| Predicted mutation | |||||||
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| JC | NC_000913 | 3,968,508 | Δ12 bp | 10.9% | coding (593‑604/1104 nt) | wecA → | UDP‑GlcNAc:undecaprenylphosphate GlcNAc‑1‑phosphate transferase |
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| ? | NC_000913 | 3968520 = | 97 (1.250) | coding (605/1104 nt) | wecA | UDP‑GlcNAc:undecaprenylphosphate GlcNAc‑1‑phosphate transferase | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
CCATACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATGGCATTGATGGCTTGCTGGGCGGGTTGTCCTGCGTCTCGTTTGCAGCAATCGGTATGATTTTGTGGTTCGACGGGCAAACCAGCCTCGCAATCTGGTGCTTTGCGATGATCGCCGCCATCCTGCCATACATCATGCTTAACCTTGGTATCCTGGGTCGCCGCTACAAAGTCTTTATGGGTGATGCGGGCAGTACGCTGATTGGTTTTACCGTTATCTGGATCCTGCTCGAAACGACCCAGGGCAAAACCCATCCCATCAGCCCGGTTACCGCTTTGTGGATAATCGCCATTCCGCTAATGGATATGGTGGCGATTATGTACCGTCGCCTGCGTAAAGGCATGAGCCCATTCTCTCCTGACCGTCAGCATATTCACCATTTGATCATGCGTGCCGGGTTTACTTCCCGTCAG > NC_000913/3968220‑3968794 | ccaTACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATGGCATTGATGGCTTGCTGGGCGGGTTGTCCTGCGTCTCGTTTGCAGCAATCGGTATGATTTTGTGGTTCGACGGGCAAACCAGCCTCGCAATCTGGTGCTTTGCGATGATCGCCGCCATCCTGcc < 1:321675/289‑1 (MQ=255) 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tGCttaaccttggtatcctgggtcgccgctacaaagtctttatgggtgatgcgggcagtacgctgattggttttaccgttatctggatcctgctcgaaacgacccagggcaaaacccatcccatcagcccggttaccgctttgtggataatcgccattccgctaatggatatggtggcgattatgtaccgtcgcctgcgtaaaggcatgagcccattctctcctgaccgtcagcatattcaccatttgatcatgcgtgccgggtttacttcccgtcaggcgtttgt > 1:529574‑M1/1‑3 (MQ=255) tGCCATACATCATGCTTAACCTTGGTATCCTGGGTCGCCGCTACAAAGTCTTTATGGGTGATGCGGGCAGTACGCTGATTGGTTTTACCGTTATCTGGATCCTGCTCGAAACGACCCAGGGCAAAACCCATCCCATCAGCCCGGTTACCGCTTTGTGGATAATCGCCATTCCGCTAATGGATATGGTGGCGATTATGTACCGTCGCCTGCGTAAAGGCATGAGCCCATTCTCTCCTGACCGTCAGCATATTCACCATTTGATCATGCGTGCCGGGTTTACTTCCCGTCa < 2:614757/289‑1 (MQ=255) ccATACATCATGCTTAACCTTGGTATCCTGGGTCGCCGCTACAAAGTCTTTATGGGTGATGCGGGCAGTACGCTGATTGGTTTTACCGTTATCTGGATCCTGCTCGAAACGACCCAGGGCAAAACCCATCCCATCAGCCCGGTTACCGCTTTGTGGATAATCGCCATTCCGCTAATGGATATGGTGGCGATTATGTACCGTCGCCTGCGTAAAGGCATGAGCCCATTCTCTCCTGACCGTCAGCATATTCACCATTTGATCATGCGTGCCGGGTTTACTTCCCGTCAg > 1:189948/1‑288 (MQ=255) | CCATACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATGGCATTGATGGCTTGCTGGGCGGGTTGTCCTGCGTCTCGTTTGCAGCAATCGGTATGATTTTGTGGTTCGACGGGCAAACCAGCCTCGCAATCTGGTGCTTTGCGATGATCGCCGCCATCCTGCCATACATCATGCTTAACCTTGGTATCCTGGGTCGCCGCTACAAAGTCTTTATGGGTGATGCGGGCAGTACGCTGATTGGTTTTACCGTTATCTGGATCCTGCTCGAAACGACCCAGGGCAAAACCCATCCCATCAGCCCGGTTACCGCTTTGTGGATAATCGCCATTCCGCTAATGGATATGGTGGCGATTATGTACCGTCGCCTGCGTAAAGGCATGAGCCCATTCTCTCCTGACCGTCAGCATATTCACCATTTGATCATGCGTGCCGGGTTTACTTCCCGTCAG > NC_000913/3968220‑3968794 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |