| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,293,015 | IS1 (+) +8 bp | 75.9% | intergenic (‑93/‑505) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 77 (0.890) | 65/264 | NT | 77.5% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1293015 = | 21 (0.260) | intergenic (‑93/‑512) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 55 (0.630) | 44/264 | NT | 71.1% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1293022 | 21 (0.260) | intergenic (‑100/‑505) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase | |||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
CGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCG > NC_000913/1292875‑1293167 | cgcACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGg > 1:44848‑M2/1‑148 (MQ=255) ggacgAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGgg > 7:84375‑M2/3‑147 (MQ=255) gcACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGgg > 1:196335‑M2/1‑147 (MQ=255) gcACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGgg > 4:89412‑M2/1‑147 (MQ=255) ataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCt > 7:219765‑M2/138‑149 (MQ=255) cGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtga > 6:66914‑M2/1‑144 (MQ=255) gAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgat > 1:387911‑M2/1‑143 (MQ=255) aaGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTa < 8:152994/149‑1 (MQ=255) cctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTAt > 7:391241‑M2/134‑149 (MQ=255) tgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtgtagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGtt < 3:131282‑M2/10‑1 (MQ=255) tgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtgtagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGtt > 4:131282‑M2/132‑141 (MQ=255) aatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTAtttt < 7:1142‑M2/19‑1 (MQ=255) aCGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGATTGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgcc < 1:183010‑M2/148‑13 (MQ=255) tctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTtgtg > 4:286909‑M2/128‑149 (MQ=255) cGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTtgt < 2:294643/148‑1 (MQ=255) tgttgtTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaactta < 8:215009‑M2/149‑19 (MQ=255) aggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgccgc < 8:280699‑M2/26‑1 (MQ=255) aggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcgggggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgcc < 6:300943‑M2/24‑1 (MQ=255) ttgttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttac > 2:96110‑M2/1‑129 (MQ=255) gttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactga < 2:86054‑M2/149‑23 (MQ=255) ttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgat < 1:302134‑M2/149‑24 (MQ=255) aGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatt < 2:373561‑M2/147‑25 (MQ=255) ttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAACCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat < 3:242577‑M2/149‑33 (MQ=255) acggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCttt > 8:221246‑M2/110‑149 (MQ=255) tAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCttt < 4:367197/148‑1 (MQ=255) aaGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 6:183940‑M2/149‑35 (MQ=255) aGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgat > 2:156147‑M2/1‑114 (MQ=255) gTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg > 5:4769‑M2/1‑113 (MQ=255) ctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGACGCCAATAAATATCTTTTCa > 5:166676‑M2/106‑148 (MQ=255) ttCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGATTGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgt < 6:353727‑M2/149‑41 (MQ=255) cGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtt > 7:164607‑M2/1‑107 (MQ=255) gCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt < 7:139545‑M2/149‑44 (MQ=255) agtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGc > 1:103080‑M2/96‑148 (MQ=255) gtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCa < 6:372114‑M2/55‑1 (MQ=255) aTTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggggatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 2:5225‑M2/1‑102 (MQ=255) aTTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGGTGAGGTAATAATAGAGCCTTAATTTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGc < 2:75778/147‑1 (MQ=255) tagtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgc < 5:243013‑M2/149‑52 (MQ=255) gtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctc > 5:183940‑M2/1‑96 (MQ=255) gtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctc > 1:86054‑M2/1‑96 (MQ=255) ttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGAcgc < 3:7672‑M2/65‑1 (MQ=255) ctcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctc > 8:57096‑M2/1‑91 (MQ=255) ctcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctc < 7:57096‑M2/144‑54 (MQ=255) ctcaaaatcggtgtagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAAtt < 5:329433‑M2/50‑1 (MQ=255) ctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAAtt > 6:329433‑M2/83‑132 (MQ=255) aaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCgg < 3:86869‑M2/67‑1 (MQ=255) gtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGccc > 6:184660‑M2/73‑149 (MQ=255) tggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCt < 8:386122‑M2/78‑1 (MQ=255) gagctgcatgacaaagtcttcgggcattatctgaacataacacactatcaataagttggagtcattcccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTAt < 2:164481‑M2/80‑1 (MQ=255) agctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTAtt < 8:219765‑M2/81‑1 (MQ=255) gggggtTTGTTGATGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccactggcttctgtttctatca > 6:112702‑M2/1‑75 (MQ=255) tggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagc < 3:240869‑M2/149‑77 (MQ=255) tggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggctt < 8:117955‑M2/135‑63 (MQ=255) gcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTaca > 2:372258‑M2/65‑149 (MQ=255) catgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTacac < 6:166676‑M2/86‑1 (MQ=255) tgttgAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtc > 4:253303‑M2/1‑68 (MQ=255) aaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCgatga < 1:372258‑M2/92‑1 (MQ=255) aaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCgatga > 8:236418‑M2/58‑149 (MQ=255) gAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACAcc < 7:192600/143‑1 (MQ=255) aGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 7:288594‑M2/1‑63 (MQ=255) gtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGAttt < 4:23885‑M2/95‑1 (MQ=255) gTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGATGTGCAATACCCACCAAAGTAAGTAATTAAAAATTGTTCTTTATTTTGTTCCTACAATAAATATCTTTACATAAAATTACACAGAAAAGACGCTGCATATAGCCCTATTTACACCGATGAttt > 8:165486/1‑148 (MQ=255) aataatAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTCTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTAATTACACAGATGATTTCg > 3:352502/1‑148 (MQ=255) tcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCg > 1:114243‑M2/51‑147 (MQ=255) ggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATaaaa > 3:266688‑M2/48‑95 (MQ=255) ggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATaaaa < 4:266688‑M2/48‑1 (MQ=255) attatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCAAGAAAAGACGCGGCATATAGACCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGt > 2:248080‑M2/45‑149 (MQ=255) tctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAg < 8:298526‑M2/108‑1 (MQ=255) tgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTacac < 5:150498‑M2/86‑1 (MQ=255) aaaTTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatggtgccaagttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttctgctactgacggt > 4:144239‑M2/1‑45 (MQ=255) aaTTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaa < 7:239568/149‑1 (MQ=255) acataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTc > 6:5871‑M2/36‑131 (MQ=255) aTTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAACGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttactgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgtgcagctactgacggggtg > 2:302134‑M2/1‑43 (MQ=255) aaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACtt > 5:90164‑M2/32‑149 (MQ=255) aaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTc > 4:281186‑M2/31‑149 (MQ=255) tgtgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggggatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctg > 6:216504‑M2/1‑36 (MQ=255) tatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGAtt > 3:172494‑M2/25‑149 (MQ=255) tcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTacac > 8:377930‑M2/23‑108 (MQ=255) tcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTacac < 7:377930‑M2/86‑1 (MQ=255) tAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggca < 7:254244‑M2/148‑120 (MQ=255) aataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATg < 5:208499‑M2/129‑1 (MQ=255) aataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATg > 8:175080‑M2/21‑149 (MQ=255) ataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGt < 5:361189‑M2/130‑1 (MQ=255) ataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGt > 5:281046‑M2/20‑149 (MQ=255) ccAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaag < 5:314580‑M2/149‑124 (MQ=255) aGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGAcgc > 2:215889/1‑81 (MQ=255) gagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACAtttt < 6:281046‑M2/138‑1 (MQ=255) gagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACAtttt > 8:352251‑M2/12‑149 (MQ=255) tAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTAt < 5:22107/149‑1 (MQ=255) aGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccgga > 7:223234‑M2/1‑15 (MQ=255) attaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATgg < 3:117870‑M2/142‑1 (MQ=255) accCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGga < 2:114243‑M2/145‑1 (MQ=255) ttCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGCCGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCCGCACGTGAGGTTAAAAGTTCGTGATTCAGGTCCAATTTTATggg > 4:345389/1‑145 (MQ=255) ttCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCACAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACAttt > 5:76563/1‑139 (MQ=255) ttCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATATTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATggg > 3:265645/1‑145 (MQ=255) ccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATggg > 7:176144‑M2/3‑145 (MQ=255) cCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGga > 1:327544‑M2/2‑146 (MQ=255) cCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGAt > 2:330164‑M2/2‑149 (MQ=255) cCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGAt > 3:314970‑M2/2‑149 (MQ=255) aaaaTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgc < 2:264019‑M2/149‑143 (MQ=255) aTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctat > 1:7984‑M2/1‑4 (MQ=255) | CGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCG > NC_000913/1292875‑1293167 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |