New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4280996 = | 131 (1.150) | 7 (0.060) | 6/500 | 8.7 | 4.9% | coding (1017/1650 nt) | yjcE | putative cation/proton antiporter |
? | NC_000913 | 4281529 = | 149 (1.370) | coding (1550/1650 nt) | yjcE | putative cation/proton antiporter | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
ACCATCACCCGCTCCGGTGTGATGCGCCGTG‑CGCCGCTGGCAATGCGCCTGCGTGCAAACAGCACCTGGGCGATGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGAGTTTGGTTCGTGGACCACACGAGAAATCCTGATCGCGTCTTTCGCCGGGGTGCGTGGGGCGATCACTCTGGCCGGTGTGCTCTCTATCCCGCTGCTCTTGCCGGATGGTAACGTCTTCCCGGCGCGCTATGAGCTGGTGTTCCTGGCGGCTGGCGTCATTCTCTTCTCGCTGTTTGTCGGCGTGGTGATGTTGCCTATTCTGCTACAACACATTGAAGTCGCGGATCATTCGCA > NC_000913/4280736‑4281268 | aCCGTCACCCCGTCCGGGTTGATG‑GCCCTGTCGCCGCTGGCAATGCGCCTGCGTGCAAACAGCACCTGGGCGATGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCg < 2:246525/275‑1 (MQ=255) gCTCCGGTGTGATGCGCCGTG‑CGCCGCTGGCAATGCGCCTGCGTGCAAACAGCACCTGGGCGATGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAACTCGACCCTAACGTCGCAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGCAGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTgcag > 2:1052641/1‑275 (MQ=255) tCCGGTGTGATGCGCCGTG‑CGCCGCTGGCAATGCGCCTGCGTGCAAACAGCACCTGGGCGATGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGCGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGCTGAAAAAGTTACGAAACCGCTCCCTgccgaa > 2:86522/1‑270 (MQ=255) gtgATGCGCCGTG‑CGCCGCTGGCAATGCGCCTGCGTGCAAACAGCACCTGGGCGATGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGc > 1:143317/1‑274 (MQ=255) ggtgcgcggtg‑cgcccGTGGCAAGGCGCCGGCGTCCAAACAGCACCTGGGCGATGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGa < 2:329257/273‑1 (MQ=255) aTGCGCCGTG‑CGCCGCTGGCAATGCGCCTGCGTGCAAACAGCACCTGGGCGATGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGAt > 1:71861/1‑275 (MQ=255) tgcgccgtg‑cgccgCTGGCAATGCGCCTGCGTGCAAACAGCACCTGGGCGATGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATg > 2:846122/1‑275 (MQ=255) cgccgtg‑cgccgCTGGCAATGCGCCTGCGTGCAAACAGCACCTGGGCGATGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGCAGAAGCCGATgg > 1:1032573/1‑274 (MQ=255) ccgtg‑cgccgCTGGAAATGCGCCTGGGTGCAAACAGCAGCTGGGCGATGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGAGt < 2:803997/275‑1 (MQ=255) cgtg‑cgccgCTGGCAATGCGCCTGCGTGCAAACAGCACCTGGGCGATGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGAGt > 1:342875/1‑274 (MQ=255) cgtg‑cgccgCTGGCAATGCGCCTGCGTGCAAACAGCACCTGGGCGATGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTAAGCAACCGCTTCATGAAGAAGAAGc > 1:725417/1‑265 (MQ=255) gtg‑cgccgCTGGCAATGCGCCTGCGTGCAAACAGCACCTGGGCGATGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGAGttt < 1:1043163/275‑1 (MQ=255) gtg‑cgccgCTGGCAATGCGCCTGCGTGCAAACAGCACCTGGGCGATGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGAGttt < 1:846123/275‑1 (MQ=255) tg‑cgccgCTGGCAATGCGCCTGCGTGCAAACAGCACCTGGGCGATGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGACGAAGAAGCCGAGGGCGttt > 2:937036/1‑274 (MQ=255) tg‑cgccgCTGGCAATGCGCCTGCGTGCAAACAGCACCTGGGCGATGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGAGttt > 2:506386/1‑274 (MQ=255) tg‑cgccgCTGGAAATGCGCCTTCGTGCAAACAGAACCTGGGCGATGCTGGAATTTGTCTTTAACGGTATGTTGTTCGTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGGCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCTGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGAGTTTg < 1:35321/275‑1 (MQ=255) cgccgcTCGTAAAGCGCCTGCGTGCAAACAGCACCTGGGGGATGGTGGAATGTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTATGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGGGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGAt < 2:725417/265‑1 (MQ=255) cgcTGGCAATGGGCCGGTGTGCAAACAGACACTGGGTGTGGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGAAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGAGTTTGGTTCg < 2:766063/275‑1 (MQ=255) gcTGGCAATGCGCTGTCGTGCAAACAGAACCGGGGGGAGGCTGGAATTTTTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCGGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGAGGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTGCCTGAAGAAGAAGCCGATGGAGTTTGGTTCg < 1:1009971/274‑1 (MQ=255) cTGGCAATGCGCCTGCGTGCAAACAGCACCTGGGCGATGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGAGTTTGGTTCGTg < 1:593289/275‑1 (MQ=255) tgagcCTGCGTGGAAACAGCACCTGGGGGAGGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTATGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGAGGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGAGTTTGGTTCGTGGACcac < 2:656938/271‑1 (MQ=255) aCCTGGGCGATGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCAGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGAGTTTGGTTCGTGGACCACACGAGAAATCCTGATCGAGTc > 1:8488/1‑275 (MQ=255) gggtttttgtgaTTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTGGGTCTGCAGCTGCCCGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATAGGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGTAGTTTGGTTCGTGGACCACACGAGAAATCCTGATCGCGTCTTTCg < 2:1060119/263‑1 (MQ=255) aTGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGAGTTTGGTTCGTGGACCACACGAGAAATCCTGATCGCGTCTTTCGCCgg < 1:506386/275‑1 (MQ=255) tGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATCTTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGGGTTTGGTTCGTGGACCACACGAGAAATCCGGATGCCGTCTTTctcgtgg > 2:359923/1‑269 (MQ=255) tGCTGGAATTTGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTGAGCAACCGCCTCCTGAAGCAGCAGCCGATGGAGTTTGGTTCGTGGACCACACGAGAAATCATGATCGCGTCtttgctcggg > 2:28250/1‑268 (MQ=255) tGTCTTTAACGGCATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGAGTTTGGTTCGTGGAACACACGAGAAATCCTGACCGCGCCTTTCGCCgggcgtggtgggg > 2:958912/1‑265 (MQ=255) gCATGGTGTTCCTGGTGTTAGGGCTGCGGATGCCGGGTAGTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCATAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGAGGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCTGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGAGTTTGGTTCGTGGACCACACGAGAAATCCGGATCGCGTCTTTCGCCGGGGTGCGTGGGGCGATCActct < 1:208971/274‑1 (MQ=255) cATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGGTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTTATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGAGTTTGGTTCGTGGACCACACGAGAAATCCTGATCGCGTCTTTCGCCGGGGTGCGTGGGGCGATCACTCTgg < 1:811626/275‑1 (MQ=255) cATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGATGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGAGTTTGGTTCGTGGACCACACGAGAAATCCTGATCGCGTCTTTCGCCGGGGTGCGTGGGGCGATCACTCTgg < 2:144139/275‑1 (MQ=255) cATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGCAGAAGAAGCCGATGGAGTTTGGTTCGTGGACCACACGAGCAATCCTGATCGCGTCTTTCGCCGGGGTGCGTGGGGCACGCACTCTg > 1:604857/1‑274 (MQ=255) cATGGTGTTCCTGCTGTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGAGTTTGGTTCGTGGACCACACGAGAAATCCTGATCGCGTCTTTCGCCGGGGTGCGTGGGGCGATCACTCTgg > 1:314627/1‑275 (MQ=255) ctgctgTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATTGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTCTTCTGATATATGCCGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCAGATGGAGTTTGGTTCGTGGACCACACGAGAACTCCTGATCGCGTTGTCACCCGGGGCGCGTGGGGCGCTCACTCTGGCCGGCGTGc > 2:1023620/1‑274 (MQ=255) ctgctgTTAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGAGTTTGGTTCGTGGACCACACGAGAAATCCTGATCGCGTCTTTCGCCGGGGTGCGTGGGGCGATCACTCTGGCCGGTGTGct < 1:261875/275‑1 (MQ=255) tAGGTCTGCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGACGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGAGTTTGGTTCGTGGACCACACGAGAAATCCTGATCGCGTCTTTCGCCGGGGTGCGTGGGGCGATCACTCTGGCCGGTGTGCTCTCTATc > 2:170758/1‑275 (MQ=255) gCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAACTCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGCCGATGACAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGCGTTTGGTTCTTGGACCACACGAGAAATCCTGATCGCGTCTTTCGCCGGGGTCCGGGGGGCGCTCACTCTGGCCGCTGTGCTCTCTATCCCgctgc > 2:814206/1‑275 (MQ=255) gCAGCTGCCGGGTATTCTGGAGACGTCGCTGATGGCAGCAGAAATCGACCCTAACGTCGAAATCTGGATGCTGTTTACCAATATTATTCTGATATATGCGGCGCTGATGCTGGTCCGTTTCGGCTGGCTGTGGCCGATGAAAAAGTTCAGCAACCGCTTCCTGAAGAAGAAGCCGATGGTGTTTGGTTCGTGGACCACACGAGAAATCCTGATCGCGTCTTTCCCCGGGGGGGGTGGGGCGAGCACGCGGGCCGGGGTGCCCCCTATCCCgctgc > 2:621759/1‑275 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |