| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 2531965 | 130 (0.950) | 4 (0.030) | 3/496 | NT | 2.7% | coding (503/762 nt) | cysZ | sulfate transporter, sulfite inhibited |
| ? | NC_000913 | = 2532167 | 165 (1.250) | coding (705/762 nt) | cysZ | sulfate transporter, sulfite inhibited | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
TTATCTGTTGTGGCCTCTGGCTGTCATCTCTGTGCTGTTAGTGTTTGGCTATTTCTTCTCCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGTATTACTAATTCTTTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACACGCGATGTGGCGGTAACAATCTACCGGTTATTTTGTAAACCGT > NC_000913/2531681‑2532251 | ttATCTGTTGTGGCCTCTGGCTGTCATCTCTGTGCTGTTAGTGTTTGGCTATTTCTTCTCCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGTATTACTAATTCTTTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGt < 1:404345/288‑1 (MQ=255) cTGTTGTGGCCTCTGGCTGTCATCTCTGTGCTGTTAGTGTTTGGCTATTTCTTCTCCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGTATTACTAATTCTTTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACtgt < 1:1029814/289‑1 (MQ=255) tgttgtGGCCTCTGGCTGTCATCTCTGTGCTGTTAGTGTTTGGCTATTTCTTCTCCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGTATTACTAATTCTTTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACtgtg > 1:884932/1‑289 (MQ=255) tgGCCTCTGGCTGTCATCTCTGTGCTGTTAGTGTTTGGCTATTTCTTCTCCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGTATTACTAATTCTTTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGtt > 1:913990/1‑287 (MQ=255) ccTCTGGCTGTCATCTCTGTGCTGTTAGTGTTTGGCTATTTCTTCTCCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGTATTACTAATTCTTTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGt > 1:1025015/1‑289 (MQ=255) ctctGGCTGTCATCTCTGTGCTGTTAGTGTTTGGCTATTTCTTCACCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGTATTACTAATTCTTTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGtt < 1:370351/289‑1 (MQ=255) tGGCTGTCATCTCTGTGCTGTTAGTGTTTGGCTATTTCTTCTCCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCCAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGGATTCCTAATTCTTTACTTCATTCCTGGTATTGGGCAAACGGTGGCGCCGGTACTTTGGTTCCTGtttg > 2:524086/1‑287 (MQ=255) tGGCTGTCATCTCTGTGCTGTTAGTGTTTGGCTATTTCTTCTCCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGTATTACTAATTCTTTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACt < 2:19757/274‑1 (MQ=255) tGGCTGTCATCTCTGTGCTGTTAGTGTTTGGCTATTTCTTCTCCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGTATTACTAATTCTTTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGACGGTACTGTGGTTCCTGTTTa > 1:415439/1‑288 (MQ=255) tGGCTGTCATCTCTGTGCTGTTAGTGTTTGGCTATTTCTTCTCCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCGCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGCTACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCACGCAATTGTATTACTAATTCTTTACTTCATCCCTGCTATTGGGCAAACCTTCGCGCCGGTACTGGTGTTCCTGtttcg > 2:406062/1‑287 (MQ=255) 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ctcCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGTATTACTAATTCTTTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTCCTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTc > 2:1160363/1‑289 (MQ=255) ctcCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGACGCGAATCATGAAACGCGAATGGAAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCCATTGTATTACTAATTCTTTACTTCCTCCCTTGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTCATGTGGTTCACGTTTAGCCCCTGGACGTTACGCATCCAGTATTTCGGTTTCCCCtt > 2:1017476/1‑288 (MQ=255) aaCTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGTATTACTAATTCTTTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAg > 2:675828/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |