New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 2414510 | 161 (1.230) | 3 (0.020) | 3/492 | NT | 1.8% | coding (1041/1203 nt) | ackA | acetate kinase A and propionate kinase 2 |
? | NC_000913 | 2414520 = | 163 (1.270) | coding (1051/1203 nt) | ackA | acetate kinase A and propionate kinase 2 | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
ACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGACCGAAGTGACCAGCGACTGCCGCTATGTTGAAGACAACTACGCGACGAAAGAAGACGCGAAGCGCGCAATGGACGTTTACTGCCACCGCCTGGCGAAATACATCGGTGCCTACACTGCGCTGATGGATGGTCGTCTGGACGCTGTTGTATTCACTGGTGGTATCGGTGAAAATGCCGCAATGGTTCGTGAACTGTCTCTGGGCAAACTGGGCGTGCTGGGCTTTGAAGTTGATCATGAACGCAACCTGGCTGCACGTTTCGGCAAATCTGGTTTCATCAACAAAGAAGGTACCCGTCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGAC > NC_000913/2414236‑2414796 | accaaacCCGGGGAATGAGCCTTGACACAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGGCTGGCCTGCTGGGTCTGACCGAAGTGACCAGCGACGGCGGCTAGGTTGAGGACAACTACGCAACGAAAGAAGACGCGAAGCGCGCAATGTACGTTTACTCCCAGCGCCTGGCGAAATACATCGGTGCCTACACTGCGCTGATGGATGGTCGTCTGGACGCTGTTGTATTCACTGGTGGTATCGGTGAACATGCCGCAATGGTTCGTGAACTGTCTCTGGGCAAACTGGGCGTGCt < 2:1097884/284‑1 (MQ=255) aCGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGACCGAAGTGACCAGCGACTGCCGCTATGTTGAAGACAACTACGCGACGAAAGAAGACGCGAAGCGCGCAATGGACGTTTACTGCCACCGCCTGGCGAAATACATCGGTGCCTACACTGCGCTGATGGATGGTCGTCGGGACGCTGTTGTCTTCACTGGTGGTATCGGTGAAAATGCCGCAATGGTTCGTTAACTGTCCCTTGGCAAACTGGGCGt > 2:15678/1‑286 (MQ=255) cGAAACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACGGCTGACCAAAGAGGCGGGCCGGCTGGGGCTGAACGAAGTGACCAGAGACTGCCGCGATGTGGAAGACAACTACGCGACGAAAGAAGAAGCGAAGCGCGCAATGGACGGTTACTGCCACCGCCGGGCGAAAGACAGCGGTGACTACACTGCGCTGATGGATGGTCGTCTGGACGCTGTTGTATTCACTGGTGGTATCGGTGAAAATGCCGCAATGGTTCGTGAACTGTCTCTGGGCAAACTGGGCGTGCTg < 1:85871/289‑1 (MQ=255) aGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGACCGAAGTGACCAGCGACTGCCGCTATGTTGAAGACAACTACGCGACGAAAGAAGACGCGAAGCGCGCAATGGACGTTTACTGCCACCGCCTGGCGAAATACATCGGTTCCTACACTGCGCTGATGGATGGTCGTCTGGACGCTGTTGTATTCACTGGTGGTATCGGTGAAAATGCCGCACTGGTTCGTGAACTGTCCCTGGGAAAACGGGGCGTGCTGGGCTTGGAAGTTGATc > 2:663169/1‑289 (MQ=255) aGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGACCGAAGTGACCAGCGACTGCCGCTATGTTGAAGACAACTACGCGACGAAAGAAGACGCGAAGCGCGCAATGGACGTTTACTGCCACCGCCTGGCGAAATACATCGGTGCCTACACTGCGCTGATGGATGGTCGTCTGGACGCTGTTGTATTCACTGGTGGTATCGGTGAAAATGCCGCAATGGTTCGTGAACTGTCTCTGGGCAAACTGGGCGTGCTGGGCTTTGAAGTTGATc > 1:963322/1‑289 (MQ=255) ttGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGACCGAAGTGACCAGCGACTGCCGCTATGTTGAAGACAACTACGCGACGAAAGAAGACGCGAAGCGCGCAATGGACGTTTACTGCCACCGCCTGGCGAAATACATCGGTGCCTACACTGCGCTGATGGATGGTCGTCTGGACGCTGTTGTATTCACTGGTGGTATCGGTGAAAATGCCGCAATGGTTCGTGAACTGTCTCTGGGCAAACTGGGCGTGCTGGGCTTTGAAGTTGATCATGa > 2:473834/1‑289 (MQ=255) tGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGACCGAAGTGACCAGCGACTGCCGCTATGTTGAAGACAACTACGCGACGAAAGAAGACGCGAAGCGCGCAATGGACGTTTACTGCCACCGCCTGGCGAAATACATCGGTGCCTACACTGCGCTGATGGATGGTCGTCTGGACGCTGTTGTATTCACTGGTGGTATCGGTGAAAATGCCGCAATGGTTCGTGAACTGTCTCTGGGCAAACTGGGCGTGCTGGGCTTTGAAGTTGATCATGaa < 1:970844/289‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
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