New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3368970 = | 148 (0.920) | 4 (0.030) | 4/494 | NT | 2.9% | intergenic (+16/+44) | yhcG/yhcH | DUF1016 family protein in the PD‑(D/E)XK nuclease superfamily/DUF386 family protein, cupin superfamily |
? | NC_000913 | 3368995 = | 125 (0.810) | intergenic (+41/+19) | yhcG/yhcH | DUF1016 family protein in the PD‑(D/E)XK nuclease superfamily/DUF386 family protein, cupin superfamily | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
AGTGGGCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGAACATTCCCGGTTTTAAGATGATGGCTTGCTCGTTATCAATGGTGCTGCAAAGCTGATAATCATCCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCA > NC_000913/3368684‑3369248 | gcaatacattgatatccagctgttattaaacggtgaggaacggattctgtttggcatggcaggcactgcgcgtcagtgtgaagagttccaccatgaggatgattatcagctttgcagcaccattgataacgagcaagccatcatcttaaaaccgggaatgttcgccgtgtttatgccaggtgaaccgcataaaccaggatgcgttgtcggcgagcctggagagattaaaaaggttgtggtgaaggttaaggctgatttaatggcttaaaacttagttcgttttaacgAt < 1:1162804‑M1/2‑1 (MQ=255) gcaatacattgatatccagctgttattaaacggtgaggaacggattctgtttggcatggcaggcactgcgcgtcagtgtgaagagttccaccatgaggatgattatcagctttgcagcaccattgataacgagcaagccatcatcttaaaaccgggaatgttcgccgtgtttatgccaggtgaaccgcataaaccaggatgcgttgtcggcgagcctggagagattaaaaaggttgtggtgaaggttaaggctgatttaatggcttaaaacttagttcgttttaaagAt < 1:539649‑M1/2‑1 (MQ=255) ggCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAATATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGGCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTTCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTTGTTCGAAACCAGGTGGTGCTAGAGGAAGGCTATAAACGCCGTTAATTTAAACGGTTTCGCATTCTGc > 1:1294704/1‑289 (MQ=255) ggCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTTTGGCTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCCAGCGACTATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTAGCAGATGAACTTGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGCGGAAGGCTATAGACGCCGTCAATTTCACCGGTTTCGAATTCTga > 1:1175333/1‑288 (MQ=255) ggCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTTCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGACGCACCTACTTGATGAGAACCGACTCGCAAATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGCGCTAGAGGAAAGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTga > 2:760471/1‑288 (MQ=255) ggCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGc > 1:1429299/1‑289 (MQ=255) ggCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGc > 1:431947/1‑289 (MQ=255) 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atatccagctgttattaaacggtgaggaacggattctgtttggcatggcaggcactgcgcgtcagtgtgaagagttccaccatgaggatgattatcagctttgcagcaccattgataacgagcaagccatcatcttaaaaccgggaatgttcgccgtgtttatgccaggtgaaccgcataaaccaggatgcgttgtcggcgagcctggagagattaaaaaggttgtggtgaaggttaaggctgatttaatggcttaaaacttagttcgttttaaagATTCTGCAGAc < 2:366935‑M1/11‑1 (MQ=255) tccagctgttattaaacggtgaggaacggattctgtttggcatggcaggcactgcgcgtcagtgtgaagagttccaccatgaggatgattatcagctttgcagcaccattgataacgagcaagccatcatcttaaaaccgggaatgttcgccgtgtttatgccaggtgaaccgcataaaccaggatgcgttgtcggcgagcctggagagattaaaaaggttgtggtgaaggttaaggctgatttaatggcttaaaacttagttcgttttaaagATTCTGCAGAc < 1:1298120‑M1/11‑1 (MQ=255) tccagctgttattaaacggtgaggaacggattctgtttggcatggcaggcactgcgcgtcagtgtgaagagttccaccatgaggatgattatcagctttgcagcaccattgataacgagcaagccatcatcttaaaaccgggaatgttcgccgtgtttatgccaggtgaaccgcataaaccaggatgcgttgtcggcgagcctggagagattaaaaaggttgtggtgaaggttaaggctgatttaatggcttaaaacttagttcgttttaaagATTCTGCAGAc < 1:1006102‑M1/11‑1 (MQ=255) 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aTCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAAt < 2:426087/289‑1 (MQ=255) caccatgaggatgattatcagctttgcagcaccattgataacgagcaagccatcatcttaaaaccgggaatgttcgccgtgtttatgccaggtgaaccgcataaaccaggatgcgttgtcggcgagcctggagagattaaaaaggttgtggtgaaggttaaggctgatttaatggcttaaaacttagttcgttttaaagAtt < 2:369214‑M1/3‑1 (MQ=255) tCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAAt < 2:598810/280‑1 (MQ=255) 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AGTGGGCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGAACATTCCCGGTTTTAAGATGATGGCTTGCTCGTTATCAATGGTGCTGCAAAGCTGATAATCATCCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCA > NC_000913/3368684‑3369248 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |