| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 3220398 | 179 (1.090) | coding (905/1380 nt) | patA | putrescine:2‑oxoglutaric acid aminotransferase, PLP‑dependent | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
AGCGCTGAAGCTGGCGAAAGCTTACCAGTCACCGCGCGGCAAGTTTACTTTTATTGCCACCAGCGGCGCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAGCGCTCGGCGGCGGCGTGATGCCGATTGGCGCGACCATCGCCACTGAAGAGGTGTTTTCAGTTCTGTTCGACAACCCATTCCTGCATACCACCACCTTTGGCGGCAACCCGCTGGCCTGTGCGGCGGCGCTGGCGACC > NC_000913/3219961‑3220531 | gtcgcTGAAGCTAGCGAAAGCGTCCCCGTGCCCGGCCGGCAAGGTTACTTTGTTGGCCACCAGGGGCGCGTTCCACAGTAAACCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAACCGACCTTCCGCTAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATCTCGGAGCCATGCGCACGGCTCTTGACGCGTGCAAAAAAACCGGTGATGCTGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGc < 2:1107928/287‑1 (MQ=255) cgcTGAAGCTGGCGAAAGCTTACCAGTCACCGCGCGGCAAGTTTACTTTTATTGCCACCAGCGGCGCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCCGGGTGAAGGTGGCGTACTTCTGCCGCCGCCGGGCTa > 2:382486/1‑289 (MQ=255) gcTGAAGCTGGCGAAAGCTTACCAGTCACCGCGCGGCAAGTTTACTTTTATTGCCACCAGCGGCGCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGc < 1:884128/286‑1 (MQ=255) tGGCGACAGCGTAACACTAACCGCGCGGCACGTTTACCTTTAGGACCACATCCGACGCATTCCACGGGAAATCCCTTGCCGGGCTGGCGGCCACGGCGAGATAGTCCGTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGGCATGTTCCGTTTGGCAATATCGAAGCTATGCGAACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGCTGATGTGACTGCGGTGTGCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccgc < 2:688546/289‑1 (MQ=255) tGGCGAAAGCTTACCAGTCACCGCGCGGCAAGTTTACTTTTATTGCCACCAGCGGCGCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccgc < 2:849977/289‑1 (MQ=255) tGGCGAAAGCTTACCAGTCACCGCGCGGCAAGTTTACTTTTATGGCCACCAGCGGCGCGTTCCCCGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccgc < 1:872857/289‑1 (MQ=255) ggCGGAAGCTTGCGAGTCAGCGCGCGGCGAGTGTATTTTTATGGCCACGAGCGGTGGGTGCCACGGTAAAGCACTTGGGGGGCTGTCGGCCAGGGCGAAATCGCCCTCCCGAAAACCGTTTATGCGGTTAGTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGTCAAGATCGAAGCCATGCGCACGGCGCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCTGTGTTCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCTTAATTCTGCCGCTGCCGGGATATCTCAccgc < 2:209674/288‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |