| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,253,517 | A→G | 11.9% | S168G (AGT→GGT) | ubiA → | p‑hydroxybenzoate octaprenyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,253,517 | 0 | A | G | 11.9% | 175.5 / 2.5 | 77 | S168G (AGT→GGT) | ubiA | p‑hydroxybenzoate octaprenyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/32); new base G (6/5); total (40/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AGAGGCGCGCGCGCTGTTTGTCGTGCTGGTACTGATTTCGTTTTTACTGGTGCTGACGCTGAATACGATGACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCAGATTGGCGTACTGGCACTGATGGCGATCATCGGTGAGTTAAATGGCTTAGGCTGGGGATATTACTG > NC_000913/4253297‑4253737 | agagGCGCGCGCGCTGTTTGTCGTGCTGGTACTGATTTCGTTTTTACTGGTGCTGACGCTGAATACGATGACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGCAGCGGCATACCCATCTACCGCAAGTGGGCCTGGGCGCGGCGTTTGGGTGGTCGGTTCCAATGGCTTTTGCCCCTGTGGGGGAGTCGGGCCCGTTGGGTTGCTg > 2:344968/1‑228 (MQ=255)agagGCGCGCGCGCTGTTTGTCGTGCTGGTACTGATTTCGTTTTTACTGGTGCTGACGCTGAATACGATGACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGGGAGTGAGTCGGTGCCTTTGGGTTGCt > 1:734462/1‑227 (MQ=255) gagGCGCGCGCGCTAGTTGTCGTGCTGGTACTGATTTCGTTTTTGCTGGTGCTGACGCTGAATTCGATGACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTTGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTgg < 1:112348/228‑1 (MQ=255) gcgcgcgcTGTTTGTCGTGCTGGTACTGATTTCGTTTTTACTGGTGCTGACGCTGAATACGATGACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGGGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGCCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGGGCCATTGAGTTGCTGGGTAATg > 1:390506/1‑229 (MQ=255) gcgcgcTGTTTGTCGTGCTGGTACTGATTTCGTTTTTACTGGTGCTGACGCTGAATACGATGACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGGGAGGGAGTCGGGGCCGTTGAGTTGCTGGTTATTGtt > 1:330568/1‑229 (MQ=255) gtggttttttGTCGTGCTGGTTCTGTTTTCGTTTTTACTGGTGCTGACGCTGAATGCGATGACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTGATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTc < 2:208752/222‑1 (MQ=255) ctttttGTCGTTCTGGTTCTGATTTCGGTTTTCCTGGTGCTGACGGTGAATACGGTGACCATTTTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCCTGGGTGTTCCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCt < 2:501778/224‑1 (MQ=255) tGGTACTGATTTCGTTTTTACTGGTGCTGACGCTGAATACGATGACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTCTACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGGGAGTCGGTGCCATTGCGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCCATATTCTCTg > 1:180824/1‑229 (MQ=255) tGGTACTGATTTCGTTTTTACTGGTGCTGACGCTGAATACGATGACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTg > 1:63585/1‑229 (MQ=255) tGGTACTGATTTCGTTTTTACTGGTGCTGACGCTGAATACGATGACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGCGAGTCGGTGCCATTGAGGTGCGGGTTAATGTTCTTAGCCAAAATTCtgtg > 1:641884/1‑229 (MQ=255) aTTTCGTTTTTACTGGTGCTGACGCTGAATACGATGACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGGGAGGGGGTCGGTGCCCTTGGGTTGCTGGGTAATGTTCCTCGCCAATATTTTCTGGGCGgggg > 2:162532/1‑229 (MQ=255) ttttGTTTTTGCGGGTGCTGGCGCTGAATACGATGCCCTTTCT‑TTGTGCGGTTGCCGCGCTGGGGCTGGCGGGGGTGTTCCCGTTTATGAAGCGGTATACCAATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGc < 2:603654/229‑1 (MQ=255) ttgttttttACGGGTGCTGACGCTGAATACGATGACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTTCCCGTTTATGAAGCGGTATCCCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGc < 1:248429/224‑1 (MQ=255) gttttttACTGGGGCTGACTGTGAAGACGATTCCCATTCTGTTTG‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTa < 2:526141/227‑1 (MQ=255) gTTTTTACTGGTGCTGACGCTGAATACGATGACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTCGCGCTCGCGTGGGTGTACCCGTTTATTAAGCGGTATACCCATCTACCGCACGGGGTGCTGGGCGCGCCGTTTGGCTGTTCGATTCCAATGCCTTTTGCCGCTGTTATTGGGTCGTCGCCCTTTGGTTTCCGGTTATTGTTCCTCCCCAATATTTCTTGGGGGGTGGCttcc > 2:355827/1‑227 (MQ=255) gTTTTTACTGGTGCTGACGCTGAATACGATGACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCCCTTTGAGGGGGTCGGGGCCATTGAGTTGCTGGTTATGGTTCCTCGCCATTATTTCCTGGGCGGTGGGTTAc > 1:50339/1‑229 (MQ=255) gTTTTTACTGGGGCTGACGCTGAAGACGATTACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGCTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGGGGGGCTGGGGGCGGCGTTTGGCTGGTCGCTTTCAATGCCTTTTGACGCTGTGAGTGAGTCGGGTCCATTGAGTTGCTGGTTAATTTTCCTCCCCCGTATTCTCTGGGCGTTGGCTTAc > 2:673373/1‑229 (MQ=255) tACTGGTGCTGACGCTGAATACGATGACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGc > 1:603655/1‑220 (MQ=255) tACTGGTGCTGACGCTGAATACGATGACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGGGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGGTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGacac > 1:559957/1‑229 (MQ=255) aCTGGTGCTGACGCTGAATTCGATGACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACg < 1:489341/229‑1 (MQ=255) ggTGCTGACGGTGAATCCGTTGACCATTCTGTTGG‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAg < 1:462934/229‑1 (MQ=255) gAATACGATGACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAAGGTTCTTCGCCATTATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGCCACGCAGTATGCGATGGtt > 1:193942/1‑229 (MQ=255) aTGACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGAACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCACTGGCTTTTGCCGATGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGATTTGTTGGTTCATGTTCCTCGCCCATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACCCCGTATGCGATGGTTGACcggc > 2:515043/1‑227 (MQ=255) gACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGGGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGTTTACGCCACGCAGTATGCGATTGTTGACCGCgat > 1:414657/1‑229 (MQ=255) aCCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCgatg < 1:230591/229‑1 (MQ=255) cctttgtgttgt‑CTATTGCCGCGCTTGCCCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCgatg < 2:63585/222‑1 (MQ=255) ccATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGGGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTTGCCAATATTCTCTGGGCGGAGGCTTACGACCCGCAGTATGCGATGGTTGACCGCgctga > 1:48973/1‑229 (MQ=255) cATGCTGTTGG‑CTGTTGCCGCGCTTGCCGTGGCGTGGGTTTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGGAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCgatgat < 1:642392/229‑1 (MQ=255) ttCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACAGGCAGAATGCGATGGTTGACCGCgatgatga > 1:429822/1‑229 (MQ=255) tCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCACGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGGGTTAGTCGGTGCCATTGGGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTAGGAGCGCCATTATGCAGTGGGTGACcggctgggtggg > 2:542059/1‑219 (MQ=255) ttttgt‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGGAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGAtgt < 1:686838/227‑1 (MQ=255) t‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGa > 1:362545/1‑229 (MQ=255) aGCGCTGGCGTGGGTGTCCCCGTTTATGAAGCGGTATTCCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATc < 1:162532/228‑1 (MQ=255) gcggTGGCGGGGGTTTCCCCGTTTCTGAAGCGGTTTACCTATCTACCTCAAGTGGTGCTGGGGGGGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCa < 2:550666/229‑1 (MQ=255) gCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCACTATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGAATGCGATGGTTTACCGCGAGATTGTAGTGAAGATTGCAATTCAATCCCCggga > 1:504326/1‑226 (MQ=255) aCCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCCTTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGCCACGCAGATTGCGATGGTTGACCGCGGTGCGGGTGGGAAGCTTGGCCTTAATTCAACGGAACTCCTGTTggg > 2:312789/1‑229 (MQ=255) aCCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCCAAATTCTCTGGGGGGAGGCTTACGACACGCAGTATGCGAGGGTTGACCGCGCTGATGATGAGGAGATTGGCATTAAATCCACGGaaaactgcttggg > 2:269567/1‑219 (MQ=255) aCCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGCCCGGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGTTGGTGAGTGGAAGATTGCCCTTAATTCCACGGCAACCCTTTTggg > 2:584081/1‑229 (MQ=255) aCCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCgg > 1:381024/1‑229 (MQ=255) tgttATGAAGCGGGATCCCCATTTCAGGGAGGTGGTGGTGGGCGCGGTGTTTGGCTGGTCGATTCGAAGGGCTTGTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGGTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATAGTCTCTGGGCGGGGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGGAATCCTGTTCGGCCa < 2:404318/226‑1 (MQ=255) gTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGGGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCa < 1:19398/228‑1 (MQ=255) tttATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGGGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGGGTTGCTGGTTAATGTTCCCCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGCCACGACGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATTGGTAGTTTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAAt > 2:214657/1‑229 (MQ=255) tATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATAc > 1:510496/1‑229 (MQ=255) aTGGAGCGGTTATCCCATTTACCGCAGGTTGTGCTGGGCGAGGCTTTTGGCCGGTCGAGTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATAc < 2:180824/228‑1 (MQ=255) cgggTATTCCCATTTTCTGGGAGTTGTGTAGGGCGGTGCGTTTGGTTGGTTGATTCCAATGGCTTTTGCCGTTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCATTATTCTAGGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATaaa < 1:673374/227‑1 (MQ=255) ggTTTACCCATATACCGTAAGTGGGGCTGGTCGCGGGGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGTTTGTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAAt < 1:344968/228‑1 (MQ=255) aTCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGGCACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCAAGGCAATCCGGTTCGGCCAATACGCTAAATTGATTATggg > 1:249879/1‑229 (MQ=255) tACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACCCGCAGTATGCGCTGGTTGACCGCGATGAGGGTGTTAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGGTAAATTGTTTATTGGGAt > 2:599321/1‑229 (MQ=255) tACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGCGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGGGAAGGTTGGAATTAAATCCACGGAAATCCTGTTCGGCCAAACCGATAAATTGATTATTGGGAt > 1:36162/1‑229 (MQ=255) aGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGGTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGTTGTGAAGATTGGCATTAAACTCACGGAAATCCTGTTCGGCCAATACGTTAAATTGATTATTGGATTTTTGcga > 1:337818/1‑227 (MQ=255) gtggtgCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCAGa < 1:373999/229‑1 (MQ=255) tgCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGGTCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTTTGGGCGGTGGCTTACGGCACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCCATGATGATGTGCAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCGGTTCGGACAAAACCAAAAATTGATTATTGGGATTTTTCAAATAgg > 2:283819/1‑229 (MQ=255) gCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGGGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTTGGCGGTGGCTTACGACACGAAGTATGCGATGGTTGACCGCGCTGATGATGTGAAAATTGCAATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATAAGAGAATTTGTTTCTTGGTATTTTGCAGATTggt > 2:641641/1‑228 (MQ=255) cttggCGTGGGGTTTGGCTGGTTGATTCCAATGGTTTTTGCCGTTGGGAGTGAGTCGGTGCCTTTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATCGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCAGATTGGCg < 2:330568/226‑1 (MQ=255) cggggCGCGGCGTTTGGCGGGTCGATGCCAATGGCTTTTGCCGCTGGGAGGGAGTGGGTGCCATTGAGTTGCTGGTGAAGGTTCCTCGCCAATATTCTCGGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCAGATTGGCg < 1:355827/227‑1 (MQ=255) gggcggggcgTTTGGCTTGGCGATTCCAATGGCTTTTGCCGTTGTGAGTGAGTCGGGGACATTGGGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCAGATTGGCGTa < 2:632086/229‑1 (MQ=255) cggcgTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCAGATTGGCGTACTGGc > 1:653503/1‑229 (MQ=255) ggcgTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCGGTTTGGCGTACTGGCa > 1:522662/1‑229 (MQ=255) ggcgTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGGATTTTGCAGATTGCGGTACTGGCa > 1:591317/1‑229 (MQ=255) gcgTTTGGATGGTCGATTCGAATGGCTTTTGCCGGTGTGAGTGAGTCGGGGCCATTGGGTTGCTGTTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCGGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCAGATTGGCGTACTGGCa < 1:256959/228‑1 (MQ=255) tccatgggtttttGCCGGTGTGAGGGGTTTGGGGCCATGTGGTTGCTGGTTAATGTTCCCCGTCAATGTTCTCTGGGCGGGGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCAGATTGGCGTACTGGCAATGATGGCGGTCATCGGt < 2:362545/220‑1 (MQ=255) ggCTTTTTCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCTTTGGGTTGCTGGTTAATTTGCCGCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACCCGCAGGATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCAGATTGGCGTACTGGCACTGATGGCGATCATCGGTGAGtt < 2:414657/228‑1 (MQ=255) ttttttGCCGCTGTGAGGGAGTCGGGGCTATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCAAATATTCTCTGGGCGGTTGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCAGATTGGCGTACTGGCACTGATGGCGATCATCGGTGAGTTaa < 2:381024/227‑1 (MQ=255) tGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCgatgat < 1:432396/109‑1 (MQ=255) tGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCgatgat > 2:432396/1‑109 (MQ=255) gCCGGTGTGAGTGGGTCGGTGCACTTGAGTTGCTGGTGAATGTTACTCGCGAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTCGTACACGTGGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTGAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTAGTGGTATTTTGCCGATTGGCGTACTGGCACTGATGGCGATCAGCGGTGCGTTAAATGGCt < 2:161879/229‑1 (MQ=255) gCCGCTGTGAGTGAGTCGGGGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCAGATTGGCGTACTGGCACTGATGGCGATCATCGGTGAGTTAAATGGCt < 1:641642/229‑1 (MQ=255) gtgggtttgtCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCAGATTGGCGTACTGGCACTGATGGCGATCATCGGTGAGTTAAATGGCTTAGGCt < 2:653502/221‑1 (MQ=255) tgggtgattCGGTGTCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCTGCGCCAATATTCTCTGGGCGGTTGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAAGACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCAGATTGGCGTACTGGCACTGATGGCGATCATCGGTGAGTTAAATGGCTTAGGCt < 1:466459/225‑1 (MQ=255) tgggtgaggCGGGGCCATTGGGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCAGATTGGCGTACTGGCACTGATGGCGATCATCGGTGAGTTAAATGGCTTAGGCt < 1:584082/225‑1 (MQ=255) tgagtgggTCGGTGCCATTGATTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCCCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCAGATTGGCGTACTGGCACTGATGGCGATCATCGGTGAGTTAAATGGCTTAGGCt < 1:599322/228‑1 (MQ=255) tgagtgagTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTGCGCGCCAATATTCTGTTGGCGTTGGCTTACGACACGCAGTAGGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCAGATTGGCGTACTGGCACTGATGGCGATCATCGGTGAGTTAAATGGCTTAGGCt < 1:213748/228‑1 (MQ=255) tgagtgagTCGGTGCCATTGAGTTGCAGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCCCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCAGATTGGCGTACTGGCACTGATGGCGATCATCGGTGAGTTAAATGGCTTAGGCt < 1:498913/228‑1 (MQ=255) cGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCAGATTGGCGTACTGGCACTGATGGCGATCATCGGTGAGTTAAATGGCTTAGGCTGGGGATATTa < 1:167403/229‑1 (MQ=255) ggTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCAGATTGGCGTACTGGCACTGATGGCGATCATCGGTGAGTTAAATGGCTTAGGCTGGGGATATTAc > 1:488640/1‑229 (MQ=255) gTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGCTTATTGGTATTTTGCAGATTTGCGTACTGGCACTGATGGCGATCATCGGTGATGTAAATGGCTTAGGGTGGGGatttgacg > 2:703104/1‑223 (MQ=255) tGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCAGCTTGGCGTACTGGCACTGATGGCGATCATCGGTGAGTTAAATGGCTTAGGCTGGGGATATTACTg > 1:724307/1‑229 (MQ=255) | AGAGGCGCGCGCGCTGTTTGTCGTGCTGGTACTGATTTCGTTTTTACTGGTGCTGACGCTGAATACGATGACCATTCTGTTGT‑CGATTGCCGCGCTAGCGCTGGCGTGGGTGTACCCGTTTATGAAGCGGTATACCCATCTACCGCAAGTGGTGCTGGGCGCGGCGTTTGGCTGGTCGATTCCAATGGCTTTTGCCGCTGTGAGTGAGTCGGTGCCATTGAGTTGCTGGTTAATGTTCCTCGCCAATATTCTCTGGGCGGTGGCTTACGACACGCAGTATGCGATGGTTGACCGCGATGATGATGTGAAGATTGGCATTAAATCCACGGCAATCCTGTTCGGCCAATACGATAAATTGATTATTGGTATTTTGCAGATTGGCGTACTGGCACTGATGGCGATCATCGGTGAGTTAAATGGCTTAGGCTGGGGATATTACTG > NC_000913/4253297‑4253737 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |