| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 564,107 | IS2 (+) +5 bp | 100% | coding (370‑374/633 nt) | sfmZ ← | response regulator family protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | 83 (0.930) | 70/246 | NT | 98.8% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 564107 = | 1 (0.010) | coding (374/633 nt) | sfmZ | response regulator family protein | |||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
GATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/381407‑381260‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aTACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATTATCTAATAAAGAAATTGCCGA < NC_000913/564111‑563966 TTTCCTGTGTGGTACACCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATACAC > 1:442519/1‑148 TTCCTGTGTGGTACGCGGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA < 7:353891/142‑1 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CTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATTATCTAATAAAGAAA > 7:48119/1‑142 CTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATTATCTAATAAAGAAA < 8:48119/142‑1 TATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATTATCTAATAAAGAAATTGCCGA > 7:304105/1‑148 ATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATTATCTAATAAAGAAATTGCCGA > 1:83371/1‑147 ATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATTATCTAATAAA < 6:83894/136‑1 GATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/381407‑381260‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aTACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATTATCTAATAAAGAAATTGCCGA < NC_000913/564111‑563966 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |