| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
GCCAGCAGTTTGTGAGTGGACTGGGTTTCGTAAATCACTTTCCCTTCTACACGGCCACCGCTCATACCGCATTTACCTTCGTAAATCGGTGAGAAGTTGGTGTAAGGCACCCACGCGGAGTCAAAGTGGATGGATTTCACATCCAGTGTTTTCTTGATGAAGTCGGTGTTGTACAGCAGACCATCATAGGTAGAGTTGGTAATTACAGCATGTACCGGCCAGGTTGCGTTTGGTGTTTCTTTCACGCGCTTAGCAATGGTAGCGTGCTGGAATTCACTCTGTG > NC_000913/4357509‑4357791 | gccAGCAGTTTGTGAGTGGACTGGGTTTCGTAAATGACTTTCCGTTCTACACGGCCACCGCTCATACCGCATTTACCTTCGTAAATCGGTGAGAAGTTGGTGTAAGGCACCCACGCGGAGTCAAAGTGGATGGATTTCACATCCAgtg < 7:126726/148‑1 (MQ=255) gTTTGTGAGTGGACTGGGTTTCGTAAATCACTTTCCCTTCTACACGGCCACCGCTCATACCGCATTTACCTTCGTAAATCGGTGAGAAGTTGGTGTAAGGCACCCACGCGGAGTCAAAGTGGATGGATTTCACATCCAGTGTTTTCtt < 4:88178/148‑1 (MQ=255) tttGTGAGTGGACTGGGTTTCGTAAATCACTTTCCCTTCTACACGGCCACCGCTCATACCGCATTTACCTTCGTAAATCGGTGAGAAGTTGGTGTAAGGCACCCACGCGGAGTCAAAGTGGATGGATTTCACATCCAGTGTTTTCtt > 1:104208/1‑147 (MQ=255) tttGTGAGTGGACTGGGTTTCGTAAATCACTTTCCCTTCTACACGGCCACCGCTCATACCGCATTTACCTTCGTAAATCGGTGAGAAGTTGGTGTAAGGCACCCACGCGGAGTCAAAGTGGATGGATTTCACATCCAGTGTTTTCTtg < 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gTGGACTGGGTTTCGTAAATCACTTTCCCTTCTACACGGCCACCGCTCATACCGCATTTACCTTCGTAAATCGGTGAGAAGTTGGTGTAAGGCACCCACGCGGAGTCAAAGTGGATGGATTTCACATCCAGTGTTTTCTtg > 1:115705/1‑141 (MQ=255) gTGGACTGGGTTTCGTAAATCACTTTCCCTTCTACACGGCCACCGCTCATACCGCATTTACCTTCGTAAATCGGTGAGAAGTTGGTGTAAGGCACCCACGCGGAGTCAAAGTGGATGGATTTCACATCCAGTGTTTTCTTGATGAAGt < 5:28455/148‑1 (MQ=255) gACTGGGTTTCGTAAATCACTTTCCCTTCTACACGGCCACCGCTCATACCGCATTTACCTTCGTAAATCGGTGAGAAGTTGGTGTAAGGCACCCACGCGGAGTCAAAGTGGATGGATTTCACATCCAGTGTTTTCTTGATGAAGTCg < 8:386631/147‑1 (MQ=255) cTGGGTTTCGTAAATCACTTTCCCTTCTACACGGCCACCGCTCATACCGCATTTACCTTCGTAAATCGGTGAGAAGTTGGTGTAAGGCACCCACGCGGAGTCAAAGTGGATGGATTTCACATCCAGTGTTTTCTTGATGAAGTCGgtg > 1:106262/1‑148 (MQ=255) tgTTTCGTAAATCACTTTCCCTTCTACACGGCCACCGCTCATACCGCATTTACCTTCGTAAATCGGTGAGAAGTTGGTGTAAGGCACCCACGCGGAGTCAAAGTGTATGGATTTCACATCCAGTGTTTTCTTGATGAAGTCGgtgt < 2:34758/145‑1 (MQ=255) 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gAGTCAAAGTGGATGGATTTCACATCCAGTGTTTTCTTGATGAAGTCGGTGTTGTACAGCAGACcatc > 3:397423/1‑68 (MQ=255) aGTCAAAGTGGATGGATTTCACATCCAGTGTTTTCTTGATGAAGTCGGTGTTGTACAGCAGACCATCATAGGTAGAGTTGGTAATTACAGCATGTACCGGCCAGGTTGCGTTTGGTGTTTCTTTCACGCGCTTAGCAATGGTAGCGTg < 8:84105/148‑1 (MQ=255) cAAAGTGGATGGATTTCACATCCAGTGTTTTCTTGATGAAGTCGGTGTTGTACAGCAGACCATCAAAGGTAGAGTTGGTAATTACAGCATGTACCGGCCAGGTTGCGTTTGGTGTTTCTTTCACGCGCTTAGCAATGGTAGCGTGCTg > 3:406950/1‑148 (MQ=255) aaGTGTATGGATTTGTCATCCAGTGTTTTCTTGATGAAGTCGGTGTTGTAGATCTTACAATCATAGGTTGAGTTGGTATTTACAGTATGTAACGTCCAGGTTTCGTTTGGTGTTTCTTTCACGCGCTTAGCAATGGTAGAGTGCTGGa < 2:408323/148‑1 (MQ=255) GGATGGATTTCACATCCAGTGTTTTCTTGATGAAGTCGGTGTTGTACAGCAGACCATCATAGGTAGAGTTGGTAATTACAGCATGTACCGGCCAGGTTGCGTTTGGTGTTTCTTTCACGCGCTTAGCAATGGTAGCGTGCTGGAAtt < 7:415833‑M1/147‑1 (MQ=255) ATGGATTTCACATCCAGTGTTTTCTTGATGAAGTCGGTGTTGTACAGCAGACCATCATAGGTAGAGTTGGTAATTACAGCATGTACCGGCCAGGTTGCGTTTGGTGTTTCTTTCACGCGCTTAGCAATGGTAGCGTGCTGGAATTCAc > 5:37048‑M1/1‑148 (MQ=255) gatTTCACATGCCGTGTTTTCTTGATGAAGTCGGTGTTGTACTGCAGACCATCATAGGTAGACTTGGGATTTACAGCATGTACCGCCCAGGTTGCGTTTGGTGATTCTTTCACGCGCTTAGCAATGGTAGCGCGCTGGAATTCActct < 8:218271/148‑1 (MQ=255) tttCACATACAGTGTTTTCTTGATGAAGTCGGTGTTGTACAGCAGACAATCATAGGTAGAGTTGGTAATTACAGCATGTACCGGCCAGGTTGCGTTTGGTGTTTCTTTCACGCGCTTAGCAATGGTAGCGTGCTGGAATTCACTCtgt > 8:51597/1‑148 (MQ=255) tCACATCCAGTGTTTTCTTGATGAAGTCGGTGTTGTACAGCAGACCATCATAGGTAGAGTTGGTAATTACAGCATGTACCGGCCAGGTTGCGTTTGGTGTTTCTTTCACGCGCTTAGCAATGGTAGCGTGCTGGAATTCACTCtgtg < 3:332553/147‑1 (MQ=255) gtgtTTTCTTGATGAAGTCGGTGTTGTACAGCAGACCATCATAGGTAGAGTTGGTAATTACAGCATGTACCGGCCAGGTTGCGTTTGGTGtttctttc < 4:227103/98‑1 (MQ=255) gtgtTTTCTTGATGAAGTCGGTGTTGTACAGCAGACCATCATAGGTAGAGTTGGTAATTACAGCATGTACCGGCCAGGTTGCGTTTGGTGtttc > 5:201540/1‑94 (MQ=255) gtgtTTTCTTGATGAAGTCGGTGTTGTACAGCAGACCATCATAGGTAGAGTTGGTAATTACAGCATGTACCGGCCAGGTTGCGTTTGGTGtttc < 6:201540/94‑1 (MQ=255) | GCCAGCAGTTTGTGAGTGGACTGGGTTTCGTAAATCACTTTCCCTTCTACACGGCCACCGCTCATACCGCATTTACCTTCGTAAATCGGTGAGAAGTTGGTGTAAGGCACCCACGCGGAGTCAAAGTGGATGGATTTCACATCCAGTGTTTTCTTGATGAAGTCGGTGTTGTACAGCAGACCATCATAGGTAGAGTTGGTAATTACAGCATGTACCGGCCAGGTTGCGTTTGGTGTTTCTTTCACGCGCTTAGCAATGGTAGCGTGCTGGAATTCACTCTGTG > NC_000913/4357509‑4357791 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |