New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 535539 | 73 (0.880) | coding (1624/1782 nt) | gcl | glyoxylate carboligase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CAACTCGCTTTCGAGAATATCAACTCCAGTGAAGTGAATGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACTGAAACCTGCTTCATGC > NC_000913/535392‑535686 | cAACTCGCTTTCGAGAATATCAACTCCAGTGAAGTGAATGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTaa < 7:59712/148‑1 (MQ=255) aCTCGCTTTCGAGAATATCAACTCCAGTGAAGTGAATGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAAtgg < 1:15326‑M2/149‑4 (MQ=255) gCTTTCGAGAATATCAACTCCAGTGAAGTGAATGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAAtggcgc < 5:186359‑M2/148‑7 (MQ=255) gCTTTCGAGAATATCAACTCCAGTGAAGTGAATGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAAtggcg > 4:253278‑M2/1‑142 (MQ=255) cTTTCGAGAATATCAACTCCAGTGAAGTGAATGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAAtggcgcaa < 6:229082‑M2/149‑9 (MQ=255) cTTTCGAGAATATCAACTCCAGTGAAGTGAATGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAAtggcgca < 3:233935‑M2/148‑8 (MQ=255) gagaATATCAACTCCAGTGAAGTGAATGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGGCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAAtggcgcaatatc > 1:186176‑M2/1‑136 (MQ=255) gaATATCAACTCCAGTGAAGTGAATGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCGGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCggg < 8:370016/149‑1 (MQ=255) gaATATCAACTCCAGTGAAGTGAATGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAAACGGAAGATATTGCGCCGGCCTTTGTACAGGCGAAAGCCTGAATGGGGCAATTTCggg > 4:235900/1‑149 (MQ=255) atatCAACTCCAGTGAAGTGAATGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCCGGTCTTCAAACCGGAAGATAATGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTa < 3:211276/149‑1 (MQ=255) tatCAACTCCAGTGAAGTGAATGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTAc > 1:293391/1‑149 (MQ=255) tatCAACTCCAGTGAAGTGAATGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTAc > 7:206102/1‑149 (MQ=255) tCAACTCCAGTGAAGTGAATGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCg > 6:181408/1‑149 (MQ=255) 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agtgaaTGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAg < 4:281164/149‑1 (MQ=255) tgaaTGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGtt > 2:292683/1‑149 (MQ=255) aaTGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTAt > 6:177265/1‑149 (MQ=255) aaTGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTAt < 3:175343/149‑1 (MQ=255) aTGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTAtt > 4:284929/1‑149 (MQ=255) 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aGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACTGaa < 3:166475/149‑1 (MQ=255) ggCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACTGaaa < 1:349104/149‑1 (MQ=255) gCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACTGAAAc < 4:47372/149‑1 (MQ=255) gCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACTGAAAc > 3:19909/1‑149 (MQ=255) aaaGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACTGAAACCTg > 8:327576/1‑149 (MQ=255) cTTAATGGCGCAATATCGGGTCCCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACTGAAACCTGCTTCa > 1:44910/1‑149 (MQ=255) cTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACTGAAACCTGCTTCa > 2:191879/1‑149 (MQ=255) ttAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATggg > 8:206737/1‑71 (MQ=255) ttAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATggg < 7:206737/71‑1 (MQ=255) aaTGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACTGAAACCTGCTTCATg < 4:19909/148‑1 (MQ=255) aaTGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACTGAAACCTGCTTCATGc > 3:243465/1‑149 (MQ=255) aaTGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGGGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGAGATCGCCGATACCGCAGCGGACGCCCCGCCTGAAACCTGCTTCCTGc > 4:211686/1‑149 (MQ=255) | CAACTCGCTTTCGAGAATATCAACTCCAGTGAAGTGAATGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACTGAAACCTGCTTCATGC > NC_000913/535392‑535686 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |