Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 602,200 | A→G | 17.7% | E81G (GAG→GGG) | pheP → | phenylalanine transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 602,200 | 0 | A | G | 17.7% | 136.5 / 5.6 | 71 | E81G (GAG→GGG) | pheP | phenylalanine transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (22/32); new base G (6/8); total (30/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AGATACTGCGTCGAATCAAGAGCCGACGCTTCATCGCGGATTACATAACCGTCATATTCAACTGATTGCGTTGGGTGGCGCAATTGGTACTGGTCTGTTTCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCGGGCATCTATATGCAGTACTGGTTCCCGGATGTTCCAACGTGGATTTGGGCTGCCGCCTTCTTTATTATCATCAACGCCGTTAACCTGGTGA > NC_000913/601985‑602415 | aGATACTGCGTCGAATCAAGAGCCGACGCTTCATCGCGGATTACATAACCGTCATATTCAACTGATTGCGTTGGGTGGCGCAATTGGTACTGGTCTGTTTCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCGGAATTGCGGGGTTACGGCGTCGCCGGGCTCCTCGCTTTCCTGCTTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGGGGGGCCGGAATCCGGt > 2:568215/1‑229 (MQ=255) aCTGCGTCGAATCAAGAGCCGACGCTTCATCGCGGATTACATAACCGTCATATTCAACTGATTGCGTTGGGTGGCGCAATTGGTACTGGTCTGTTTCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCAGCGCTTTCCTGATTTTGCGCCAGCTTGGCGAAATGGGGGTTCAGGGGCCGGGGTCCGGTTCAt > 2:742598/1‑229 (MQ=255) cTGCGTCGAATCAAGAGCCGACGCTTCATCGCGGATTACATAACCGTCATATTCAACTGATTGCGTTGGGTGGCGCAATTGGTACTGGTCTGTTTCTTGGCCTTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTCCGCGGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTTTGGGCCCGCTGGGGGAAATGGGGGTGGGGGGGCCGGTATCCGGTTCAt > 2:184687/1‑228 (MQ=255) tGCGTCGAATCAAGAGCCGACGCTTCATCGCGGATTACATAACCGTCATATTCAACTGATTGCGTTGGGTGGCGCAATTGGTACTGGTCTGTTTCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTTCTGGGATACGGCGTCCCCGGGGTCATCGCCTTCCTGATTTTGCGCCAGCTTGGCGAAATGGGGGTTGAGGAGCCGGTGCCCGGGTCCttt > 2:521506/1‑229 (MQ=255) cggTCGAATCAAGGGCCGACGTTTCATCGCGGATTACATAACCGTCATTTTCAACTGATTGCGTTGGGTGGCGCAATTGGTACTGGTCTGTTTCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTg < 2:211180/227‑1 (MQ=255) cGTCGAATCAAGAGCCGACGCTTCATCGCGGATTACATAACCGTCATATTCAACTGATTGCGTTGGGTGGCGCAATTGGTACTGGTCTGTTTCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTTTTGCTGGGCTTCGGCGGCGCCGGGATCATCGCTTTCCTTATTATGCGCCAGCTTGGGGGACTGGGGGTGGTGGAGCCGGTGTCCCGTTCCTTTGc > 2:610858/1‑229 (MQ=255) cGTCGAATCAAGAGCCGACGCTTCATCGCGGATTACATAACCGTCATATTCAACTGATTGCGTTGGGTGGCGCAATTGGTACTGGTCTGTTTCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGGTCATCGCCTTCCTGATTATGCGCCCGCTTGGCGCATAGGGGGTTGAGGACCCGGTCTCCGGTTCAttt > 2:319664/1‑227 (MQ=255) cGTCGAATCAAGAGCCGACGCTTCATCGCGGATTACATAACCGTCATATTCAACTGATTGCGTTGGGTGGCGCAATTGGTACTGGTCTGTTTCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGGATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCCTCGCTTTCCTGCTTTTGGGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGGGCCGGTATCCGGTCCAttt > 1:333742/1‑227 (MQ=255) aaTCAAGAGCCGACGCTTCATCGCGGATTACATAACCGTCATATTCAACTGATTGCGTTGGGTGGCGCAATTGGTACTGGTCTGTTTCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGGGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCCTTTGCCCCCt > 1:565980/1‑229 (MQ=255) 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2:42039/220‑1 (MQ=255) gCCGACGCTTCATCGCGGATTACATAACCGTCATATTCAACTGATTGCGTTGGGTGGCGCAATTGGTACTGGTCTGTTTCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCtat < 1:95514/229‑1 (MQ=255) tagccGTCATTTTCAACGGGTTGGGTTGGGTGGCGGAATTGGTACTGGTCTGTTTCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGc < 1:332893/226‑1 (MQ=255) atatTCAACTGATTGCGTTGGGTGGCGCAATTGGTACTGGTCTGTTTCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGGGCCGCCTTGGCGAAAAGGGGGTTGAGGGGCCGGTACCCGGGGACTTTGCCCCCTTTGCCTTATAATACGTGGGGCCGTTTGGGGGGTTctctcc > 2:710754/1‑224 (MQ=255) 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2:103520/1‑222 (MQ=255) aTTGGGTGGGGTGGCGCAATTGGTTCTTGTTCTTTTCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCATCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAact < 1:231276/229‑1 (MQ=255) ttGCGTTGGGTGGCGCAATTGTTACTGGTCTGTTTCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTAGTGCTGGGCTACGGCGTCGGCGGGATCACCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGTGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAacta < 1:739655/229‑1 (MQ=255) tGGGTGGCGCAAGTGGTTCTGGTCTGTTTCTTGGCATTGGCCCGGAGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCGGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGt < 1:371686/229‑1 (MQ=255) 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1:205253/218‑1 (MQ=255) gggttgggTCTTTTTTTTGGCCTTGGCCCGGCGATTGAGATGGCGGGTCCGGCGGTATTGCGTGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCtg < 2:678022/222‑1 (MQ=255) gTCTGTTTCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCTGGCTGGGGGGaa > 1:531400/1‑228 (MQ=255) tGTTTCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATgga > 1:367518/1‑228 (MQ=255) tttCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGATTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGGGGGAAGGGccg > 1:725453/1‑227 (MQ=255) tCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCtat < 2:100150/151‑1 (MQ=255) tCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCtat > 1:100150/1‑151 (MQ=255) tGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGGGCTGGGGGGAAGGGCAGAGCtt > 1:21316/1‑228 (MQ=255) tGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGGGCTGGCGGGAATGGCCGCGCTg > 1:181925/1‑229 (MQ=255) tGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACCTTGCCTCTCAATAATGGGGACCGTTTGCGGGCTTCGTCCTCGGCGGGAACTACTGGGTAATGTTGCGGCTGGGGGGAATGGccgggccg > 2:356875/1‑222 (MQ=255) tGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCCTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGGTTCCGGGCTTCCTCCCTGGCTTGAACTTCTGGGCAATGTTCCTGTTGGTGGGAAGGGCAGGGCTg > 2:484664/1‑229 (MQ=255) tGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGCCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGTTTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGGGGTTGATGAGCCGGTTTCAGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTCTAACAAAGGGGGCCCGCTTGCGGGGTTTATCTCCGGGTGGAATTACTGGGGCATGATCAGGCGGGGGGGCATGGCaaggcta > 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2:608870/224‑1 (MQ=255) cGGTGATTCAGGTGGCGGGTCCGGGTGTATTGGTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACGTTGCCTATAAATTCTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCggg < 1:719485/229‑1 (MQ=255) cGGCTATTCAGAGGGCGGGTCCGGTTTTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATGATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGGGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCggg < 1:742599/229‑1 (MQ=255) cGGCGATTCAGGTGGCGGGTCGGGCTGTATTGCTGGGCTCTGGCGGCGCCGGGATCATCGCTTGCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCggg < 1:98711/229‑1 (MQ=255) cGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCggg < 1:440836/229‑1 (MQ=255) tttCAGGTGGCGGTTCCGGTTTTTTTGTGGGGCTCCGGTGGCGCCGGTATCCGCGCTTTCCGGTTTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCGGGCATCt < 2:307186/228‑1 (MQ=255) aTTCAGATGGCGGGTCCGGTTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGGTGAGGATCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCGGGCATCt < 1:367047/229‑1 (MQ=255) ggttgCGGGTCCGGTTTTTTTGGTGGGGTGCGGCGTCGCCGGGATTATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCGGGCATCTATATg < 2:340970/225‑1 (MQ=255) gATGGCGGGTTCGGCTGTTTTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCGGGCATCTATATg < 1:224806/229‑1 (MQ=255) ggCTGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCGGGCATCTATATGCa < 1:610859/228‑1 (MQ=255) gggTCCGGGTTTTTTGGCGGGGGACGGCGTTGCCGGGATATGCGCTTTCCTGATTATCCGCCAGCTTGGCAAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTAGCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCGGGCATCTATATGCAGTAc < 2:531400/229‑1 (MQ=255) gggTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGCACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCGGGCATCTTTATGCAGTaa > 1:341529/1‑228 (MQ=255) cTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAATTCCTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTGTTCCTGGTGGTAATGGCGGACCTGACCCCTGCGGGACTTTATATGCAGACCGGGTTCCCGGATGTCCCAAc > 2:47576/1‑228 (MQ=255) cTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGTAATGGCAGAGCTGAACGCTGCGGGCGTCTATCTTCTGTACTGTTTCCCGGCTGTTCCAAc > 1:423587/1‑228 (MQ=255) tACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCGGGCATCTATATGCAGTACTGGTTCCCGGATGTTCCAACg < 1:47576/228‑1 (MQ=255) tCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTGGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGC‑GGCACCTATATGCAGTATTGGTTCCCGGATGTTCCAACGAGGATTAgg > 1:529310/1‑229 (MQ=255) ccgggtttcttgCTTTCCTGTTTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGGGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCGGGCATCTATATGCAGTACTGGTTCCCGGATGTTCCAACGTGGATTTggg < 2:21316/217‑1 (MQ=255) gggATCCTCGCTTTCCTGATTTAGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCGGGCATCTATATGCAGTACTGGTTCCCGGATGTTCCAACGTGGATTTGGGCTg < 1:448596/229‑1 (MQ=255) gggATCATCGCTTTCCGTATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGTGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCGGGCATCTATATGCAGTACTGGTTCCCGGATGTTCCAACGTGGATTTGGGCTg < 1:660334/229‑1 (MQ=255) catcGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCGGGCATCTATATGCAGTACTGGTTCCCGGATGTTCCAACGTGGATTTGGGCTgccgc < 1:134152/228‑1 (MQ=255) cagtgCTTTCCTGATTATGGGCCAGGTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGGGCCGGTACCCGGTTCATTGGCCAACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTGGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCGGGCATCTATATGCAGTACTGGTTCCCGGATGTTCCAACGTGGATTTGGGCTgccgc < 1:356875/224‑1 (MQ=255) ccTGTTTTTGCCCCAGTTTGGCGAAATGTTGTTTGGGGGGCCGTTTTCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTTTAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGTTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCGGGCATCTATATGCAGTACTGGTTCCCGGATGTTCCAACGTGGATTTGGGCTGCCGCCTTCTttatt < 2:341529/229‑1 (MQ=255) aTGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCGGGCATCTATATGCAGTACTGGTTCCCGGATGTTCCAACGGGGATTTGGGCTGCCCCCTTCTTTTTTatcatc > 2:594238/1‑228 (MQ=255) tGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCGGGCATCTATATGCAGTACTGGTTCCCGGATGTTCCAACGTGGATTTGGGCTGCCGCCTTCTTTATTATCATCAACGCCGTTAAc > 1:376549/1‑229 (MQ=255) cGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCGGGCATCTATATGCAGTACTGGTTCCCGGATGTTCCAACGTGGATTTGGGCTGCCGCCTTCTTTATTATCATCAACGCCGTTAACCTg < 1:594239/229‑1 (MQ=255) ggtggtTGAGGGGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCGGGCATCTATATGCAGTACTGGTTCCCGGATGTTCCAACGTGGATTTGGGCTGCCGCCTTCTTTATTATCATCAACGCCGTTAACCTGGTGa < 1:484664/227‑1 (MQ=255) | AGATACTGCGTCGAATCAAGAGCCGACGCTTCATCGCGGATTACATAACCGTCATATTCAACTGATTGCGTTGGGTGGCGCAATTGGTACTGGTCTGTTTCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCGGGCATCTATATGCAGTACTGGTTCCCGGATGTTCCAACGTGGATTTGGGCTGCCGCCTTCTTTATTATCATCAACGCCGTTAACCTGGTGA > NC_000913/601985‑602415 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |