| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,354,908 | 0 | A | T | 7.5% | 172.4 / 2.6 | 50 | intergenic (‑191/+46) | lysU/dtpC | lysine tRNA synthetase, inducible/dipeptide and tripeptide permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (25/21); new base T (2/2); total (27/23) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
GCTGACGTAGTGCCGCCAGTTTTTCGCGGCGATTTCTCAGTTCATCGTTAAAATCAATAGCCTCATTGGCTCCCCGTGTTTCTTGTTCAGACATTTTGGTTCCTCTAAATCCAGCTTTCAATTTAGCGTAGATAAAGAGACAGATCGGTACACTGTATTATCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAATTGCCATACCGCTAATTTGCGACTCTGTCGTCTGCTGTGCCACGACGCCTGCCAGCCAGTTGGCGACCGCGCCTGTTGCCAGCATATAAATCCCGGTTAATACGCC > NC_000913/4354624‑4355196 | gCTGACGTAGTGCCGCCAGTTTTTCGCGGCGATTTCTCAGTTCATCGTTAAAATCAATAGCCTCATTGGCTCCCCGTGTTTCTTGTTCAGACATTTTGGTTCCTCTAAATCCAGCTTTCAATTTAGCGTAGATAAAGAGACAGATCGGTACACTGTATTATCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATaaa > 2:982071/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |