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Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
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gTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGAGGAAAGATTAATTTCACATTAAATCCTGCTGCTGATAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCAGAATATAATATATTCATAGCa > 7:164822/1‑149 (MQ=255) aCCGGTcagtactgccaccaaccggtctttacttgctcatcgttataattttgttggtaacagttcgggaaagttgtttttctaaattaacaacagaataactttcttgtttaatgagattaatattggcaaccattatagcctccttc < 8:198614‑M1/149‑144 (MQ=255) aCCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGAGGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGAATATAATATATTCCTAGCAccctt > 6:311668/1‑146 (MQ=255) ccGGTcagtactgccaccaaccggtctttacttgctcatcgttataattttgttggtaacagttcgggaaagttgtttttctaaattaacaacagaataactttcttgtttaatgagattaatattggcaaccattatagcctccttcc < 6:179877‑M1/149‑145 (MQ=255) cGGTcagtactgccaccaaccggtctttacttgctcatcgttataattttgttggtaacagttcgggaaagttgtttttctaaattaacaacagaataactttcttgtttaatgagattaatattggcaaccattatagcctccttcc > 7:202204‑M1/1‑4 (MQ=255) cGGTTTGTGGCAGTACTGACCGGTATGTGATGAAAGATTAATTTAACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACTTTTTTATGCTACACAATTCAGATTATGCAAATAAATATCTATTAATATAATATATTAATAGCACCCATAAt < 3:163612/149‑1 (MQ=255) gTcagtactgccaccaaccggtctttacttgctcatcgttataattttgttggtaacagttcgggaaagttgtttttctaaattaacaacagaataactttcttgtt < 3:129061‑M1/107‑106 (MQ=255) gTcagtactgccaccaaccggtctttacttgctcatcgttataattttgttggtaacagttcgggaaagttgtttttctaaattaacaacagaataactttcttgtt > 4:129061‑M1/1‑2 (MQ=255) ttGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGAATATAATATATTCATAGCACCCATAATTCa < 1:70821/149‑1 (MQ=255) | TGTTTGCTCTTAAACCGTGGGAAGGAGGCTATAATGGTTGCCAATATTAATCTCATTAAACAAGAAAGTTATTCTGTTGTTAATTTAGAAAAACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGAATATAATATATTCATAGCACCCATAATTCA > NC_000913/4078816‑4079112 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |