Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 348,458 | IS5 (+) +4 bp | 12.2% | intergenic (‑15/‑221) | prpR ← / → prpB | propionate catabolism operon regulatory protein/2‑methylisocitrate lyase |
New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 348458 = | 104 (1.050) | intergenic (‑15/‑224) | prpR/prpB | propionate catabolism operon regulatory protein/2‑methylisocitrate lyase | |||||
* | ? | NC_000913 | = 275149 | NA (NA) | 9 (0.090) | 9/514 | NT | 7.8% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | = 348461 | 104 (1.060) | intergenic (‑18/‑221) | prpR/prpB | propionate catabolism operon regulatory protein/2‑methylisocitrate lyase |
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CCGCTCGGTTTAATCAAAATAACTGGCACTGACAGGCGGCTTTTCAGGTACGCGCCGTTAGAGCCAGCCGCGATGATGGCGTCACAGCGTTCGTTTGCCAGTTTCTTGCGGATGTAGGTCACTGCTTTTTCAAAGCCAAGCTGAATAGGGGTAATGTTCGCCAGGTGATCAAACTCGAGGCTGATATCGCGAAACAGCTCGAACAGGCGCGTTACAGATACCGTCCAGATAACCGGTTTGTCGTCATTAAGCCGTGGTGGATGTGCCATAGCGCACCGCAAAGTTAAGAAACCGAATATTGGGTTTAGTCTTGTTTCATAATTGTTGCAATGAAACGCGGTGAAACATTGCCTGAAACGTTAACTGAAACGCATATTTGCGGATTAGTTCATGACTTTATCTCTAACAAATTGAAATTAAACATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGGGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGATTGT > NC_000913/348175‑348749 | ccGCTCTGTTTAATCAAAAGAACTGGCGCTGCCAGGCGGCTTTTCAGGTACGCGCCGTTAGCGCCAGCCGCGATGAGGGCGTCACAGCGTTCGTTTGCCAGTTTCTTGCGGATGTAGTTCACTGCTTTTTCAAAGCCAAGCTGAATAGGGGTAATGTTCGCCAGGTGATCAAACTCGAGGCTGATATCGCGAAACAGCTCGAACAGGCGCGTTACAGATACCGTCCAGATAACCGGTTTGTCGTCATTAAGCCGTGGTGGATGTGCCATAGCGCACCGCAAAGTTAAg > 2:613831‑M2/1‑287 (MQ=255) ccGCTCGGTTTAATCAAAATAACTGGCACTGACAGGCGGCTTTTCAGGTACGCGCCGTTAGAGCCAGCCGCGATGATGGCGTCACAGCGTTCGTTTGCCAGTTTCTTGCGGATGTAGGTCACTGCTTTTTCAAAGCCAAGCTGAATAGGGGTAATGTTCGCCAGGTGATCAAACTCGAGGCTGATATCGCGAAACAGCTCGAACAGGCGCGTTACAGATACCGTCCAGATAACCGGTTTGTCGTCATTAAGCCGTGGTGGATGTGCCATAGCGCACCGCAAAGTTAAg > 2:77062‑M2/1‑287 (MQ=255) cTCGGTTTAATCAAAATAACTGGCACTGACAGGCGGCTTTTCAGGTACGCGCCGTTAGAGCCAGCCGCGATGATGGCGTCACAGCGTTCGTTTGCCAGTTTCTTGCGGATGTAGGTCACTGCTTTTTCAAAGCCAAGCTGAATAGGGGTAATGTTCGCCAGGTGATCAAACTCGAGGCTGATATCGCGAAACAGCTCGAACAGGCGCGTTACAGATACCGTCCAGATAACCGGTTTGTCGTCATTAAGCCGTGGTGGATGTGCCATAGCGCACCGCAAAGTTAAGaaa > 1:399365/1‑288 (MQ=255) cTCGGTTTAATCAAAATAACTGGCACTGACAGGCGGCTTTTCAGGTACGCGCCGTTAGAGCCAGCCGCGATGATGGCGTCACAGCGTTCGTTTGCCAGTTTCTTGCGGATGTAGGTCACTGCTTTTTCAAAGCCAAGCTGAATAGGGGTAATGTTCGCCAGGTGATCAAACTCGAGGCTGATATCGCGAAACAGCTCGAACAGGCGCGTTACAGATACCGTCCAGATAACCGGTTTGTCGTCATTAAGCCGTGGTGGATGTGCCATAGCGCACCGCAAAGTTAAGaaa > 1:754478/1‑288 (MQ=255) 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ttttCAGGTACGCGCCGTTAGAGCCAGCCGCGATGATGGCGTCACAGCGTTCGTTTGCCAGTTTCTTGCGGATGTAGGTCACTGCTTTTTCAAAGCCAAGCTGAATAGGGGTAATGTTCGCCAGGTGATCAAACTCGAGGCTGATATCGCGAAACAGCTCGAACAGGCGCGTTACAGATACCGTCCAGATAACCGGTTTGTCGTCATTAAGCCGTGGTGGATGTGCCATAGCGCACCGCAAAGTTAAGAAACCGAATATTGGGTTTAGTCTTGTTTCATAATTGTTGCa < 1:74358/289‑1 (MQ=255) tgctgaaaaacgataaccaactggcgatgttattcacgctggccaacctgtttcgggcggaccaaatgatacgtcagtgggagagatctcactaaaaactggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAAACCGAATATTGGGTTTAGTCTTGTTTCATAATTGTTGCAAt > 2:834905‑M2/242‑289 (MQ=255) aCGCGCCGTTAGAGCCAGCCGCGATGATGGCGTCACATCGTTCGTTTGCCAGTTTCTTGCGGATGTAGGTCACTGCTTTTTCAAAGCCAAGCTGAATAGGGGGAATGTTCGCCAGGTGATCAAACTCGAGGCTGATATCGCGAAACAGCTCGAACAGGCGCGTTACAGATACCGTCCAGATAACCGGTTTGTCGTCATTAAGCCGTGGTGGATGTGCCATAGCGCACCGCAAAGTTAAGAAACCGAATATTGGGTTTAGTCTTGTTTCATAATTGTTGCAATGAAAcg < 2:260669/288‑1 (MQ=255) 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aGAAACCGAATATTGGGTTTAGTCTTGTTTCATAATTGTTGCAATGAAACGCGGTGAAACATTGCCTGAAACGTTAACTGAAACGCATATTTGCGGATTAGTTCATGACTTTATCTCTAACAAATTGAAATTAAACATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGGGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGAttgt > 2:883958/1‑289 (MQ=255) | CCGCTCGGTTTAATCAAAATAACTGGCACTGACAGGCGGCTTTTCAGGTACGCGCCGTTAGAGCCAGCCGCGATGATGGCGTCACAGCGTTCGTTTGCCAGTTTCTTGCGGATGTAGGTCACTGCTTTTTCAAAGCCAAGCTGAATAGGGGTAATGTTCGCCAGGTGATCAAACTCGAGGCTGATATCGCGAAACAGCTCGAACAGGCGCGTTACAGATACCGTCCAGATAACCGGTTTGTCGTCATTAAGCCGTGGTGGATGTGCCATAGCGCACCGCAAAGTTAAGAAACCGAATATTGGGTTTAGTCTTGTTTCATAATTGTTGCAATGAAACGCGGTGAAACATTGCCTGAAACGTTAACTGAAACGCATATTTGCGGATTAGTTCATGACTTTATCTCTAACAAATTGAAATTAAACATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGGGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGATTGT > NC_000913/348175‑348749 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |