New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3726897 | 170 (1.880) | 7 (0.080) | 7/254 | 7.5 | 4.3% | intergenic (+15/+27) | wecH/yiaA | O‑acetyltransferase for enterobacterial common antigen (ECA)/YiaAB family inner membrane protein, tandem domains |
? | NC_000913 | = 3726905 | 154 (1.850) | intergenic (+23/+19) | wecH/yiaA | O‑acetyltransferase for enterobacterial common antigen (ECA)/YiaAB family inner membrane protein, tandem domains | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
CGCACCCGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGAAAGCCAGTCCAT > NC_000913/3726751‑3727042 | cgcACCCGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTcaca < 8:52209/149‑1 (MQ=255) cgcACCCGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTcaca < 1:241886/149‑1 (MQ=255) cgcACCCGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTcaca < 6:24203/149‑1 (MQ=255) cgcACCAGTGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATAGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTca < 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ccGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGa < 3:9530/149‑1 (MQ=255) ccGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGGTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGCCAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAATCCCGGTCACATTGGa > 1:282877/1‑149 (MQ=255) aaTTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGAcc > 7:385367/1‑149 (MQ=255) aTTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCg < 7:37005/149‑1 (MQ=255) gAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGc > 1:25519/1‑149 (MQ=255) cTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTa < 3:143163/149‑1 (MQ=255) ttAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTAc > 6:102330/1‑149 (MQ=255) aaaaaTTGGCCAATACTGGATAGTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGt > 1:308310/1‑149 (MQ=255) aaaaTTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGt < 3:213865/148‑1 (MQ=255) aaTTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAg < 4:183823/149‑1 (MQ=255) aTTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGt < 1:115774/149‑1 (MQ=255) cAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCg < 1:386449/149‑1 (MQ=255) aaTACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGc > 7:94850/1‑149 (MQ=255) aTACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGTTTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCt < 1:138333/149‑1 (MQ=255) tACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTg > 1:200816/1‑149 (MQ=255) tACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTg > 3:211687/1‑149 (MQ=255) tACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTg > 1:60758/1‑149 (MQ=255) tACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTg > 3:220906/1‑149 (MQ=255) tGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTAt > 3:67216/1‑149 (MQ=255) attattTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTAttcttc > 8:257062/1‑149 (MQ=255) ttattTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTAttcttc < 2:25519/148‑1 (MQ=255) tattTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCt > 4:357574/1‑149 (MQ=255) attTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCt < 4:70542/148‑1 (MQ=255) tttGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTgg > 7:370118/1‑149 (MQ=255) tttGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTg < 7:199668/148‑1 (MQ=255) tttGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTAACGTGAGATATTCGCTGTATTCTTCCTgg > 3:350814/1‑149 (MQ=255) ttGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGt < 8:178490/123‑1 (MQ=255) ggATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGt > 5:281266/1‑148 (MQ=255) gATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCt > 3:197826/1‑143 (MQ=255) gATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCt < 4:197826/143‑1 (MQ=255) ttttGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGa < 4:326355/118‑1 (MQ=255) 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< 3:357574/149‑1 (MQ=255) gCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTtggtgg < 2:110756/149‑1 (MQ=255) gCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTtggtgg < 4:67216/149‑1 (MQ=255) cAGAGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTggg < 1:358441/149‑1 (MQ=255) aGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGt > 5:344031/1‑149 (MQ=255) aGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGt < 5:16202/149‑1 (MQ=255) 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tGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACAGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCt > 8:207894/1‑148 (MQ=255) aGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCtt > 5:200742/1‑147 (MQ=255) aGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTaa < 3:305042/149‑1 (MQ=255) ttgaGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTaag > 8:216481/4‑148 (MQ=255) ttAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTaaga < 8:321806/149‑1 (MQ=255) ttAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTaag > 7:143851/1‑148 (MQ=255) aaGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTaag > 6:81912/1‑146 (MQ=255) gTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAgaagaa < 5:136565/149‑1 (MQ=255) tAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAagaaga > 2:234037/1‑147 (MQ=255) tAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAagaaga > 5:304592/1‑147 (MQ=255) aaaGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGAAAGc > 6:170938/1‑149 (MQ=255) aaGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGAAAGc < 3:240880/148‑1 (MQ=255) aaGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGAAAGc > 4:240880/1‑148 (MQ=255) aGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGAAAGCCa < 7:25092/149‑1 (MQ=255) ggTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGCGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCCCCCAACAAGCTGAAGAAGAAAGCCAGTCCa > 6:146206/1‑149 (MQ=255) ggTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGAAAGCCAGTCCa < 4:231746/149‑1 (MQ=255) gTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGAAAGCCAGTCCAt < 4:37308/149‑1 (MQ=255) | CGCACCCGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGAAAGCCAGTCCAT > NC_000913/3726751‑3727042 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |