| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | 3 (0.030) | 3/520 | NT | 4.6% | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1157805 = | 62 (0.580) | intergenic (+231/‑64) | ycfH/ptsG | putative DNase/fused glucose‑specific PTS enzymes: IIB component/IIC component | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
AGGTCTGGAAAGATGAAGCCCCAGGAGATATTTCTATCAACCCTGGGGCTGCCACTCCAAACCCGAACAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCATGGGCTCAGCTCCATGACGTTGCAACATTATCTGACGTGGCT > NC_000913/607725‑608292 | aGGTCTGGAAAGATGAAGCCCCAGGAGATATTTCTATCAACCCTGGGGCTGCCACTCCAAACCCGAACAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTTCGGGGATTAATCCCAtt > 2:388039/1‑288 (MQ=255) 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aTGAAGCCCCAGGAGATATTTCTATCAACCCTGGGGCTGCCACTCCAAACCCGAACAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTa > 1:361732/1‑289 (MQ=255) aGCCCCAGGAGATATTTCTATCAACCCTGGGGCGGCCACTCCCAACCCGAACAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTTGAATGTAGTCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGTTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTTAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTTGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAggg < 1:115673/289‑1 (MQ=255) ccccAGGAGGTATTGCTATCAACCCTGTGGCTGCCACTCCAAACCCGAACAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGTGCTGGTATGTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGtt < 2:935032/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |