New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 2894652 | 174 (1.020) | 4 (0.020) | 4/502 | NT | 2.6% | coding (457/576 nt) | ygcP | putative antiterminator regulatory protein |
? | NC_000913 | = 2894931 | 127 (0.750) | coding (849/861 nt) | ygcQ | putative flavoprotein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
TTTATTCATGTTGATTTGCTGGAAGGCGCGTCAAATAAAGAAGTCGTTATTCAGTTTTTGAAACTGGTGACCGAGGCGGACGGCATTATCAGTACCAAAGCCTCAATGTTGAAAGCGGCAAGAGCGGAAGGTTTTTTCTGTATTCATCGCCTGTTTATTGTTGATTCAATTTCGTTTCACAACATTGATAAGCAAGTTGCGCAATCGAATCCGGATTGTATTGAGATCCTGCCAGGCTGTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTGGGCTGGTGTGCGATGAAGAAGATGCGCGTAATGCGATTAACGCGGGTGTCGTGGCGCTTTCCACCACGAATACCGGGGTCTGGACGTTAGCGAAAAAATTACTTTGACGGGATAATCGTAACCAATTGAATTTGGTTTGATTTGTAGGCCGCACGCCACATCCGACATTCAGCGCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAAGTCCCCAGGCCAGAACCGTAGGCAGGATCATCCGGCAACACGTTATTGGCAATCTGCGT > NC_000913/2894367‑2894935 | tttATTCATGTTGATTTGCTGGAAGGCGCGTCAAATAAAGAAGTCGTTATTCAGTTTTTGAAACTGGTGACCGAGGCGGACGGCATTATCAGTACCAAAGCCTCAATGTTGAAAGCGGCAAGAGCGGAAGGTTTTTTCTGTATTCATCGCCTGTTTCTTGTTGATTCAATTTCGTTTCACAACATTGATAAGCAAGTTGCGCAATCGAATCCGGATTGTATTGAGATCCTGCCAGGCTGTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACCGAGAAAATCCGTCAACCGCTGa > 1:438811/1‑289 (MQ=255) tttATTCATGTTGATTTGCTGGAAGGCGCGTCAAATAAAGAAGTCGTTATTCAGTTTTTGAAACTGGTGACCGAGGCGGACGGCATTATCAGTACCAAAGCCTCAATGTTGAAAGCGGCAAGAGCGGAAGGTTTTTTCTGTATTCATCGCCTGTTTATTGTTGATTCAATTTCGTTTCACAACATTGATAAGCAAGTTGCGCAATCGAATCCGGATTGTATTGAGATCCTGCCAGGCTGTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGa > 2:468217/1‑289 (MQ=255) ttCATGTTGATTTGCTGGAAGGCGCGTCAAATAAAGAAGTCGTTATTCAGTTTTTGAAACTGGTGACCGAGGCGGACGGCATTATCAGTACCAAAGCCTCAATGTTGAAAGCGGCAAGAGCGGAAGGTTTTTTCTGTATTCATCGCCTGTTTATTGTTGATTCAATTTCGTTTCACAACATTGATAAGCAAGTTGCGCAATCGAATCCGGATTGTATTGAGATCCTGCCAGGCTGTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGc < 2:125365/289‑1 (MQ=255) ttCATGTCGATTTGCTGGAAGGCGCGTCAAATAAAGAAGTCGTTATTCAGTTTTTGAAACTGGTGACCGAGGCGGACGGCATTATCAGTACCAAAGCCTCAATGTTGAAAGCGGCAAGAGCGGAAGGTTTTTTCTGTATTCATCGCCTGTTTATTGTTGATTCAATTTCGTTTCACAACATTGATAAGCAAGTTGCGCAATCGAATCCGGATTGTATTGAGATCCTGCCAGGCTGTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTg > 1:23390/1‑288 (MQ=255) cATGTTGATTTGCTGGAAGGCGCGTCAAATAAAGAAGGCGTTATTCAGTTTTTGAAACTGGTGACCGAGGCGGACGGCATTATCAGTACCAAAGCCTCAATGTTGAAAGCGGCAAGAGCGGAAGGTTTTTTCTGTATTCATCGCCTGTTTATTGTTGATTCAATTTCGTTTCACAACATTGATAAGCAAGTTGCGCAATCGAATCCGGATTGTATTGAGATCCTGCCAGGCTGTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCg < 1:1236194/289‑1 (MQ=255) gTTGATTTGCTGGAAGGCGCGTCAAATAAAGAAGTCGTTATTCAGTTTTTGAAACTGGTGACCGAGGCGGACGGCATTATCAGTACCAAAGCCTCAATGTTGAAAGCGGCAAGAGCGGAAGGTTTTTTCTGTATTCATCGCCTGTTTATTGTTGATTCAATTTCGTTTCACAACATTGATAAGCAAGTTGCGCAATCGAATCCGGATTGTATTGAGATCCTGCCAGGCTGTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTg > 2:621995/1‑289 (MQ=255) tttGCTGGAAGGGGCGTCAAATAAAGAAGTCGTTATTCAGGTTTTGAAACTGGTGACCGAGGCGGACGGCATTATCAGTACCAAAGCCTCAATGTTGAAAGAGGCAAGAGCGGAAGGTTTTTTCTGTATTCATCGCCTGTTTATTGTTGATTCAATTTCGTTTCACAACATTGAGAAGCAAGTTGCGCAATCGAATCCGGATTGTAATGAGATCCTGCCAGGCTGTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCGGATTGCCGGTGGGCTg < 1:1023526/289‑1 (MQ=255) 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aTTATCAGTACCAAAGCCTCAATGTTGAAAGCGGCAAGAGCGGAAGGTTTTTTCTGTATTCATCGCCTGTTTATTGTTGATTCAATTTCGTTTCACAACATTGATAAGCAAGTTGCGCAATCGAATCCGGATTGTATTGAGATCCTGCCAGGCTGTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTGGGCTGGTGTGCGATGAAGAAGATGCGCGTAATGCGATTAACGCGGGTGTCGTGGCGCTTTCCACCACGAATAcc < 1:797078/288‑1 (MQ=255) aTTATCAGTACCAAAGCCTCAATGTTGAAAGCGGCAAGAGCGGAAGGTTTTTTCTGTATTCATCGCCTGTTTATTGTTGATTCAATTTCGTTTCACAACATTGATAAGCAAGTTGCGCAATCGAATCCGGATTGTATTGAGATCCTGCCAGGCTGTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTGGGCTGGTGTGCGATGAAGAAGATGCGCGTAATGCGATTAACGCGGGTGTCGTGGCGCTTTCCACCACGAATAcc < 1:46890/288‑1 (MQ=255) aTTATCAGTACCAAAGCCTCAATGTTGAAAGCGGCAAGAGCGGAAGGTTTTTTCTGTATTCATCGCCTGTTTATTGTTGATTCAATTTCGTTTCACAACATTGATAAGCAAGTTGCGCAATCGAATCCGGATTGTATTGAGATCCTGCCAGGCTGTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTGGGCTGGTGTGCGATGAAGAAGATGCGCGTAATGCGATTAACGCGGGTGTCGTGGCGCTTTCCACCACGAATACCg < 1:621995/289‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |