| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3498081 | 90 (0.930) | 5 (0.050) | 5/504 | NT | 5.3% | coding (254/1374 nt) | cysG | fused siroheme synthase 1,3‑dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase |
| ? | NC_000913 | = 3498086 | 91 (0.970) | coding (259/1374 nt) | cysG | fused siroheme synthase 1,3‑dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
CTGCCGGTTAATTACTAAGGGGTTTTTACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGCATCTTCTGTAACGTGGTCGATGCGCCGAAAGCCGCCAGCTTTATTATGCCGTCGATTATTGACCGCTCACCGCTCATGGTAGCGGTCTCCTCTGGCGGCACCTCTCCGGTTCTGGCACGCCTGTTGCGCGAAAAACTTGAATCACTGCTGCCGTTACATCTGGGCCAGGTAGCGAAATACGCCGGGCAATTACGCGGGCGAGTGAAACAACAGTTCGCCACGATGGGTGAGCGTCGCCGTTTCTGGGAG > NC_000913/3497799‑3498367 | cTGCCGGTTAATTACTAAGGGGTTTTTACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTTAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACACTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATTATGACGCGCTTAAcc > 1:138821/1‑288 (MQ=255)cTGCCGGTTAATTACTAAGGGGTTTTTACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAAcc > 2:577852/1‑288 (MQ=255) aGGGGTTTTTACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGcc > 1:868703/1‑288 (MQ=255) aGGGGTTTTTACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGcc > 2:36139/1‑288 (MQ=255) gggTTTTTACGTGGGTCAGTTGCTGGTATGTTGCCAATTACGCGAGAGGGAGTGTGTGATTGTGCGCGGTGGTGATGTCGGTGAACGGAAAGCAAGGTGGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGGTGAACAGTGAATGCATTAGCGATTATTCCACAGTTCACCGCATGGGAAGATGCAGGCATGTTATGCATCGTCGAAGGGCCAGTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCGGGCTGGCGATTGCAGCGACAGATGATGACGCGCTTAACCagcgcgtcatcatccgtcg > 2:353025‑M2/1‑269 (MQ=255) tttttACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGaa > 1:142374/1‑289 (MQ=255) ggATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGGCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGc < 1:516170/289‑1 (MQ=255) gATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGTTTGCAGCGACGGGTGATGACGCCCTTACCCCGCGCGGCAGCGAAGCCGCTgccgaccgtggc > 2:594869/1‑277 (MQ=255) gATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGc < 2:532531/288‑1 (MQ=255) gATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGCa > 1:130058/1‑289 (MQ=255) tgaTTTGCCTATATTTGGCCAATTACGCGTTCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGGGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGCAt < 1:179664/286‑1 (MQ=255) tCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTTTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGCAt < 2:632777/288‑1 (MQ=255) tCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGCAt < 2:540529/288‑1 (MQ=255) tatTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCagcgcgtcatcatccgtcgctgcaatccccagcccgcagggttcga < 1:207889‑M2/289‑47 (MQ=255) tGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGCATCTTCTGTAACGTGGTCg > 1:722670/1‑289 (MQ=255) gCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGCATCTTCTGTAACGTGGTCGa > 2:472663/1‑289 (MQ=255) aTTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGTGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGCATCTTCTGTAACGTGGTCGATgc > 1:862437/1‑288 (MQ=255) tCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGc < 2:389963/256‑1 (MQ=255) tCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGc > 1:389963/1‑256 (MQ=255) gcgACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGCATCTTCTGTAACGTGGTCGATGCGCCGAAAgccgc < 2:142374/289‑1 (MQ=255) cTGTCTGATTGGCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGGT‑GGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGCATCTTCTGTAACGTGGTCGATGCGCCGAAAGCCGCCAg < 1:554014/288‑1 (MQ=255) tgtggTTTTCGGGGGGGGTGATGTCTCGGAACGCAAAGTAAGGTTGCGGTTGAGAGG‑AGGCGGTGGCTTAAGGGTGAATGCATTGGCGGTTATTCCACACTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAGCCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCagcgcgtcatcatccgtcgctgcaatcgccagccagcaggtgtcgagaaggctttcatcaaatggcccttcgac > 2:281386‑M2/3‑215 (MQ=255) ttGTCGGCGGTGGTGAGGTCGAGGAACGCAAAGCAAGTTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGGGAATTCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCTTCGTCGAAGGGCCATTGGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCagcgcgtcatcatccgtcgctgcaatcgccagccagcaggtgtcgagaaggctttcatcaaatggcccttcgacgagg > 2:207889‑M2/1‑210 (MQ=255) tGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGTGCCATTTGATGAAAGCCATCTCGACACCTACTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGCATCTTCTGTAACGTGGTCGATGCGCCGAAAGCCGCCAGCTTTATTATg < 1:728925/289‑1 (MQ=255) cggcggTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGCATCTTCTGTAACGTGGTCGATGCGCCGAAAGCCGCCAGCTTTATTATGcc < 1:472663/288‑1 (MQ=255) 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gcggTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGCATCTTCTGTAACGTGGTCGATGCGCCGAAAGCCGCCAGCTTTATTATGCCGt < 2:273823/288‑1 (MQ=255) gcggGGGGGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑TGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGCATCTTCTGTAACGTGGTCGATGCGCCGAAAGCCGCCAGCTTTATTATGCCGt < 2:62729/288‑1 (MQ=255) gAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTT‑AGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGTGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGCATCTTCTGTAACGTGGTCGATGCGCCGAAAGCCGCCAGCTTTATTATGCCGTCGATTATTGaccgctca < 2:862437/288‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |