| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 93647 = | 66 (1.320) | 4 (0.080) | 4/474 | NT | 6.0% | coding (482/1488 nt) | murE | UDP‑N‑acetylmuramoyl‑L‑alanyl‑D‑glutamate:meso‑ diaminopimelate ligase |
| ? | NC_000913 | 93928 = | 62 (1.280) | coding (763/1488 nt) | murE | UDP‑N‑acetylmuramoyl‑L‑alanyl‑D‑glutamate:meso‑ diaminopimelate ligase | |||||
TCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTGGGCCGCCGCTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGTATCAATGGAAGATCATATTAATCCGAACTGTCACGGACGCTGGTTGAAAGCGACCGAAGTGAACTATCACGACAGCGGTGCGACGATTCGCTTTAGCTCAAGTTGGGGCGATGGCGAAATTGAAAGCCATCTGATGGGCGCTTTTAACGTCAGCAACCTGCTGCTCGCGCTGGCGACACTGTTGGCACTCGGCTATCCACTGGCTGATCTGCTGAAAACCGCCGCGCGTCTGCAACCGGTTTGCGGACGTATG > NC_000913/93653‑94194 | TCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTGGGCCGCCGCTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGt < 1:267353‑M1/289‑1 (MQ=255) cGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTGGGCCGCCGCTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCg < 2:130150/286‑1 (MQ=255) gATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTGGGCCGCCGCTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGTa > 1:477834/1‑288 (MQ=255) aTGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTGGGCCGCCGCTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGTAt < 2:319569/288‑1 (MQ=255) cgggaTGAGCTGGGGGGGCTGGTGGATCAGGGCGGGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTGGGCCGCCGCTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGTATCAATgg < 2:240289/285‑1 (MQ=255) cagcggcggcccacttcatcgtcggcgttaataatcgcctgaccgcaatgatgctcagaataaagcagccatttcgcggcttcgtagtgttccatatcaccatgataatcaaggtgatcgcggcttaagttggtaaagaccgacgccgcaaatttcaatgccgccacacggtgctgtaccagcccgtgggaggaaacttccattgcgcaaaacgtcgcgccctgatccaccagccccgccagcccatgctgaacatcgactgccgGACCCGGTTGCGGTACCAATGGaa > 2:317492‑M2/266‑289 (MQ=255) gggtggATCAGGGCGCGACGTTGTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTGGGCCGCCGCTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGTATCAATGGAAGATCATATTAATCCGaa < 1:410497/288‑1 (MQ=255) 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aGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTGGGCCGCCGCTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGTATCAATGGAAGATCATATTAATCCGAACTGTCACGGACGCTGGTTGAAAGCGACCGAAGTGAACTATCACGACAGCGGTGCGACGATTCGCTTTAGCTCAAGTTGGGGCGATGGCGAAATTGAAAGCCATCTGATGGGCGCTTTTAACGTCAGCAACCTGCTGCTCGCGCTGGCGac > 2:46374/1‑288 (MQ=255) ccGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTGGGCCGCCGCTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGTATCAATGGAAGATCATATTAATCCGAACTGTCACGGACGCTGGTTGAAAGCGACCGAAGTGAACTATCACGACAGCGGTGCGACGATTCGCTTTAGCTCAAGTTGGGGCCATGGCGAAATTGAAAGCCTTCTGATGGGCGCTTTTAACGTCAGCAACCTGCTGCTCGCGCTGGCGac > 2:352755/1‑286 (MQ=255) aTGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTGGGCCGCCGCTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGTATCAATGGAAGATCATATTAATCCGAACTGTCACGGACGCTGGTTGAAAGCGACCGAAGTGAACTATCACGACAGCGGTGCGACGATTCGCTTTAGCTCAAGTTGGGGCGATGGCGAAATTGAAAGCCATCTGATGGGCGCTTTTAACGTCAGCAACCTGCTGCTCGCGCTGGCGACACTGTTGGCa < 1:39264/289‑1 (MQ=255) aGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTGGGCCGCCGCTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGTATCAATGGAAGATCATATTAATCCGAACTGTCACGGACGCTGGTTGAAAGCGACCGAAGTGAACTATCACGACAGCGGTGCGACGATTCGCTTTAGCTCAAGTTGGGGCGATGGCGAAATTGAAAGCCATCTGATGGGCGCTTTTAACGTCAGCAACCTGCTGCCCGCGCTGGCGAACCTGTTGGCACCCGGCTAACCACTg > 2:458725/1‑287 (MQ=255) catTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTGGGCCGCCGCTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGTATCAATGGAAGATCATATTAATCCGAACTGTCACGGACGCTGGTTGAAAGCGACCGAAGTGAACTATCACGACAGCGGTGCGACGATTCGCTTTAGCTCAAGTTGGGGCGATGGCGAATTTGAAAGCCATCTGATGGGCGCTTTTAACGTCAGCAACCTGCTGCTCGCGCTGGCTACACTGTCGGCACTCGGCTACCCACTGGCTGa > 2:124349/1‑287 (MQ=255) aGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTGGGCCGCCGCTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGTATCAATGGAAGATCATATTAATCCGAACTGTCACGGACGCTGGTTGAAAGCGACCGAAGTGAACTATCACGACAGCGGTGCGACGATTCGCTTTAGCTCAAGTTGGGGCGATGGCGAAATTGAAAGCCATCTGATGGGCGCTTTTAACGTCAGCAACCTGCTGCTCGCGCTGGCGACACTGTTGGCACTCGGCTATCCACTGGCTGATCTGCTGaaaa > 2:178158/1‑288 (MQ=255) tattaACGCCGACGATGAAGTGGGCCGCCGCTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGTATCAATGGAAGATCATATTAATCCGAACTGTCACGGACGCTGGTTGAAAGCGACCGAAGTGAACTATCACGACAGCGGTGCGACGATTCGCTTTAGCTCAAGTTGGGGCGATGGCGAAATTGAAAGCCATCTGATGGGCGCTTTTAACGTCAGCAACCTGCTGCTCGCGCTGGCGACACTGTTGGCACTCGGCTATCCACTGGCTGATCTGCTGAAAACCGCcgcg < 1:200584/289‑1 (MQ=255) attaACGCCGACGATGAAGTGGGCCGCCGCTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGTATCAATGGAAGATCATATTAATCCGAACTGTCACGGACGCTGGTTGAAAGCGACCGAAGTGAACTATCACGACAGCGGTGCGACGATTCGCTTTAGCTCAAGTTGGGGCGATGGCGAAATTGAAAGCCATCTGATGGGCGCTTTTAACGTCAGCAACCTGCTGCTCGCGCTGGCGACACTGTTGGCACTCGGCt > 2:111933/1‑256 (MQ=255) attaACGCCGACGATGAAGTGGGCCGCCGCTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGTATCAATGGAAGATCATATTAATCCGAACTGTCACGGACGCTGGTTGAAAGCGACCGAAGTGAACTATCACGACAGCGGTGCGACGATTCGCTTTAGCTCAAGTTGGGGCGATGGCGAAATTGAAAGCCATCTGATGGGCGCTTTTAACGTCAGCAACCTGCTGCTCGCGCTGGCGACACTGTTGGCACTCGGCt < 1:111933/256‑1 (MQ=255) 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ggCCGCCGCTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGTATCAATGGAAGATCATATTAATCCGAACTGTCACGGACGCTGGTTGAAAGCGACCGAAGTGAACTATCACGACAGCGGTGCGACGATTCGCTTTAGCTCAAGTTGGGGCGATGGCGAAATTGAAAGCCATCTGATGGGCGCTTTTAACGTCAGCAACCTGCTGCTCGCGCTGGCGac < 2:450627/218‑1 (MQ=255) ggCCGCCGCTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGTATCAATGGAAGATCATATTAATCCGAACTGTCACGGACGCTGGTTGAAAGCGACCGAAGTGAACTATCACGACAGCGGTGCGACGATTCGCTTTAGCTCAAGTTGGGGCGATGGCGAAATTGAAAGCCATCTGATGGGCGCTTTTAACGTCAGCAACCTGCTGCTCGCGCTGGCGac > 1:450627/1‑218 (MQ=255) gccgccGCTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGTATCAATGGAAGATCATATTAATCCGAACTGTCACGGACGCTGGTTGAAAGCGACCGAAGTGAACTATCACGACAGCGGTGCGACGATTCGCTTTAGCTCAAGTTGGGGCGATGGCGAAATTGAAAGCCATCTGATGGGCGCTTTTAACGTCAGCAACCTGCTGCTCGCGCTGGCGACACTGTTGGCACTCGGCTATCCACTGGCTGATCTGCTGAAAACCGCCGCGCGTCTGCAACCGGTTTGCGGACg > 1:379133/1‑289 (MQ=255) ccgcTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGTATCAATGGAAGATCATATTAATCCGAACTGTCACGGACGCTGGTTGAAAGCGACCGAAGTGAACTATCACGACAGCGGTGCGACGATTCGCTTTAGCTCAAGTTGGGGCGATGGCGAAATTGAAAGCCATCTGATGGGCGCTTTTAACGTCAGCAACCTGCTGCTCGCGCTGGCGACACTGTTGGCACTCGGCTATCCACTGGCTGATCTGCTGAAAACCGCCGCGCGTCTGCAACCGGTTTGCGGACGTATg > 2:167199/1‑289 (MQ=255) ccgcTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGTATCAATGGAAGATCATATTAATCCGAACTGTCACGGACGCTGGTTGAAAGCGACCGAAGTGAACTATCACGACAGCGGTGCGACGATTCGCTTTAGCTCAAGTTGGGGCGATGGCGAAATTGAAAGCCATCTGATGGGCGCTTTTAACGTCAGCAACCTGCTGCTCGCGCTGGCGACACTGTTGGCACTCGGCTATCCACTGGCTGATCTGCTGAAAACCGCCGCGCGTCTGCAACCGGTTTGCGGACGTATg < 1:167199/289‑1 (MQ=255) cgcTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGTATCAATGGAAGATCATATTAATCCGAACTGTCACGGACGCTGGTTGAAAGCGACCGAAGTGAACTATCACGACAGCGGTGCGACGATTCGCTTTAGCTCAAGTTGGGGCGATGGCGAAATTGAAAGCCATCTGATGGGCGCTTTTAACGTCAGCAACCTGCTGCTCGCGCTGGCGACACTGTTGGCACTCGGCTATCCACTGGCTGATCTGCTGAAAACCGCCGCGCGTCTGCAACCGGTTTGCGGACGTATg < 1:46374/288‑1 (MQ=255) cgcCGGCTGGCAAAACGGCCTGACGCGGTTGCGGTATCAATGGAAGATCATAGTAAACCGAGCTGTCACGGACGCTGGTTGAAAGCGACCGAAGTGAACTATCACGACAGCGGTGCGACGATTCGCTTTAGCTCAAGTTTGGGCGATGGCGAAATTGAAGGCCATCTGATGGGCGCTTTTAACGTCAGCAACCTGCTGCTCGCGCTGGCGACACTGTTGGCACTCGGCTATCCACTGGCTGATCTGCTGAAAACCGCCGCGCGTCTGCAACCGGTTTGCGGACGTATg < 2:270612/288‑1 (MQ=255) | TCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTGGGCCGCCGCTGGCTGGCAAAACTGCCGGACGCGGTTGCGGTATCAATGGAAGATCATATTAATCCGAACTGTCACGGACGCTGGTTGAAAGCGACCGAAGTGAACTATCACGACAGCGGTGCGACGATTCGCTTTAGCTCAAGTTGGGGCGATGGCGAAATTGAAAGCCATCTGATGGGCGCTTTTAACGTCAGCAACCTGCTGCTCGCGCTGGCGACACTGTTGGCACTCGGCTATCCACTGGCTGATCTGCTGAAAACCGCCGCGCGTCTGCAACCGGTTTGCGGACGTATG > NC_000913/93653‑94194 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |