| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3802387 = | 308 (2.370) | 7 (0.070) | 7/228 | 10.3 | 2.7% | coding (672/1020 nt) | waaO | UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑ alpha‑1,3‑D‑galactosyltransferase |
| ? | NC_000913 | 3802413 = | 253 (2.400) | coding (646/1020 nt) | waaO | UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑ alpha‑1,3‑D‑galactosyltransferase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
GATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTT > NC_000913/3802267‑3802561 | gATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATACGCCAGCAACATATTTAACACATCATGATCAGGATGTGTTA‑ttt > 2:554621/1‑149 (MQ=255) aTAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTCATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCAGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑tttt > 7:306850/1‑149 (MQ=255) aaaaTCGTATCGTGGGGGACTGTGTTTCTACAGCTTTCTTTGATTTGATAATTTAATCGGAACGGGGTGGTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCCACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑ttttttt < 6:389736/149‑1 (MQ=255) aaaaTAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑ttttttt < 4:492431/149‑1 (MQ=255) aaTAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGa < 3:466417/149‑1 (MQ=255) aaTAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATAAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGa < 6:310558/149‑1 (MQ=255) tAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGat > 2:385691/1‑148 (MQ=255) tATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGattatt > 2:486268/1‑149 (MQ=255) tATCGTTGGTTAATTGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAATCTGAACTGCGAGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGAGCAGGATGTGTGA‑TTTTTTTGattatt > 8:407316/1‑149 (MQ=255) tCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTc < 4:338494/149‑1 (MQ=255) gTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCGGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCt < 5:363799/148‑1 (MQ=255) tGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCAtt > 6:258821/1‑147 (MQ=255) tGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTa < 1:147774/149‑1 (MQ=255) tGGGTTTAT‑AAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTTGATTATTTCTGGCTCAtt > 5:227314/1‑147 (MQ=255) tttATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCAt > 6:347995/1‑149 (MQ=255) tataAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGCACTGGGTGTTATATTTAATAACAGCGAAAATAAGTTTATCCGGCAGCAACATATTTAACACATCATGATCAGGATGTGTTA‑TTATTATTATTATTTCTGGCTCATTTAGCa > 8:24341/1‑146 (MQ=255) ataAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTg < 3:510335/148‑1 (MQ=255) ataAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTg < 8:306850/148‑1 (MQ=255) taAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑ttttttt > 7:363432/1‑121 (MQ=255) taAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑ttttttt < 8:363432/121‑1 (MQ=255) aaaGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCaa > 6:107322/1‑149 (MQ=255) aaGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCAtt < 8:549873/137‑1 (MQ=255) aGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCaa > 2:177075/1‑147 (MQ=255) gCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAg > 6:363961/1‑149 (MQ=255) tttctttGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCAt < 8:225022/132‑1 (MQ=255) tttctttGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAg < 7:280839/147‑1 (MQ=255) tttctttGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCt > 7:245034/1‑149 (MQ=255) tttctttGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCATGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCt > 5:418320/1‑149 (MQ=255) ttctttGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑ttttttt < 8:340275/114‑1 (MQ=255) ttctttGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑ttttttt > 7:340275/1‑114 (MQ=255) 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gATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAAcc > 3:298782/1‑149 (MQ=255) gATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAAcc > 1:553096/1‑149 (MQ=255) gATAATCTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAACATTGCAATAGCTCGTGCAGAAAc < 4:310361/148‑1 (MQ=255) tAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGa < 5:347995/148‑1 (MQ=255) aaGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAg > 2:368965/1‑148 (MQ=255) 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cAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAg < 7:38201/149‑1 (MQ=255) cAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAg < 1:22718/149‑1 (MQ=255) accATATTTAACACAGCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTGTGGCTCAGTTAGAATTGCAATAGCTCGtt > 6:373218/3‑78 (MQ=255) cATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATaaaaaa < 5:513240/124‑1 (MQ=255) cATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATaaaaaa > 6:513240/1‑124 (MQ=255) cATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCaa > 2:63050/1‑149 (MQ=255) cATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCaa > 8:51919/1‑149 (MQ=255) atTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTc > 1:342048/1‑149 (MQ=255) tttAACACATCCTGATCAGTATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTcc < 7:515271/149‑1 (MQ=255) tttAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTcc > 7:5748/1‑149 (MQ=255) tttAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTcc < 1:565229/149‑1 (MQ=255) tttAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTcc > 1:218482/1‑149 (MQ=255) tttttttGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTaaa < 7:75448/103‑1 (MQ=255) tttttttGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTaaa > 8:75448/1‑103 (MQ=255) | GATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTT > NC_000913/3802267‑3802561 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |