| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 2818081 | 73 (0.630) | 3 (0.030) | 3/492 | NT | 2.7% | noncoding (55/77 nt) | argZ | tRNA‑Arg |
| ? | NC_000913 | = 2818569 | 141 (1.240) | noncoding (77/93 nt) | serV | tRNA‑Ser | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGC‑ATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACT‑CTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCT > NC_000913/2817796‑2818365 | gaggaTTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGC‑ATCCGGGAGGATTCGAAcc < 1:622802/288‑1 (MQ=255) 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ttCGTAGCCGAGTACTCTTTCGCGCTGGCCGACGGATTCATGGGGAAAACTTATACGACTTCTGTTATTGATACCGCTATTATAAGCATATCAATTAGGGGATGGTGCGTCCGGGAGGATTTCTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGC‑ATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTa < 2:816081/289‑1 (MQ=17) tCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGTGAAATCTTATTCTACTGCTGATATTGACACCGCTACTAACGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGGTACCTCATCGATTCCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGC‑ATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTa < 1:859291/288‑1 (MQ=255) aGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGC‑ATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTa < 1:869313/289‑1 (MQ=255) 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ttAATTCCGTTAACTCTTCGATACCTTCATTACTGAAGATTTCGGAGGATATGGTGC‑ATCCGGGAGGATCCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCATTCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACT‑CTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTg < 2:869456/288‑1 (MQ=255) cTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGC‑ATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTACACACATATCACGTAAGAGATGGTGCATCCGGGCGGATTCTAACCACCGACCGCCCGGTTCGTAGCCGA‑TGCTACCAACCAGCTGTGCTCCGGATGCAGCGGGAACCTTAGTTCACTACCGAtttt > 2:941869/1‑287 (MQ=17) tctTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGC‑ATCCGGGAGGATTCGAACCTCAGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATTTTGATACACCGACTAAAGACCTATCAAATAAGAGATGCTGCACCCGCGAGGATTCGAACCCACGACCGCTTGGTTCTTAGTCGAGTTCT‑CTAACCAGCTGTCCTATTGATGCATCCGGTAACTTACTTACCAGCAGTTTCTTTAATa > 2:798386/1‑288 (MQ=17) 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ccGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCGACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGACCCTCCGACCGCCCGGTTCGTAGCCGAGTAAC‑CTATCCAGCTGAGCTACGGCTGCAGCCGTAACCTTACTCTACTGACGATTTTTTGATCCCGCTACACAAGCCGTACCCAGCAAGAGACGGGTAATCTGggagga > 2:531214/1‑289 (MQ=18) cGAAtccccgcctcaccgccatttgcatccgtagctcagctggatagagtactcggctacgaaccgagcggtcggaggttcgaatcctcccggatgcaccatattctacgtactttcagcgatgaaggtatggaagaggtggcggtaataaccgcaggcaccagggaggataacgttgctttagcaacggcccgaagggcgagccgcaaggcgagtaatcctcccggatgcaccatctcttacttgatacggctttagtagcggtatcaaaaaatctgcagtaaagtaa < 2:805376‑M1/289‑286 (MQ=255) | GAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGC‑ATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACT‑CTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCT > NC_000913/2817796‑2818365 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |