New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 130075 = | 94 (1.290) | coding (1186/1854 nt) | yacH | DUF3300 family protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
CGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGA > NC_000913/129928‑130218 | cgtcATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAgg > 7:214765/1‑148 (MQ=255) cgtcATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGt < 1:288240/149‑1 (MQ=255) gtcATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGTTGCGGCGGGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGACGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGt > 6:294588/1‑148 (MQ=255) tcATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTaa > 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cgatctccaaactaccgtaatggtgtgccctatcatgatcaggatatggcaaagcggtttcatcaaaccgatgtcaacggcggaatgagcgccacgcaattacCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGt > 1:39095‑M1/104‑149 (MQ=255) tCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTg > 4:82655/1‑149 (MQ=255) ccATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCGCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTg < 3:266829/147‑1 (MQ=255) cATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGgcg > 1:179200/1‑149 (MQ=255) caaactaccgtaatggtgtgccctatcatgatcaggatatggcaaagcggtttcatcaaaccgatgtcaacggcggaatgagcgccacgcaattacCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGt < 2:39095‑M1/46‑1 (MQ=255) aaactaccgtaatggtgtgccctatcatgatcaggatatggcaaagcggtttcatcaaaccgatgtcaacggcggaatgagcgccacgcaattacCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAgg < 6:184175‑M1/37‑1 (MQ=255) ttCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCAtt < 7:193931/148‑1 (MQ=255) aGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCGGAACCTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTccgc > 4:215832/1‑149 (MQ=255) cTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTg < 1:147272/134‑1 (MQ=255) cTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTg > 2:147272/1‑134 (MQ=255) tCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGCAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGtt > 5:80501/1‑149 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CTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCgccatgcc > 7:251609‑M1/1‑149 (MQ=255) GCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATTCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTgc > 2:53364‑M1/1‑138 (MQ=255) ccTGACGCTGGCTGTCGCTCGGTGGGGCATGTAATTTCTTGGATCTCATTCCTCATTTGACATCTTTTTTATTAAACAGATTTGCCATCTCTTGATCATTATATGGCACAACATTACTGTAGTTTGGATTGTGCCGCCAGGCCATATTc < 7:238243/149‑1 (MQ=255) ccTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTTATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATATGGCACACCATTAGGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTc < 7:38893/149‑1 (MQ=255) ccTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTc < 1:95776/149‑1 (MQ=255) ccTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTc < 3:215832/149‑1 (MQ=255) aCGCTGGGTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCtt < 5:157820/147‑1 (MQ=255) gctggctgTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACATCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCa < 5:89799/149‑1 (MQ=255) gctggctgTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCa > 1:239101/1‑149 (MQ=255) gctggctgTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCa > 7:126887/1‑149 (MQ=255) ctggctgTCGCGCGTTGGGGCATGTAATTGAGTTGCTCTCATTCCGCAGTTGACATCGTTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAg < 7:270070/149‑1 (MQ=255) ggctgTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTa < 8:243356/149‑1 (MQ=255) gctgTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGt < 5:294588/147‑1 (MQ=255) ttGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTTTGCCGCCATGCCATATTATTATCAGTAAGATGCTCACCg > 4:296620/1‑149 (MQ=255) ttGGGGCAGGTAAATGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACAGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACAACATTACGGTAGTTTGGATTGTGCAGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCg > 4:76795/1‑149 (MQ=255) gcagGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGcaca < 5:254169‑M2/80‑1 (MQ=255) gcagGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGcaca > 6:254169‑M2/5‑84 (MQ=255) gcagGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGa > 7:151807‑M2/5‑148 (MQ=255) | CGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGA > NC_000913/129928‑130218 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |