (MQ=255) aaaaTTACTTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGAtgt < 8:287769/148‑1 (MQ=255) aTTACTTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGAtgtctgt > 4:106541/1‑149 (MQ=255) ttCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCtgtg > 5:233129/1‑149 (MQ=255) tctcAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGACCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTgtgt > 3:35338/1‑149 (MQ=255) ctcAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTg > 6:269949/1‑111 (MQ=255) ctcAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTg < 5:269949/111‑1 (MQ=255) ctcAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTgtgt < 6:233129/148‑1 (MQ=255) ctcAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTCGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTgtgta > 2:256432/1‑148 (MQ=255) gCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCAt > 5:113728/1‑148 (MQ=255) gCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCAt > 3:228900/1‑148 (MQ=255) aaTTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTaa < 1:40328/149‑1 (MQ=255) ttgttgATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGc < 2:52826/149‑1 (MQ=255) ttgttgATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGc < 3:106541/149‑1 (MQ=255) ttgATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAg < 7:225783/149‑1 (MQ=255) ttgATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGACCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCa < 4:35338/148‑1 (MQ=255) aTTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGACCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGt > 5:358082/1‑149 (MQ=255) tttAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGtt < 8:354062/149‑1 (MQ=255) ttAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTta > 5:322230/1‑149 (MQ=255) ccAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGt > 4:146342/1‑148 (MQ=255) cAGGGACATGAAGTTATCGGATCTCATGGTTACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAATACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTTTGTTGCATTATGACAGGGTTATATTGGTTa < 2:224582/149‑1 (MQ=255) aGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTAc > 1:101784/1‑149 (MQ=255) aGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTAc > 7:13905/1‑149 (MQ=255) aTGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTa < 7:176999/149‑1 (MQ=255) tGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTa > 5:229166/1‑148 (MQ=255) tGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTAc < 5:63636/149‑1 (MQ=255) gAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTAc > 2:269167/1‑148 (MQ=255) gTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACaaaa < 7:220246/149‑1 (MQ=255) aTCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGc > 2:88823/1‑149 (MQ=255) tCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCGTTGAAGCTGCCGCAAAAATTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCt < 6:215751/149‑1 (MQ=255) aCTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTaa < 2:101784/148‑1 (MQ=255) aCTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGGCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTaa < 6:113728/148‑1 (MQ=255) tCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTaa > 2:118040/1‑146 (MQ=255) tCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTaa > 7:12789/1‑146 (MQ=255) cATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAagag < 8:12789/148‑1 (MQ=255) agggTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGCGTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGCAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCTGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAgaga < 4:239700/146‑1 (MQ=255) aTGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATTTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAGagaa < 6:144684/149‑1 (MQ=255) aTGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAagag > 2:239200/1‑147 (MQ=255) aTGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAGagaa < 6:322230/149‑1 (MQ=255) tGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAGagaag < 4:228900/149‑1 (MQ=255) ggTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGATACGATCTACAAAACGCTTTAAGagaag > 1:347158/1‑148 (MQ=255) tAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAGAGAAGAAc > 7:96480/1‑149 (MQ=255) tAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAGAGAAGAAc < 1:88823/149‑1 (MQ=255) gggCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAATCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAGAGAAGAACTGCt < 2:210125/149‑1 (MQ=255) ccGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAGAGAAGAACTGCTTtc < 7:303674/149‑1 (MQ=255) cGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAGAGAAGAACTGCTTtct > 7:143924/1‑149 (MQ=255) ggTGGGCATGATTAACCAGACCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAGAGAAGAACTGCTTTCTCggg < 6:358082/149‑1 (MQ=255) gTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAGAGAAGAACTGCTTTCTCgggg > 2:12975/1‑149 (MQ=255) ggCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAGAGAAGAACTGCTTTCTCGGGGCAt < 1:269167/149‑1 (MQ=255) cATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAGAGAAGAACTGCTTTCTCGGGGCATta < 5:17746/149‑1 (MQ=255) aTGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGATACGATCTACAAAACGCTTTAAGAGAAGAACTGCTTTCTCGGGGCATtaa < 2:347158/149‑1 (MQ=255) tGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAACACGCTTTaa > 1:278629/1‑120 (MQ=255) tGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTaa < 2:278629/120‑1 (MQ=255) tGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAGAGAAGAACTGCTTTCTCGGGGCATtaa > 3:147140/1‑148 (MQ=255) aTTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAGAGAAGAACTGCTTTCTCGGGGCATtaataa < 8:143924/149‑1 (MQ=255) aaCCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGGCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAGAGACGAACTGCTTTCTCGGGGCATTAATAAAc < 2:152865/148‑1 (MQ=255) aCCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAGAGAAGAACTGCTTTCTCGGGGCATTAATAAACCt > 2:265726/1‑149 (MQ=255) aGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTGTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAGAGAAGAACTGCTTTCTCGGGGCATTAATAAACCTg > 6:347979/1‑147 (MQ=255) aGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAGAGAAGAACTGCTTTCTCGGGGCATTAATAAACCTGTa < 1:239200/149‑1 (MQ=255) aGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAGAGAAGAACTGCTTTCTCGGGGCATTAATAAACCTGTa < 1:118040/149‑1 (MQ=255) ggCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTAAGATCTACAAAACGCTTTAAGAGAAGAACTGCTTTCTCGGGGCATTAATAAACCTGTAg > 8:181762/1‑149 (MQ=255) | CCTGGGCGGGAATGCGCTGGGCGATGACCTGGCCGGGCAAATGAAAGCGGTAAAAATTACTTCTCAGGCAATTGTTGATTTAATTGCCCAGGGACATGAAGTTATCGTCACTCATGGTAACGGGCCGCAGGTGGGCATGATTAACCAGGCCTTTGAAGCTGCCGCAAAAACTGAAGCGCACTCGCCAATGCTGCCGATGTCTGTCTGTGTTGCATTAAGCCAGGGTTATATTGGTTACGATCTACAAAACGCTTTAAGAGAAGAACTGCTTTCTCGGGGCATTAATAAACCTGTAG > NC_000913/3011484‑3011779 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |