| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | NC_000913 | 4,606,167 | Δ236 bp | 5.1% | leuP–leuQ | leuP, leuQ | |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4606166 | 72 (0.500) | 3 (0.030) | 3/342 | NT | 5.1% | intergenic (‑1/+34) | leuV/leuP | tRNA‑Leu/tRNA‑Leu |
| ? | NC_000913 | 4606403 = | 64 (0.670) | intergenic (‑2/+266) | leuQ/rsmC | tRNA‑Leu/16S rRNA m(2)G1207 methyltransferase, SAM‑dependent | |||||
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ACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCACAGTCATCTTACTTTTTTTGATATCGCCTCGTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGAACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGG‑CGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCGAGATAATTAACCTTTCTTCGCCTGG > NC_000913/4606121‑4606687 | tcgtcagatcagtggcggattgtcattctgatgggattagtattgacgccgatgatgctgtatcacaaacagttgcggcattacattttgctaccatcgtgcctggcacttattgctggcatcatgctgatgataatgaatttgaatcagggatgaaaaatcaaggaagaaacaagaaaggaagtaaagataattggtgcgaggggggggacttgaacccccacgtccgtaaggacactaacacctgaagctagcgcgtctaccaattccgccaccttcgcaTACCATc > 1:953764‑M2/283‑289 (MQ=255) gAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCTACCTTCGCACAGTCATCTTACTTTTTTTGATATCGCCTCGTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCTCCACGTCCGTAAGAACACTAACACCTGAAGCTAGAGCGTCTACCAATGCAGCTACCTTCGCTCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACTCACACGTCCGTAACGACACAAACACACGAAGATAGAGCGGCTACCAATACCGCCACATTCGCATACCATCagtcttttaa > 1:329416/1‑280 (MQ=255) gAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCACAGTCATCTTACTTTTTTTGATATCGCCTCGTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGAACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTCCGAGGGGGGGGCCTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCCCGTCCACCAATTCCGCCACCTTCGCCTCCCATCAATACTTaaa > 1:361506/1‑289 (MQ=255) tCTACCAATTCCGCCACCTTCGCACAGTCATCTTACTTTTTTTGATATCGCCTCGTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCTCCACGTCCGTAAGAACACTAACACCTGACGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCACAGTGCGCACAATAACAAAGGGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAAACCTCACGTCCGTAAGGACAGTAACAACTGAAGCTAGCGCGTCTACAAATTCAGCCACCTTCGCATACCATCAATTTTTAAAAAGAATTGCTa > 1:1298934/1‑288 (MQ=25) ccAATTCCGCCACCTTCGCACAGTCCGCTTACTTTTTTTTATTTCGCCGCGTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGAACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACg < 1:151889/289‑1 (MQ=255) aTTCCGCCACCTTCTCACAGTCATCTTACTTTTTTTGGTATCGCGTTGTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGAACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAg < 1:244441/289‑1 (MQ=255) ccGCGACCTACGCACAGTCATCTTACTTTTTTTGAGATAGCCGCGGTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGAACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGg‑cg < 1:285616/289‑1 (MQ=255) 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ttttGATATCGCCTCGTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGAACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGGCTCGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACGATCAATTCTTataaa > 1:358082/1‑240 (MQ=255) tttGATATCGCCTCGTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGAACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCACTATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGCAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCTCCACCTTCGCATACCATAAATTCTTAAAAAGACTTGCTACACCGGCGG‑CGCATTCGAGTGGTTTTCAGATTTTCGTCacg > 2:583366/1‑287 (MQ=25) atCGCCTCGTTTGGTTCGAGGGGGGGGACTTGACCCCCCACGACCGTAAGAACACTAACACCGGAAGCTAGGGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCTAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGG‑CGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTaa < 2:74728/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |