| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,604,993 | G→C | 9.5% | L61F (TTG→TTC) ‡ | hyfD → | hydrogenase 4, membrane subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,604,993 | 0 | G | C | 9.5% | 235.1 / 15.6 | 74 | L61F (TTG→TTC) ‡ | hyfD | hydrogenase 4, membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/36); new base C (4/3); total (34/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.98e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.15e-01 | |||||||||||
TTTTATCGGCGCACTGGTCGTTTCGTTTTCGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATCTGACGGATAAAAATCGCGAAC > NC_000913/2604846‑2605129 | ttttATCGGCGCACTGGTCGTTTCGTTTTCGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTgg > 6:44023/1‑149 (MQ=255) ttATCGGCGCACTGGTCGTTTCGTTTTCGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGAGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATATCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGt < 7:328235/148‑1 (MQ=255) tCGGCGCACTGGTCGTTTCGTTTTCGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAAc < 5:44023/149‑1 (MQ=255) cgcACTGGTCGTTTCGTTTTCGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTgg < 2:58004/149‑1 (MQ=255) cACTGGTCGTTTCGTTTTCGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTgggg < 7:120887/149‑1 (MQ=255) cACTGGTCGTTTCGTGTTCGCCACAACGGCGGGCCGCCGAATGGGGGGTGGTGTGCGCCGCGCTGCCCACGCGGTGCATGTTGGCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGGTGCCGTCACGTTGACGGTGGTCAACGTgggg < 8:14497/149‑1 (MQ=255) ggcgtttcgtttTCGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGAtgt > 5:287920/3‑149 (MQ=255) gTCGTTTCGTTTTCGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGAtgt > 8:27025/1‑149 (MQ=255) gTCGTTTCGTTTTCGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGAtgt > 2:160494/1‑149 (MQ=255) tcgtttcgttTTCGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGAtgtg < 8:263549/149‑1 (MQ=255) ttCGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGAGCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGttt < 4:178250/148‑1 (MQ=255) tCGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGGCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTg < 7:28420/148‑1 (MQ=255) cGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTgg < 4:86454/148‑1 (MQ=255) cGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGc > 3:327992/1‑149 (MQ=255) acaACGTCGGGCCGCCGAATGTGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTgg > 8:106500/1‑149 (MQ=255) acaACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTgg > 7:212265/1‑149 (MQ=255) aaCGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGt > 8:43975/1‑148 (MQ=255) gTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCAtt < 7:229642/149‑1 (MQ=255) gccgccGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGAtgtg < 3:74804/123‑1 (MQ=255) gccgccGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGAtgtg > 4:74804/1‑123 (MQ=255) gccgAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGt < 3:98329/149‑1 (MQ=255) gccgAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGt < 1:15707/149‑1 (MQ=255) cgAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGa < 1:160494/149‑1 (MQ=255) tGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTAc > 7:151637/1‑149 (MQ=255) tGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTAc < 6:287920/149‑1 (MQ=255) ggTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCAGTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGa > 7:61998/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGt < 4:309664/148‑1 (MQ=255) cgccgcGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATATAGTTTCCGTAACGTTTACGTTGTTCAAGTTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGGTGATTCTGttt < 2:216963/148‑1 (MQ=255) gccgcGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGTATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTtgt > 6:36866/1‑149 (MQ=255) gccgcGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTtgt < 7:27025/149‑1 (MQ=255) ccgcGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTtgtg < 4:105849/149‑1 (MQ=255) gcgcTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGAtt < 7:78746/138‑1 (MQ=255) gcgcTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGAtt > 8:78746/1‑138 (MQ=255) gcTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGGGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTgtggtgg < 1:17587/149‑1 (MQ=255) aCCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGtt > 2:165362/1‑149 (MQ=255) aCCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGtt > 6:106370/1‑149 (MQ=255) cACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTtc > 8:261922/1‑149 (MQ=255) aCGCTGGGCTTGTTGTCACTGATCTGCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCTTTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGGTTGTGGTGGTGGTtct < 8:128036/149‑1 (MQ=255) gCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTTATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCg > 6:90720/1‑149 (MQ=255) gCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCg < 5:106370/149‑1 (MQ=255) gCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCg > 1:290780/1‑149 (MQ=255) tgCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGttt > 2:149377/1‑149 (MQ=255) tgCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGt < 7:106500/147‑1 (MQ=255) cATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGc > 2:327963/1‑149 (MQ=255) tgttgtCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGAt < 5:86505/101‑1 (MQ=255) tgttgtCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGAt > 6:86505/1‑101 (MQ=255) 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cgcgTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCCCGATCTACTCCa > 5:107358/1‑149 (MQ=255) cgcgTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTAc < 7:43975/145‑1 (MQ=255) cgcgTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACt < 4:327992/146‑1 (MQ=255) gcgTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGTTCACGATCTACTCCAc > 6:232000/1‑149 (MQ=255) gcgTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTTACGATCTACTCCAc > 4:242919/1‑149 (MQ=255) gTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACgg < 8:61998/149‑1 (MQ=255) tATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCAGGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGtt < 2:290780/148‑1 (MQ=255) tCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATc > 5:109134/1‑149 (MQ=255) aGGCCGATAATGTTGCCGTCACGTTGACGTTTGTCAAGGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCTTTGATCGCGTGATGACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATCt < 2:160213/148‑1 (MQ=255) aGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGGTGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACgg > 1:86325/1‑141 (MQ=255) aGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGGTGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACgg < 2:86325/141‑1 (MQ=255) gCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATCTGAc < 7:58763/149‑1 (MQ=255) gATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATCTGACGGa > 6:153614/1‑149 (MQ=255) ccccACGTTGACCAACGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATcgc < 3:212608/58‑1 (MQ=21) ccccACGTTGACCAACGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATcgc > 4:212608/4‑61 (MQ=21) ccccACGTTGACCAACGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATcgc > 8:19100/4‑61 (MQ=21) ccccACGTTGACCAACGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATcgc < 7:19100/58‑1 (MQ=21) cGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATCTGACGGATAAAAATcgcg < 1:165362/149‑1 (MQ=255) cGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATCTGACGGATAAAAATcgc > 3:34198/1‑148 (MQ=255) tCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATCTGACGGATAAAAATCGCGaa < 1:327963/149‑1 (MQ=255) ccACGTTGACCAACGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGGTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATCTGAc < 4:179994/132‑1 (MQ=255) ccACGTTGACCAACGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGAGTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATCTGAc > 3:179994/2‑133 (MQ=255) cACGTTGACCAACGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATCTGACGGATAAAAATCGCGAac > 6:202524/1‑149 (MQ=255) gttgacgttgGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGAtt > 8:11666/1‑70 (MQ=255) gttgacgttgGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGAtt < 7:11666/70‑1 (MQ=255) | TTTTATCGGCGCACTGGTCGTTTCGTTTTCGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATCTGACGGATAAAAATCGCGAAC > NC_000913/2604846‑2605129 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |