| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,293,032 | IS1 (–) +8 bp | 100% | intergenic (‑110/‑488) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 59 (1.190) | 40/408 | NT | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1293039 | 0 (0.000) | intergenic (‑117/‑488) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase | |||||
| * | ? | NC_000913 | 1293032 = | 0 (0.000) | 39 (0.790) | 29/408 | NT | 100% | intergenic (‑110/‑495) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CAACAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCAC‑GAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCT‑ATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTACGAGAATTCCCTATTAAGCGAATGATGAAAAGTAGAACAGTCGCAATA > NC_000913/1292814‑1293256 | ttttggtgcgtcccgggttggaaagcggtgtaattaaacgtcaggtgccattttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTgccgc > 2:549046‑M1/220‑228 (MQ=255)tttggtgggttccgggtgaggagggggggaaggtaacctggagttgccagggttttacggcagggagagcagagatagcggtgatgtccgggggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTgccgc > 2:42062‑M1/220‑228 (MQ=255) tctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccggcagtagctgaacaggagggtcagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggaggcatcaccTTGGgccgcc < 1:628960‑M1/10‑1 (MQ=255) acaacTTTTTATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTTAAGTTTACATTCTCTTGCCTGCGCAC‑GAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTTCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggta > 2:350463‑M2/1‑224 (MQ=255) caacTTCTAATTTTTCCAACATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCAC‑GAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaa < 1:480247‑M2/228‑6 (MQ=255) tttaaTTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTTCAAATTCTCTTGCCTGCTCAG‑GAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCATTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGTAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgact > 1:699806‑M2/3‑218 (MQ=255) tttaaTTTTGCCAGCATTTCTTCCAGGGTTTTAATTGTACATTCTCTTGCCTGCCCAA‑GAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgact > 2:263174‑M2/3‑218 (MQ=255) aTTTTTCCAGTAATTCTTCCAGCGTTTCAAGTTTACATTCTTGTGCCTGCGCAC‑GAAGAATACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaa > 1:512061‑M2/1‑214 (MQ=255) tgagaaggggtgtaaggcaactgccgtggccatgttttacggaagtgagagcagagatagcgcggatgtccgggggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCa > 2:572798‑M1/202‑227 (MQ=255) agaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagcgatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagatgaacaggagggacagctgctagagacagaagccactggagcacctcaaaaacaacatcctacactcactacgtaagttggcagcatcaccCTGTGCCGCCAATAAATATCCTTTCATaa < 1:193676‑M1/29‑1 (MQ=255) agaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCACATAAATACACTTTCATaa < 1:620200‑M1/29‑1 (MQ=255) agaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacccccaaaaccccatcatacactaaaacaagaaattggcagcctcaccTTTTGCCGCCAAAAAAAATCTTTtaataa < 2:412775‑M1/29‑1 (MQ=255) tgtTTCAATTTTTCATTCTCTTGCCTG‑GCACAGAAGAGTAAGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGGTTGGCTCATTGTAGTAATCCCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtt > 2:212073‑M2/2‑192 (MQ=255) taactgcagttgccatgttttacggcagtgaaagcagagatggccctgatgtccggcggggcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGaaa > 1:133439‑M1/185‑226 (MQ=255) ctgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctccaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCCTAAAATTAACCAGAAAAGAc < 1:423619‑M1/46‑1 (MQ=255) ctgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcataaaccaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCCCCACTAAATAATATTTCTAAAAAATAAccagaaaaaaga < 2:135009‑M1/47‑5 (MQ=255) tgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGAcg > 1:315761‑M1/181‑227 (MQ=255) ggggttgccgttttttgcggcagggaaaggcgagatagcggtggggtccgggggggctttggccgttccgcccccccccgtcagtagccaaaaaggagggacagctgatagaaaaagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGAcgcg > 2:423619‑M1/180‑228 (MQ=255) gccttgtttttcggcagggacaacaaagataggcctgaggtccggcggtgcttttgccgttacgcccccccccgtcaggagctaaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcccctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCata > 2:556323‑M1/174‑227 (MQ=255) gccgtgttttacggcagggagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCata > 1:135009‑M1/174‑227 (MQ=255) gcatgtttttacggcagtgggagcagagatagcgttgatggtcggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacagaaggtacagctgatagaaacagaagccactggtgcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCata > 1:200706‑M1/174‑227 (MQ=255) atgttttacgggatggagcgcagagaatgcgcttatgtcgggcggtgcttttgccgttacgcacccccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcccctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGc > 1:167774‑M1/171‑228 (MQ=255) atgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatggccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGc > 1:579856‑M1/171‑228 (MQ=255) ctctTTCCTGAGCAC‑TAAGAGTACGGATGTTTTTCAGAATTTTAAGTTCTTCTCTCATGGTATTAATCTCAAACTTATATTGTGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATGGCCAGGAATGGAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatga > 1:674643‑M2/1‑175 (MQ=255) ctTGCCTGCGCAC‑GAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTTTgc > 1:664172/1‑171 (MQ=255) tGCCTGCGCAC‑GAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgcctt < 2:168179‑M2/227‑57 (MQ=255) taagtgagtggagtgctgatgttTTTAGAAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTTAATATTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtca > 2:319147‑M2/11‑167 (MQ=255) gcgcAC‑GAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCACAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgcact < 1:436886‑M2/228‑63 (MQ=255) cgcAC‑GAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtttagataatgcccgatgactttgtattg < 1:692958‑M2/228‑64 (MQ=255) cgcAC‑GAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgat < 1:624120‑M2/188‑24 (MQ=255) gcAC‑GAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgc < 1:136127‑M2/228‑65 (MQ=255) gcAC‑GAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgata > 2:624120‑M2/1‑164 (MQ=255) agTTCGGATTTTTTTAAAAATTTTAAGTGCTTCGATCATTGGAGTAATCTCAAATTTATATTGGGGTGGGTTGTTGAGGTAATAATAGAGCATTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccac > 2:136127‑M2/1‑156 (MQ=255) gcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcaccccaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCT‑ATTTCAACCGATGATTTCGCAGCAc < 1:622579‑M1/86‑1 (MQ=255) gATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgat < 1:259293‑M2/173‑24 (MQ=255) cgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGAcgc < 1:155811‑M1/48‑1 (MQ=255) aTTTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgata > 2:259293‑M2/1‑149 (MQ=255) ttgttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttcttgatagtggtttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcca < 2:624393‑M2/217‑72 (MQ=255) ttgttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagattatgcccgatgactttgtc < 1:319147‑M2/206‑61 (MQ=255) ttgttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAAGCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcca > 1:624393‑M2/1‑146 (MQ=255) gatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCT‑ATTTACACCGATGATTTCGCAGCAcgtaa < 1:125545‑M1/90‑3 (MQ=255) gttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATATCCAGGAATGTAAGGAATTTAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgattactttgtcatgcagctcccccgattttttgaa < 1:700941‑M2/228‑85 (MQ=255) gttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagctaatgcccgatgactttttcattcagatccaccgattttgaaa < 2:505949‑M2/227‑84 (MQ=255) gttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggaaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgcctttgtcattcagcttcaccgattttgagaa < 1:264240‑M2/228‑85 (MQ=255) cggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAAAAAAGACGCGGCCTATAGCCCA‑ATTTACACCGAGGATTTCGAAACACGTGAGGGTaaa < 2:484567‑M1/97‑1 (MQ=255) tacccacccccccctacagtactgaacaggagggacaactgataaaaacagaacccactggagcaccccaaaaaccccataatacaataaatcaataagttggcagcaacaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCT‑ATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTc > 2:255068‑M1/114‑227 (MQ=255) ttttaaacttaTTTTGGGGTGGTTTGTTGAGGGAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTAAAAATTGTTCTTTATGTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgct > 2:518194‑M2/5‑109 (MQ=255) tctcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttctgttcagataatgcccgatgactttgtcatcgagatacaccgtttttgagaacgacatccacttccgtcccagccgtgccaggtggt < 2:587664‑M2/228‑120 (MQ=255) gtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACCCGGCATATAGTCCT‑ATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTtatggtga < 1:479273‑M1/128‑4 (MQ=255) tcctacttaTATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGACGggcaatgactccaacttattgatagggttttatgttcagataatgcccgatgactttttcatgaagctcccccgattttgagaaagaccgcgactcccttccaggccgtgccagggtcttg < 2:400337‑M2/224‑122 (MQ=255) tcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATAAAGCCCT‑ATTTCCACCGAGGATTTCTCAGCACGTGAGGCTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTTTGGGgag < 2:494157‑M1/129‑1 (MQ=255) aaattttgtttggggtggttTGTTGATGTAATAATAATGTCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGAAATGTAAGGAATTCAAATTTGTTCTTTATTTTGTGCAGgggaatgacgccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgccggatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcct > 2:205087‑M2/10‑105 (MQ=255) aaaCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggggctgcc < 1:205087‑M2/227‑123 (MQ=255) aaaCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgactt < 2:625357‑M2/201‑97 (MQ=255) aaaCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatccagctccaccgattttgagaacgatag < 2:182510‑M2/195‑91 (MQ=255) gtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGa < 1:212918‑M1/40‑1 (MQ=255) aaCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgccttc > 1:625357‑M2/1‑104 (MQ=255) tagctgaaaaggaggaacagctgaaagaaacagaagccactggagcccctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGaa > 2:212918‑M1/96‑136 (MQ=255) ttttttggggGGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTTGGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagat > 2:480247‑M2/5‑100 (MQ=255) atatTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccatccgtgccaggtgcggcctccgat < 1:429417‑M2/227‑129 (MQ=255) aacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCT‑ATTTACACCGATGATTTCGCAGAACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATggggagattttggttg < 2:504059‑M1/139‑8 (MQ=255) gtggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttttcatgcacctccaccgtttttgagaactacagcgacttccttccaggccgtccccggtgctgcctaagcttcaggttat < 2:356950‑M2/228‑138 (MQ=255) gtggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagcttcaggtta < 1:547521‑M2/227‑137 (MQ=255) gtggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgctt < 1:317540‑M2/121‑31 (MQ=255) gTAATAATAGCACCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgacttcaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattc > 1:356950‑M2/1‑78 (MQ=255) aaaacagaagccactggagcacctcaaaaaccccataaaaacctaaatcagtaagttggcagcatccccTTGGGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGAGGCATATAGCCCT‑ATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGtct > 2:628960‑M1/70‑227 (MQ=255) aaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCT‑ATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGtctt > 1:484567‑M1/69‑227 (MQ=255) aagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCT‑ATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTAAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGGGATTATCGTAGGCTGCCGACCTTTCAGTCTTCTGTAtt < 1:63202‑M1/166‑1 (MQ=255) ccctggagcaccccaaaaacaccaccaaacaataaatcagtaagttggaagcatcaccTTGGGCCGCCAATAAATATCTTTTCAAAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCT‑ATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTATTAGtt > 2:351022‑M1/59‑228 (MQ=255) ccTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgc < 1:170008‑M2/217‑152 (MQ=255) ccTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagata < 1:539640‑M2/108‑43 (MQ=255) ccTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattg < 1:552940‑M2/87‑22 (MQ=255) cTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgct > 2:170008‑M2/1‑65 (MQ=255) cTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataa > 2:539640‑M2/1‑65 (MQ=255) cTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattga > 2:552940‑M2/1‑65 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgcttttgagaacgaaaccgacttccgtcccagccgtgcccggggctgcctcagattcaggttatgccgcccaattcgcttcttatatcgct < 2:155470‑M2/228‑165 (MQ=255) aGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggt < 2:610689‑M2/172‑117 (MQ=255) gTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtg > 1:610689‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgcatatcgctttcggatta < 2:499009‑M2/227‑174 (MQ=255) aaTAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgct > 1:137732‑M2/1‑48 (MQ=255) aGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtaaatcgcttgctgattacgtgcagctttccc < 1:89279‑M2/228‑188 (MQ=255) ggAATTTAAGGAATTCAAAATTTTTTTTTTTTTTGGGCCGggtcagtactccaacttatttgaagttttttatgttcagataatgcctgatggctttgtcctgcagcgccaccgatttggagaacgacagcgactgccgttccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttccct > 2:197226‑M2/1‑40 (MQ=255) taaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCT‑ATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCCGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTACGGGAATTCCCTATTAAGCgaatag < 1:288055‑M1/202‑3 (MQ=255) tAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgccaccgccttcagtcccagccgtgcaaggtgctgcctcagattctggttatgccgcccaattccctgcgtatctcgcttccggattacgtgtacctttcccttcaggc < 2:506847‑M2/228‑195 (MQ=255) tAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccttgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccccccaattccctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcagcc < 2:168287‑M2/228‑195 (MQ=255) tAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggc < 1:261068‑M2/228‑195 (MQ=255) tAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggc < 2:28323‑M2/228‑195 (MQ=255) tAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagcgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcatgttatgccgtccaattccctgcgtatatcgcttcctgattacgtgccgctttcccttcagcc < 1:290226‑M2/228‑195 (MQ=255) tAAGGAATGCAAAATTGTTCTTTATTTTGGTCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgccctatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggc > 1:505949‑M2/1‑34 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTAGCGTAGGCTGACTACCTTTTGTTCTTTTGTATTATTTGTGTTTCCGAGAATTCCCTATTAagcgaagaat < 2:176118‑M1/204‑5 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCT‑ATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTACGGGAATTCCCTATTAACCGAatgatg < 1:13712‑M1/204‑1 (MQ=255) taagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTATCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCT‑ATTTACACCGATGATTTCGCAGCAAGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGCGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTCCGAGAATTCCCAATTGACTGAATGATGAAAAGt < 1:677567‑M1/210‑1 (MQ=255) taagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCT‑ATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTACGAGAATTCCCTATTAAGCGAATGAtgaaaaat < 1:312237‑M1/210‑3 (MQ=255) ttggcagcgtcaccTTGGTCCGCCAATAAATCTCTTGACATAAAATTAGCCAGAAAAGGCGCGGCAAATAGCCGT‑ATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCTCATTTTATGGGGTGATTATCGTAGGTTGCCGACCTCTCAGTCTTCTGTATGAGTGGTGTTTACGAGAATTCCCTATTAAGCGAATGATGAAAAGTAGaa > 2:677567‑M1/15‑228 (MQ=255) ttggcagcatcactTGGCGACGCCAAAAAATATCGTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCT‑ATTTACCCCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGCTTCATGTTACAGTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTACGAGAATTCCCTATTAAGCGAATGATGAAACGTAGaa > 2:541877‑M1/15‑228 (MQ=255) catcatcaccttGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGACCT‑ATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTACGAGAATTCCCTATTAAGCGAATGATGAAAAGTAGAACAGt < 1:433134/218‑1 (MQ=255) cagcatctccTTGGGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCT‑ATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTACGAGAATTCCCTATTAAGCGAATGATGAAAAGTAGAACAGt > 1:521704‑M1/11‑228 (MQ=255) tATTTTGTGACGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgcccaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagatttaccttcagccgggattcaaccagcgcgcaccc < 2:506427‑M2/228‑217 (MQ=255) ttttGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccat > 1:682024‑M2/1‑10 (MQ=255) ccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCT‑ATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTACGAGAATTCCCTATTAAGCGAATGATGAAAAGTAGAACAGTCGCAATa > 1:412775‑M1/3‑227 (MQ=255) | CAACAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCAC‑GAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCT‑ATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTACGAGAATTCCCTATTAAGCGAATGATGAAAAGTAGAACAGTCGCAATA > NC_000913/1292814‑1293256 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |