| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| MC JC | NC_000913 | 1,299,499 | Δ1,199 bp | 100% | intergenic (+254/‑485) | ychE → / → oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | NC_000913 | 1299499 | 1300697–1299501 | 3–1199 | 70 [0] | [0] 71 | ychE/oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 1299498 | 0 (0.000) | 66 (0.670) | 52/508 | NT | 100% | intergenic (+253/‑1684) | ychE/oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| ? | NC_000913 | 1300698 = | 0 (0.000) | intergenic (+1453/‑484) | ychE/oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
CAAGCGACAGTTCGGCTTCGTGAAAGCCAGATACAAGGGGTTGCTGAAAAACGATAACCAACTGGCGATGTTATTCACGCTGGCCAACCTGTTTCGGGCGGACCAAATGATACGTCAGTGGGAGAGATCTCACTAAAAACTGGGGATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGTCAATAAAAGAGAATTGCTTAACAATTTTGCAAAATGTATTGGCGAGTAAGAACCGCATTTGGTACTTTCCGGGCAACCGCCAGACGATTCTTTATTGGTAATGAGAATAATTAACAATTAAAGAGCGTCGCGAAAGAATAATGTG > NC_000913/1300412‑1300985 | attaaggggattttccccggcctgcttaattaattcctttcaaatgaaacggagctgccatgctccgtttacttcgtcattatttttactttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggaataggtaaaaatattcttctcaaattacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata < 2:284398‑M2/3‑1 (MQ=255) 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cctgcttaattaattcctttcaaatgaaacggagctgccatgctccgtttacttcgtcattatttttactttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggaataggtaaaaatattcttctcaaattacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAatta < 1:233797‑M2/22‑1 (MQ=255) ttaattcctttcaaatgaaacggagctgccatgctccgtttacttcgtcattatttttactttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggaataggtaaaaatatccttctcaaattacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaCTAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt > 2:722072‑M2/258‑289 (MQ=255) ttattcctgtcaagtgaaacgcagctgccatgccccggttacttcgttattatttttactttgttcccgggcagttatcaaaagcaaaaggaataggtaaaaatattcttcttaaagtacaggtagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccagcatgttattttcgccacatcataatcgtgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtcctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc < 2:664840‑M2/33‑1 (MQ=255) 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cgtcattatttttactttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggaataggtaaaaatattcttctcaatttacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggagagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac > 2:508473‑M2/213‑247 (MQ=255) cattatttttactttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggaataggtaaaaatattcttctcaaattacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAAtc > 1:347009‑M2/210‑287 (MQ=255) ttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggaataggtaaaaatattcttctcaaattacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGAc > 1:486059‑M2/197‑260 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |