| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,128,199 | G→A | 5.5% | A121T (GCT→ACT) | murJ → | putative lipid II flippase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,128,199 | 0 | G | A | 5.5% | 233.8 / 2.4 | 73 | A121T (GCT→ACT) | murJ | putative lipid II flippase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/38); new base A (2/2); total (33/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.32e-01 | |||||||||||
TAAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGTGGAACCGCTTCTCGATTCCGGCGTTTGCTCCAACACTGCTTAACATCAG > NC_000913/1128051‑1128347 | taAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAg > 5:217811/1‑149 (MQ=255)taAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAg > 7:140786/1‑149 (MQ=255) aaaaGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGc > 8:215768/1‑149 (MQ=255) aaaGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCt < 5:64189/149‑1 (MQ=255) aGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGa < 8:15583/149‑1 (MQ=255) aGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGa < 7:382901/149‑1 (MQ=255) gTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGa > 4:118546/1‑148 (MQ=255) gggTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTg > 3:159700/1‑149 (MQ=255) ggTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGc < 2:25368/149‑1 (MQ=255) gctGACGACGCCACGCTGGTCCTTCTAGCTAATCTTTCTGGCCGGCTGCCACTTGCGCTCGCGGTTGTGACGGGCGCAGGCATGCTCGCCGCACCGTGCGTGATCATGCTGACCTCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGc < 2:134328/147‑1 (MQ=255) gAAGCCGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCt > 2:334672/1‑149 (MQ=255) gACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGAc > 6:334626/1‑149 (MQ=255) aCGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGAccagc > 3:84299/1‑147 (MQ=255) aCGCGGGGCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGAccagcca < 4:325010/149‑1 (MQ=255) gcgGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACcagccagc > 4:268335/1‑149 (MQ=255) tCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGAGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGctact > 8:267110/1‑148 (MQ=255) tctcTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCGGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGAtt < 6:20055/149‑1 (MQ=255) tctTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGCTCATGGTGCCCGCGCCAGCCTTCGCTGACACAGCTGCCACATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGCTTAc > 6:226627/1‑149 (MQ=255) ttATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGTCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAACTGACAAAt < 1:228734/116‑1 (MQ=255) ttATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAACTGACAAAt > 2:228734/1‑116 (MQ=255) ttATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAACTGACAAAt > 2:222704/1‑116 (MQ=255) ttATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAACTGACAAAt < 1:222704/116‑1 (MQ=255) tATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGATGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCtt > 4:173470/1‑149 (MQ=255) aTGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCttt > 1:374040/1‑149 (MQ=255) aTGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCt < 1:334672/147‑1 (MQ=255) tGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTc < 6:311181/149‑1 (MQ=255) tCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCta > 6:61465/1‑149 (MQ=255) cTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGTCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCta < 3:115746/148‑1 (MQ=255) tGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTAc > 2:177267/1‑138 (MQ=255) tGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCtata > 3:47454/1‑149 (MQ=255) tGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGAGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTAc < 1:177267/138‑1 (MQ=255) ctgACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTg < 3:47062/147‑1 (MQ=255) ctgACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGGCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGGGATCATGGTGACAGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTg < 4:237453/147‑1 (MQ=255) gACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGa > 3:315496/1‑149 (MQ=255) acacTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGAt > 4:101826/1‑149 (MQ=255) acacTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGAGCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGAt < 2:374040/149‑1 (MQ=255) gcgcTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTccc < 6:377188/148‑1 (MQ=255) gcgcTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTcc < 4:47454/147‑1 (MQ=255) cgcTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCt < 7:63825/148‑1 (MQ=255) gcTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTgg > 5:376214/1‑149 (MQ=255) tGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCAAGGTGACCGAGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCACTATATCGTGCTGATCTCCCTGGCg > 1:333830/1‑149 (MQ=255) ggTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGCCCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGc > 3:210290/1‑149 (MQ=255) ttGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCtg < 5:293923/149‑1 (MQ=255) ttGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCtg < 5:32280/149‑1 (MQ=255) gtgACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACAGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCtgg < 3:309153/148‑1 (MQ=255) tgACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCtggtg < 5:334626/149‑1 (MQ=255) tgACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGGGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCtggtg < 7:39274/149‑1 (MQ=255) aCGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGCTGACCGCGCCAGGCTACGCGGACACAGCGGACAAATTTGCCCTCACCAGCCCTCTACTAAAGATTACAAAACCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCTGCGCtcctgg > 4:35643/1‑143 (MQ=255) ggTCGCTGGCATGCTCGCCACACCGTGGGTGATAAAGGTGAACGAGCCTGTCTTCGCTGAAGCAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACAAAAGATTAACTTTACCTATATCATACTGATCTCCCAGGCTTCGCTGGTGGTAg > 4:94172/1‑149 (MQ=255) ggtcaccATGCTCGCCGCACCGTGGGGGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGa < 1:176781/143‑1 (MQ=255) gCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACCAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGa < 4:84299/148‑1 (MQ=255) gCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCt < 3:101826/148‑1 (MQ=255) gCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCt < 4:315496/148‑1 (MQ=255) gCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCt > 8:215818/1‑148 (MQ=255) gCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTAACCCTATATCTTGCTGATCTCCCTCGCGTCGCTCGTGGGAGCGATTCTGAATa > 7:242738/1‑149 (MQ=255) tCGCCGCCCCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACg > 6:307244/1‑149 (MQ=255) gccgcACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGt < 8:140786/148‑1 (MQ=255) gccgcACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGTg > 3:356739/1‑149 (MQ=255) cACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGTGGAAc < 3:268335/149‑1 (MQ=255) cGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGTGGAACCGc < 7:215768/149‑1 (MQ=255) tGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGTGGAACCGCtt < 4:331156/149‑1 (MQ=255) tGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGTGGAACCGCTtctc > 4:177774/1‑148 (MQ=255) aTCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGTGGAACCGCTTCTCGAt > 3:30526/1‑149 (MQ=255) tCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGTGGAACCGCTTCTCGAtt > 3:109937/1‑149 (MQ=255) tGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGTGGAACCGCTTCTCGATTCCg > 8:242856/1‑149 (MQ=255) aCCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGTGGAACCGCTTCTCGATTCCGGCGt < 5:61465/148‑1 (MQ=255) ccGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGTGGAACCGCTTCTCGATTCCGGCGttt < 4:210290/149‑1 (MQ=255) cgcCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGTGGAACCGCTTCTCGATTCCGGCGTTTGCt < 3:173470/149‑1 (MQ=255) cAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGTGGAACCGCTTCTCGAtt < 5:360275/134‑1 (MQ=255) cAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGTGGAACCGCTTCTCGAtt > 6:360275/1‑134 (MQ=255) cAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGTGGAACCGCTTCTCGATTCCGGCGTTTGCTcc > 6:261152/1‑148 (MQ=255) cGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTCTATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGTGGAACCGCTTCTCGATTCCGGCGTTTGCTCCAACACt < 5:226627/147‑1 (MQ=255) gCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGTGGAACCGCTTCTCGATTCCGGCGTTTGCTCCAACACTGc < 4:155138/148‑1 (MQ=255) acaGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGTGGAACCGCTTCTCGATTCCGGCGTTTGCTCCAACACTGCTTAACAt < 6:217811/149‑1 (MQ=255) caGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGTGGAACCGCTTCTCGATTCCGGCGTTTGCTCCAACACTGCTTAACATc < 7:267110/149‑1 (MQ=255) gCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGTGGAACCGCTTCTCGATTCCGGCGTTTGCTCCAACACTGCTTAACATCAg > 6:149431/1‑149 (MQ=255) | TAAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGGCGTCGCTGGTGGGAGCGATTCTGAATACGTGGAACCGCTTCTCGATTCCGGCGTTTGCTCCAACACTGCTTAACATCAG > NC_000913/1128051‑1128347 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |