| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,304,680 | T→C | 10.5% | intergenic (+287/+428) | eco → / ← mqo | ecotin, a serine protease inhibitor/malate dehydrogenase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,304,680 | 0 | T | C | 10.5% | 154.0 / 6.1 | 62 | intergenic (+287/+428) | eco/mqo | ecotin, a serine protease inhibitor/malate dehydrogenase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/25); new base C (3/4); total (32/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.99e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AACTGCCGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGC‑GACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACA‑CCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTG > NC_000913/2304393‑2304967 | aacggcgttGAAGGGCGGCACCCCGTAGGTCAGCCAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGC‑GACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTa < 1:1413904/281‑1 (MQ=255) ccGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGC‑GACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCGGCCTACCCCGCTGTGAAGTGCCCCACCCCGTAGGGCGGATACGGCGGGTACGCCCCATCCGACATCTAAA‑Gc > 1:261924/1‑288 (MQ=255) ccGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGC‑GACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAAC‑Gc > 1:36174/1‑288 (MQ=39) tGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGC‑GACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTGCCCCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGCCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGCGCCGGTTGCCTGATGCCACCCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGCCACCCCGTAAGCCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACCTCCAAC‑Gccagacacc > 2:210576/1‑281 (MQ=11) gcgagtgcAGACAAGGCGGCCACGCCGCATCCACCATCCAACGCCCGACGCGGTGGCCTGATGG‑CACGCTGGCGCGTCGTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATg < 2:810497/282‑1 (MQ=14) cAAGGCGGTGACACCGCGACCGTCGTCCAACGCCCGGGCCGGTTGTCTGATGC‑GACGCTGGCGCGTCGTATGAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCCCCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCATCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTgg < 2:646835/287‑1 (MQ=14) cAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGC‑GACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTgg < 1:880561/287‑1 (MQ=255) cgcgccgcATCGGCAACCCACCGCCCGAGCGGGTGGCC‑GAAGCGGACGCTGGAGCGTCTGATCAGGCCGACACCGCCGGGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAt < 2:103053/286‑1 (MQ=14) caggccgcAGCCGACATCCATGGCCCGGGCCGGTGGCCGGAGGC‑GACGCTGGCGCGTCGTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAt < 2:1057568/285‑1 (MQ=255) cgccgcATCAGACACCAAACGCCCGGGCGGGTGCGCTGTTGC‑GAGGCTGGCGCGGCTGAACAGGCCTACACCGCTGTGAAGGGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGAGGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAg < 2:513139/289‑1 (MQ=14) 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cTGATGC‑GACCGTGGCGCGTCATAGCAGGCCTACACCGAGGTGAAGTGCAGCACCCCGTATGTCAGACAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCGGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAgg < 1:456524/288‑1 (MQ=11) ggaggcgggCGCGCCGTAGCGGGCCTAAACCGCCGTGAAGGGCGGAACCCCGTAGGTCGGACAAGGCGGTCACGCAGCATCCGACAGCAAACGCCCGGGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGAt < 2:683937/281‑1 (MQ=11) agtccTCCACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCTTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTGGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCg < 1:387089/286‑1 (MQ=255) tACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGaa > 1:1422798/1‑240 (MQ=40) aaacCGCTGTTAAGGGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAATGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATcc < 1:1410807/287‑1 (MQ=255) cacCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGa > 1:703791/1‑260 (MQ=39) cacCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGACCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCAGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGCAACTCCGTAGGATGGATAAGGCGGCTCCGCCGCATCCgccctg > 1:343667/1‑282 (MQ=11) cTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATCAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTCTCAGGCCTACACCGCTGTGACATGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGt > 1:1201461/1‑288 (MQ=255) cTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCtgtg < 1:715045/231‑1 (MQ=40) cTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCtgtg > 2:715045/1‑231 (MQ=40) cTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACACCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTAAGCCGCATCCGACATCCAACGt > 1:633386/1‑288 (MQ=255) cTGGGAAGTTCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGGGCCGGTTGCCTGATGCGACTCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAAGCCTaca < 1:36993/224‑1 (MQ=11) tGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAt < 2:137017/205‑1 (MQ=40) tGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAt > 1:137017/1‑205 (MQ=40) tGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCgg > 2:1488309/1‑289 (MQ=255) 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ttGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACA‑CCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGt > 1:184817/1‑289 (MQ=39) gCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCACGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGCTGCGACGCTGGCGCGCCTTATCAGGCCTACACTGCTGTGAAGTGCTCCACCCAGTAGGTTGGGTAAGGCCGTTCCGCCGCATCCGACATCCTACGTCCCACACGGTTGCCTCATCCCACGCTGACGCGTGTTATCAGCCCAACC‑CCACTGTGCATCTCTCCCCCCCAAAGCTCGGAt > 2:31239/1‑289 (MQ=11) ccTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACTCCGGAGGTTGCCTAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGCTGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCC‑ACACCCGCTTGCATGTTCTCCACCCCGTAGGCTGGATAAGGCGGATACACCGCATACgca > 2:598759/1‑286 (MQ=11) cTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACA‑CCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt > 2:344010/1‑265 (MQ=25) cTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACA‑CCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt < 1:344010/265‑1 (MQ=25) tGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACA‑CCGCtgtg < 2:503672/223‑1 (MQ=255) tGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACA‑CCGCtgtg > 1:503672/1‑223 (MQ=255) tAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTCATCAGGCCTCCC‑CCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCCTAGGTCGGCCAAGGCGGCTACGCCGCATCCGACATCTACCGCCCACGCCGGTTGCCTGATGCg > 2:467513/1‑289 (MQ=255) tAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACAGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTCCA‑CCGCTGTGACGTGCTACACCCCGTCGGTCGGATAAGTCCGTTCCGCCGCCCCCGACATCTCAACCCCACCCCGGTCGCCttaccag > 2:531302/1‑283 (MQ=14) aTAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACA‑CCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTTATGCGACGCTGgc > 1:932584/1‑289 (MQ=255) gCGGTAACGCGCCATCCGACGTCGAAC‑GCCCCAGCCGGTTGCCGGATGGGACGCTGGCGCGTCTGATCAGGCCTAAACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGGAGGTTGGAGAGGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACA‑CCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGt < 2:1469801/288‑1 (MQ=11) tACGCCGTCTTCGACACCCGAC‑CCCCGAGCGTGTTGCCGGATGCACCGCTGGCGCGTCTCAGCAGGCCTACACCGCGGTGAAGGGCGCCACCCCGTAGGTGGGAGAAGGAGGTTAGGCCGCAGCCGAAATCAAAAGACCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACA‑CCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAt < 2:1315298/288‑1 (MQ=11) tACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGa > 2:1047612/1‑127 (MQ=31) cTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACA‑CCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCtggc > 1:1482232/1‑287 (MQ=40) | AACTGCCGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGC‑GACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC‑GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACA‑CCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTG > NC_000913/2304393‑2304967 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |