New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | = 3815441 | 153 (1.230) | coding (328/642 nt) | pyrE | orotate phosphoribosyltransferase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
CTTAACCGCCGCCAGATGTTCCGCCATTTCCGGCTTCTCTTCCAGGTAAGCAATCAGGTCTTTCAGGGTGATGATAGAGATCACTTTGCAGTTGTAATCACGCTCAACTTCCTGAATCGCCGAAATCTCGCCGCGCCCGCGTTCCTGACGATCGAGCGAAATCAACACGCCAGCAAGCGTCGCGCCATTGGCCTGAATAATCTCCATCGACTCGCGAATCGCCGTTCCGGCGGTGATCACATCATCTACCAGCATTACGCGTCCTTGTAACGCGCTACCAACCAGATTGCCGCCTTCACCGTGGTCTTTTGCTTCTTTGCGGTTAAAGCAGTACGGCAGGTCCAGGTCGTGATGCTCCGCCAGTGCCACAGCGGTTGTGGTGGCAATCGGGATCCCTTTGTAAGCAGGGCCAAACAGCAGATCGAACTCAATGCCGGAATCCACCAACGCTTCAGCGTAAAAACGGCCTAACAGTGCCAGATCGCGCCCGGTATTAAACAGCCCGGCGTTGAAGAAATAGGGGCTTTTGCGCCCGGATTTCAGCGTAAACTCGCCAAACTTTAACACCTGCTTGCT > NC_000913/3815154‑3815729 | aaCCGCCGCCAGATGTTCCGCCATTTCCGGCTTCTCTTCCAGGTAAGCAATCAGGTCTTTCAGGGTGATGATAGAGATCACTTTGCAGTTGTAATCACGCTCAACTTCCTGAATCGCCGAAATCTCGCCGCGCCCGCGTTCCTGACGATCGAGCGAAATCAACACGCCAGCAAGCGTCGCGCCATTGGCCTGAATAATCTCCATCGACTCGCGAATCGCCGTTCCGGCGGTGATCACATCATCTACCAGCATTACGCGTCCTTGTAACGCGCTACCAACCAGATTgcc < 1:500906‑M2/288‑4 (MQ=255) 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CTTAACCGCCGCCAGATGTTCCGCCATTTCCGGCTTCTCTTCCAGGTAAGCAATCAGGTCTTTCAGGGTGATGATAGAGATCACTTTGCAGTTGTAATCACGCTCAACTTCCTGAATCGCCGAAATCTCGCCGCGCCCGCGTTCCTGACGATCGAGCGAAATCAACACGCCAGCAAGCGTCGCGCCATTGGCCTGAATAATCTCCATCGACTCGCGAATCGCCGTTCCGGCGGTGATCACATCATCTACCAGCATTACGCGTCCTTGTAACGCGCTACCAACCAGATTGCCGCCTTCACCGTGGTCTTTTGCTTCTTTGCGGTTAAAGCAGTACGGCAGGTCCAGGTCGTGATGCTCCGCCAGTGCCACAGCGGTTGTGGTGGCAATCGGGATCCCTTTGTAAGCAGGGCCAAACAGCAGATCGAACTCAATGCCGGAATCCACCAACGCTTCAGCGTAAAAACGGCCTAACAGTGCCAGATCGCGCCCGGTATTAAACAGCCCGGCGTTGAAGAAATAGGGGCTTTTGCGCCCGGATTTCAGCGTAAACTCGCCAAACTTTAACACCTGCTTGCT > NC_000913/3815154‑3815729 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |