New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4436129 | 135 (1.070) | 3 (0.020) | 3/504 | NT | 2.0% | coding (437/1944 nt) | cpdB | 2':3'‑cyclic‑nucleotide 2'‑phosphodiesterase |
? | NC_000913 | = 4436330 | 163 (1.310) | coding (236/1944 nt) | cpdB | 2':3'‑cyclic‑nucleotide 2'‑phosphodiesterase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
AATCTTCAGCGTCTGTTTTTTTCCGTCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCACCTGC‑TTTTAATCCTTTCGCCGACATGTAATCGGCCAGCGGACTC‑CCCTGAATCAAATCGCCGTTATCAACCAGTACGCTGTTTTTCACTTCATTGCGGGCATCGTTAATCAGGCTTGCCGTACGTACCAGTCCGAATTTTTCCGTGGCGGTGTCTTTGTAATAATCGAAATCCATCATGTTGCTATGCAGATCAGTGGTTTCCATGATACGCAGATCGACCGTCGCTGCATTCACACTGGCGGCAATCAGCGTGGCCAGGAGCGTTGCGCTAAACTTAATCATCAGGGACATCCTTTTATCATCGGGAATACGAAAGAAAAGGGAGAATAAACGTC > NC_000913/4436044‑4436618 | aaTCTTCAGCGTCTGTTTTTTTCCGTCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTTAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGTGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCACCTGC‑TTTTAATCCTTTCGCCGACATGTAATCGGCACGCGGAATC‑CCCTga < 2:351862‑M2/289‑3 (MQ=255) 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tCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCCGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCACCTGC‑TTTTAATCCTTTCGCCGACATGTAATCGGCCAGCGGACTC‑CCCTGAATCAAATCGCCGTTATCAACCAGt > 1:283703/1‑288 (MQ=255) tttATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCACCTGC‑TTTTAATCCTTTCGCCGACATGTAATCGGCCAGCGGACTC‑CCCTGAATCAAATCGCCGTTATCAACCAGTACg < 1:159133/289‑1 (MQ=255) tttAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCACCTGC‑TTTTAATCCTTTCGCCGACATGTAATCGGCAAGCGGACTC‑CCCTGAATCAAATCGCCGTTATCAACCAGTACGATTCTTTTCACTTCATTGccg > 2:631567/1‑287 (MQ=255) 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AATCTTCAGCGTCTGTTTTTTTCCGTCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCACCTGC‑TTTTAATCCTTTCGCCGACATGTAATCGGCCAGCGGACTC‑CCCTGAATCAAATCGCCGTTATCAACCAGTACGCTGTTTTTCACTTCATTGCGGGCATCGTTAATCAGGCTTGCCGTACGTACCAGTCCGAATTTTTCCGTGGCGGTGTCTTTGTAATAATCGAAATCCATCATGTTGCTATGCAGATCAGTGGTTTCCATGATACGCAGATCGACCGTCGCTGCATTCACACTGGCGGCAATCAGCGTGGCCAGGAGCGTTGCGCTAAACTTAATCATCAGGGACATCCTTTTATCATCGGGAATACGAAAGAAAAGGGAGAATAAACGTC > NC_000913/4436044‑4436618 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |