Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,016,800 | A→G | 5.7% | K247K (AAA→AAG) | ygfK → | putative Fe‑S subunit oxidoreductase subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,016,800 | 0 | A | G | 5.7% | 214.1 / 2.9 | 70 | K247K (AAA→AAG) | ygfK | putative Fe‑S subunit oxidoreductase subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/34); new base G (2/2); total (34/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.77e-01 |
GCCACGGATTGCAGGAAAAACGCGAAAGCTTGCAAGCCTTACCCGCTCGCATCCCCACCAGTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACATAGGCTTAAAAGAAGAGTCATTTGATCACGACCTCAAGCTGACGCAAGCACTGGAAATGC > NC_000913/3016652‑3016948 | gCCACGGATTGCAGGAAAAACGCGAAAGCTTGCAAGCCTTACCCGCTCGCATCCCCACCAGTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCTAAGCCATTTGCCACTACATGCTGGAAGaaaaa < 3:163678/149‑1 (MQ=255) ccACGGATTGCAGGAAAAACGCGAAAGCTTGCAAGCCTTACCCGCTCGCATCCCCACCAGTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAg < 2:62272/149‑1 (MQ=255) cACGGATTGCAGGAAAAACGCGAAAGCTTGCAAGCCTTACCCGCTCGCATCCCCACCAGTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAgg > 4:121285/1‑149 (MQ=255) ggAAAAACGCGAAAGCTTGCAAGCCTTACCCGCTCGCATCCCCACCAGTATGGTGCATGCCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCAATTTGCAGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCt > 4:170230/1‑149 (MQ=255) aaCGCGAAAGCTTGCAAGCCTTACCCGCTCGCATCCCCACAAGTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAACTCGAAGCCATTTGCCGCTCCATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCCACACCTTtgt > 5:339488/1‑148 (MQ=255) aaCGCGAAAGCTTGCAAGACTTACGCGCTCGCATCCCCACCAGTATTGTGCATGGCGTCACGCTCTCCACCATGCACGGCTGTCGTCCGCATGAAATCGAAGCGATTTGCCGCTACATGCTGTAAGAAAAATGGCTCAACACCTTtgtg < 7:82629/149‑1 (MQ=255) gcgAAAGCTTGCAAGCCTTACCCGCTCGCATCCCCCCCAGTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAACTCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGaaa < 6:290347/149‑1 (MQ=255) gAAAGCTTGCAAGCCTTACCCGCTCGCATCCCCACCAGTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTc > 2:271486/1‑132 (MQ=255) gAAAGCTTGCAAGCCTTACCCGCTCGCATCCCCACCAGTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTc < 1:271486/132‑1 (MQ=255) aGCTTGCAAGCCTTACCCGCTCGCATCCCCACCAGTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTaa > 2:114790/1‑149 (MQ=255) gCAAGCCTTACCCGCTCGCATCCCCACCAGTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGa > 4:317493/1‑149 (MQ=255) gCAAGCCTTACCCGCTCGCATCCCCACCAGTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGa > 7:223331/1‑149 (MQ=255) cAAGCCTTACCCGCTCGCATCCCCACCAGTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGAc < 7:62743/149‑1 (MQ=255) aCCCGCTCGCATCCCCACCAGTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACt < 4:223679/147‑1 (MQ=255) aCCCGCTCGCATCCCCACCAGTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTg < 2:229644/148‑1 (MQ=255) aCCCGCTCGCATCCCCACCAGTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTg < 7:115516/148‑1 (MQ=255) aCCCGCTCGCATCCCCACCAGTATGGGGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTg < 8:329218/148‑1 (MQ=255) cccGCTCGCATCCCCACCAGTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTggg < 5:166/149‑1 (MQ=255) tCCCCACCAGTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCgt > 2:1729/1‑149 (MQ=255) ccaccaGTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGATCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGtt > 6:330137/1‑149 (MQ=255) caccaGTATGGTGAATGGCGTCAGCCTCTCCACCATGCACGGCTGTACTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTc < 2:271497/149‑1 (MQ=255) aGTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAGGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTAcgcgc > 3:257089/1‑139 (MQ=255) aGTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAGGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTAcgcgc < 4:257089/139‑1 (MQ=255) gTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTgag < 8:223331/149‑1 (MQ=255) tGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATc < 4:96671/149‑1 (MQ=255) ggTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAACAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATcc > 1:53007/1‑149 (MQ=255) gTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTGTGTGAAACTTAACCCGACAGTCCTGGGGTACGCGCGTGTTAGTGAGATCCt > 3:227408/1‑149 (MQ=255) gCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTg > 8:174184/1‑121 (MQ=255) gCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTg < 7:174184/121‑1 (MQ=255) cATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTTCATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCg < 3:170230/148‑1 (MQ=255) gCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGt < 8:123734/148‑1 (MQ=255) cACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCg > 5:260272/1‑149 (MQ=255) cccTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTACCCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGCTCCTCGATGTCTGCGGt > 5:322177/1‑149 (MQ=255) ctctCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGttt < 6:260272/149‑1 (MQ=255) ctctCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGttt > 7:81344/1‑149 (MQ=255) tctcCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAGGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTc > 8:202556/1‑149 (MQ=255) tctcCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTc > 8:106343/1‑149 (MQ=255) tctcCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTc > 6:159522/1‑149 (MQ=255) tcCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTc < 4:3028/147‑1 (MQ=255) tcCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCgg > 5:207694/1‑149 (MQ=255) tcCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCgg > 1:175645/1‑149 (MQ=255) ctccaTGCACGGATGTCCTACGCATGAAATCGAAGCTATTTGCCGCTACATGCTGTAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGt < 7:6484/146‑1 (MQ=255) cacctTGCACGGCTGTCCTCCGCAGGAAAGCGCAGACATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACGTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGGGGTCGGGAGATCCTCGATGTCTGCGGGTTCGGt < 4:94934/148‑1 (MQ=255) caccaTGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCg < 5:330137/146‑1 (MQ=255) caccaTGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGtt < 5:122446/149‑1 (MQ=255) caTGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACa > 8:47904/1‑149 (MQ=255) tGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACa > 1:316845/1‑147 (MQ=255) cACGGCTGTCCGCCGCATGAAATCGAAGCCTTTTGCCGCTACATGCGGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTGTCGGTTACATa < 2:64358/147‑1 (MQ=255) gTCCTCCGCATGAAATCCAAGCAATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTACCCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGAAGTCTGAGGTTTCGGTTACATAGGCTTaa > 2:186538/1‑147 (MQ=255) tcctccGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACATAGGCTTAAaag < 1:1729/149‑1 (MQ=255) cctccGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACATAGGCTTAAaaga < 7:109220/149‑1 (MQ=255) cGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACATAGGCTTAAAagaaga < 3:317493/148‑1 (MQ=255) cATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAATAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCTACCTTACTGTGGTACGCGCGTGGTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGGTTCGGTTACATAGGCTTAAAAGAAGAGTc < 6:339488/149‑1 (MQ=255) aTGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACATAGGCTTAAAAGAAGAGTCa > 8:125467/1‑149 (MQ=255) gAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACATAGGCTTAAAAGAAGAGTCATTTGATCa < 5:298314/149‑1 (MQ=255) gAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGACTGCGGTTTAGGTTAAATAGGCTTAAATGAAGAGTCATTTGAGCa > 4:183932/1‑149 (MQ=255) aaGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACATAGGCTTAAAAGAAGAGTCATTTGATCAc < 5:268219/149‑1 (MQ=255) aTTTGCCGCTACATGCTGGATGAAAAAGGGATCAACACCTTTGTGAAACTTAACACTAGCTTAATGGTGTTCGCGCGTGTTCGTGAGATGCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACATAGTCTTAAAAGAAGAGTCATTTGATCACGAGCt > 4:70629/1‑149 (MQ=255) aTTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTACCCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTGTGCGGTTTCGGTTACATAGGCTTAAAAGAAGAGTCATTTGATCACGACCt > 6:76300/1‑149 (MQ=255) aTTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACATAGGCTTAAAAGAAGAGTCATTTGATCACGACCt > 2:44598/1‑149 (MQ=255) tttGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGt < 4:114222/83‑1 (MQ=255) tttGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGt > 3:114222/1‑83 (MQ=255) tttGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACATAGGCTTAAAAGAAGAGTCATTTGATCACGACCt > 7:166246/1‑148 (MQ=255) ccGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACATAGGCTTAAAAGAAGAGTCATTTGATCACGACCTCAAGc < 6:207694/149‑1 (MQ=255) gCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCAAAACACCTTTGTGAAACATAACCCGACAGTACTGGGGTACGCGCTTGTTCGTGAGATCCTAGATGTCTGCGGTTTCTGTTACATATTCTTAAATCAATATTCATTTTATAACGACCTCAATCt > 8:76782/1‑148 (MQ=255) cTGGAAGAAAAGGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACATAGGCTTAAAAGAAGAGTCATTTGATCACGACCTCAAGCTGACGCAAg < 7:202556/148‑1 (MQ=255) cTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACATAGGCTTAAAAGAAGAGTCATTTGATCACGACCTCAAGCTGACGCAAg < 8:81344/148‑1 (MQ=255) gaagaaAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACATAGGCTTAAAAGAAGAGTCATTTGATCACGACCTCAAGCTGACGCAAGCACt < 8:166246/149‑1 (MQ=255) gaagaaAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACATAGGCTTAAAAGAAGAGTCATTTGATCACGACCTCAAGCTGACGCAAGCACt > 6:143687/1‑149 (MQ=255) agaaAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGtt > 3:216780/1‑92 (MQ=255) agaaAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGtt < 4:216780/92‑1 (MQ=255) aaaaGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACATAGGCTTAAAAGAAGAGTCATTTGATCACGACCTCAAGCTGACGCAAGCACTGGaaa > 3:17424/1‑149 (MQ=255) aaaaGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACATAGGCTTAAAAGAAGAGTCATTTGATCACGACCTCAAGCTGACGCAAGCACTGGaaa > 4:211161/1‑149 (MQ=255) aaaaGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACATAGGCTTAAAAGAAGAGTCATTTGATCACGACCTCAAGCTGACGCAAGCACTGGaaa > 5:11181/1‑149 (MQ=255) aaGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACATAGGCTTAAAAGAAGAGTCATTTGATCACGACCTCAAGCTGACGCAAGCACTGGAAATg > 1:283742/1‑149 (MQ=255) aGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACATAGGCTTAAAAGAAGAGTCATTTGATCACGACCTCAAGCTGACGCAAGCACTGGAAATGc < 1:114790/149‑1 (MQ=255) | GCCACGGATTGCAGGAAAAACGCGAAAGCTTGCAAGCCTTACCCGCTCGCATCCCCACCAGTATGGTGCATGGCGTCACCCTCTCCACCATGCACGGCTGTCCTCCGCATGAAATCGAAGCCATTTGCCGCTACATGCTGGAAGAAAAAGGGCTCAACACCTTTGTGAAACTTAACCCGACCTTACTGGGGTACGCGCGTGTTCGTGAGATCCTCGATGTCTGCGGTTTCGGTTACATAGGCTTAAAAGAAGAGTCATTTGATCACGACCTCAAGCTGACGCAAGCACTGGAAATGC > NC_000913/3016652‑3016948 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |