| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 631552 = | 62 (1.240) | 4 (0.080) | 4/478 | NT | 6.5% | coding (1659/2106 nt) | cstA | carbon starvation protein involved in peptide utilization; APC peptide transporter family protein |
| ? | NC_000913 | 631690 = | 54 (1.110) | coding (1797/2106 nt) | cstA | carbon starvation protein involved in peptide utilization; APC peptide transporter family protein | |||||
CACGGCGCGCTGGGCGGCATGATGGATGTGGCGTTCTGGTATCACTTCGCCATTTTGTTTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTGGCTGCTGATTTGTACCCTGACCGCAGGCTGGCAGAAAGCGTTTAGCCCGGATGCGAAAGTCGGCTTCCTGGCCATTGCTAATAAGTTCCAGGCAATGATCGACAGCGGCAATATTCCGTCGCAGTATACTGAGTCACAGCTGGCGCAACTGGTGTTCAACAACCGTCTGGATGCCGGGTTAACC > NC_000913/631268‑631840 | cACGGCGCGCTGGGCGGCATGATGGATGTGGCGTTCTGGTATCACTTCGCCATTTTGTTTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCAATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGCCGGCCTTAACACTCTGTGGCCGCTGTTGGGTATTGcgc > 2:118819/1‑287 (MQ=255) catcagcgcatgtcggcATGATTGATGTTGCGTTCTTGTATCATTTCGCCTTTTTGTTTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCAGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGCCTCCTAGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGGACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGTTCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGc < 2:50285/273‑1 (MQ=255) gcgcgcTGGGCGGCATGATGGATGTGGCGTTCTGGTATCACTTCGCCATTTTGTTTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTACCCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCCGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCa > 2:370304/1‑289 (MQ=255) tggggCGTTCTGGTATGACTTCGCCATTTTGTTTGAGGCACTGTTTATTCTGACGGCGTTGGATGCGGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTg < 2:484090/286‑1 (MQ=255) gCGTTCTGGTATCACTTCGCCATTTTGTTTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGAt > 1:259622/1‑287 (MQ=255) cGTTCTGGTATCACTTCGCCATTTTGTTTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGc > 2:59751/1‑288 (MQ=255) aggcaggTATCCCTTAGGCGTGTTGTGTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCGGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGct < 2:207465/283‑1 (MQ=255) cTTCGCCATTTTGTTTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTg > 1:337877/1‑271 (MQ=255) cTTCGCCATTTTGTTTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTg < 2:337877/271‑1 (MQ=255) cTTCGCCATTTTGTTTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCgtggtg < 1:118819/289‑1 (MQ=255) cGCCATTTTGTTTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCg < 1:259269/281‑1 (MQ=255) ccATTTTGTTTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCCTTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCgtggctg > 1:207465/1‑282 (MQ=255) tgtttgAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGATGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCAGCTAACCTGCCGGCAAGAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCGACTTCCTCCATCACGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGTCATTAACACTCTCTGGCCGCTGTTTGGTATCGCCAACCTGACTATGCCATGGATGGTGCAGATGTCCTGTTCCGCTGTTTTGGTCAAGag > 2:356289/1‑288 (MQ=255) 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atctttcaatgccgcaagtgccgtcttaatcgagaacagtgccagaaccaccacgaccaccataaagaagatggttaacccggcatccagacggttgttgaacaccagttgcgccagctgtgactcagtatactgcgacggaatattgccgctgtcgatcattgcctggaacttattagcaatggccaggaagccgactttcgcatccgggctaaacgctttcTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCGGATGCCCTGTGCCGGGGTGTTGTTCAAGATGTAACg < 2:23389‑M1/66‑1 (MQ=255) tGTTTATTATGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTCGTTTTGACAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGGGCCGTGGGGTCGTTCAAGATGAAACGTCAACg > 1:467531/1‑289 (MQ=255) gACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGTCATTGCCAACCAGCTGCTGGCAGGGATGGCGCCGCTGCTCTGGGCCGGTGTTTTGTTCACGCTGAAACGCGAACGTTACGCCTgg > 2:105336/1‑289 (MQ=255) gACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTgttgtt < 2:77379/261‑1 (MQ=255) gACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTgttgtt > 1:77379/1‑261 (MQ=255) gACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGt < 2:83562/280‑1 (MQ=255) gACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGt > 1:83562/1‑280 (MQ=255) cggcggTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGt > 1:157772/1‑289 (MQ=255) cgTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACgg > 1:41256/1‑286 (MQ=255) 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1:342796/187‑1 (MQ=255) cGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTGgctgct > 2:342796/1‑187 (MQ=255) tGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTGGCTGCTGATTTGTACCCTGACCGCAGGCTGGCAGAAAGCGTTTAGCCCGGATGCGAAAGTCGGCTTCCTGGCCATTGCTAATAAGTTCCAGGCAATGATCGACAGCGGc > 2:413785/1‑288 (MQ=255) tGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTGGCTGCTGATTTGTACCCTGACCGCAGGCTGGCAGAAAGCGTTTAGCCCGGATGCGAAAGTCGGCTTCCTGGCCATTGCTAATAAGTTCCAGGCAATGATCGACAGCGGCa > 1:342349/1‑289 (MQ=255) gggCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTGGCTGCTGATTTGTACCCTGACCGCAGGCTGGCAGAAAGCGTTTAGCCTGGTTGGGAAAGTCGGCTTCCTGGCCATTGCTAATAAGTTCCAGGCAATGTTCGACTGCggacac > 2:485880/1‑285 (MQ=255) gggCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTGGCTGCTGATTTGTACCCTGACCGCAGGCTGGCAGAAAGCGTTTAGCCCGGATGCGAAAGTCGGCTTCCTGGCCATTGCTAATAAGTTCCAGGCAATGATCGACAGCGGCAat > 2:120850/1‑289 (MQ=255) cTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTGGCTGCTGATTTGTACCCTGACCGCAGGCTGGCAGAAAGCGTTTAGCCCGGATGCGAAAGTCGGCTTCCTGGCCATTGCTAATAAGTTCCAGGCAATGATCGACAGCGGCAATATTCCg < 1:343318/289‑1 (MQ=255) tcctccATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTGGCTGCTGATTTGTACCCTGACCGCAGGCTGGCAGAAAGCGTTTAGCCCGGATGCGAAAGTCGGCTTCCTGGCCATTGCTAATAAGTTCCAGGCAATGATCGACAGCGGCAATATTCCGTc < 1:120850/289‑1 (MQ=255) ccctccACCAGGGCGTGGTGGGTCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTGGCTGCTGATTTGTACCCTGACCGCAGGCTGGCAGAAAGCGTTTAGCCCGGATGCGAAAGTCGGCTTCCTGGCCATTGCTAATAAGTTCCAGGCAATGATCGACAGCGGCAATATTCCGTc < 2:41256/288‑1 (MQ=255) tgcctggaacttattagcaatggccaggaagccgactttcgcatccgggctaaacgctttcTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTGgctgct < 1:315134‑M1/111‑1 (MQ=255) tgcctggaacttattagcaatggccaggaagccgactttcgcatccgggctaaacgctttcTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTGgctgct > 2:315134‑M1/62‑172 (MQ=255) tccATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTGGCTGCTGATTTGTACCCTGACCGCAGGCTGGCAGAAAGCGTTTAGCCCGGATGCGAAAGTCGGCTTCCTGGCCATTGCTAATAAGTTCCAGGCAATGATCGACAGCGGCAATATTCCGTCGCa < 2:61590/289‑1 (MQ=255) tccATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTGGCTGCTGATTTGTACCCTGACCGCAGGCTGGCAGAAAGCGTTTAGCCCGGATGCGAAAGTCGGCTTCCTGGCCATTGCTAATAAGTTCCAGGCAATGATCGACAGCGGCAATATTCCGTCGCa < 1:105336/289‑1 (MQ=255) cAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTGGCTGCTGATTTGTACCCTGACCGCAGGCTGGCAGAAAGCGTTTAGCCCGGATGCGAAAGTCGGCTTCCTGGCCATTGCTAATAAGTTCCAGGCAATGATCGACAGCGGCAATATTCCGTCGCAGtata < 1:413785/289‑1 (MQ=255) ggCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTGGCTGCTGATTTGTACCCTGACCGCAGGCTGGCAGAAAGCGTTTAGCCCGGATGCGAAAGTCGGCTTCCTGGCCATTGCTAATCAGTTCCAGGCAAGTATCGCCCGCGGCAATATTCCGTCGCAGTATCCt > 2:473668/1‑288 (MQ=255) gTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTTGCTGCTGATTGGTACCCTGACCGCAGGCTGGCAGAAAGCGTTTAGCCCGGATGCGAAAGTCGGCTTCCTGGCCATTGCTAATAAGTTCCAGGCAATGATCGACAGCGGCAATATTCCGTCGCAGGATACCGAGTca > 2:85374/1‑288 (MQ=255) 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TGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTGGCTGCTGATTTGTACCCTGACCGCAGGCTGGCAGAAAGCGTTTAGCCCGGATGCGAAAGTCGGCTTCCTGGCCa > 1:210386‑M1/1‑179 (MQ=255) TGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTGGCTGCTGATTTGTACCCTGACCGCAGGCTGGCAGAAAGCGTTTAGCCCGGATGCGAAAGTCGGCTTCCTGGCCa < 2:210386‑M1/179‑1 (MQ=255) TGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTGGCTGCTGATTTGTACCCTGACCGCAGGCTGGCAGAAAGCGTTTAGCCCGGATGCGAAAGTCGGCTTCCTGGCCATTGCTAATAAGTTCCAGGCAATGATCGACAGCGGCAATATTCCGTCGCAGTATACTGAGTCACAGCTGGCGCAACTGGTGTTCAACAACCGTCTGGATGCCGGGTTAAcc < 2:35732‑M1/289‑1 (MQ=255) TGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTGGCTGCTGATTTGTACCCTGACCGCAGGCTGGCAGAAAGCGTTTAGCCCGGATGCGAAAGTCGGCTTCCTGGCCATTGCTAATAAGTTCCAGGCAATGATCGACAGCGGCAATATTCCGTCGCAGTATACTGAGTCACAGCTGGCGCAACTGGTGTTCAACAACCGTCTGGATGCCGGGTTAAc < 2:479368‑M1/288‑1 (MQ=255) | CACGGCGCGCTGGGCGGCATGATGGATGTGGCGTTCTGGTATCACTTCGCCATTTTGTTTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTGGCTGCTGATTTGTACCCTGACCGCAGGCTGGCAGAAAGCGTTTAGCCCGGATGCGAAAGTCGGCTTCCTGGCCATTGCTAATAAGTTCCAGGCAATGATCGACAGCGGCAATATTCCGTCGCAGTATACTGAGTCACAGCTGGCGCAACTGGTGTTCAACAACCGTCTGGATGCCGGGTTAACC > NC_000913/631268‑631840 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |