| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | 100% | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 1 (0.020) | 53 (1.090) | 42/402 | NT | 98.1% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 458795 | 0 (0.000) | 74 (1.530) | 53/400 | NT | 100% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
AACAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGT‑GCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATG > NC_000913/607790‑608229 | aaCAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCATTATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGT‑GCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAGGAAGAAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAgcg > 1:321909/1‑228 (MQ=255)aaCAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGT‑GCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGATGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGGACGGAAGAAGTAGCCGTTGGGCGGGGGGTAATCCCATAAgcc > 2:436706/1‑227 (MQ=255)aaCAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGT‑GCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAgcg < 1:480445/228‑1 (MQ=255) cAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGT‑GCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCt < 1:355469/228‑1 (MQ=255) cAAGTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATAGGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGC‑TCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCt < 1:271280/228‑1 (MQ=255) 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1:85802/228‑1 (MQ=255) aGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGT‑GCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAAATTAAGGGTTGGGGTATTACGCCTGata > 1:322827/1‑227 (MQ=255) ggCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGT‑GCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAGGAAGTAGCCGTTGGTCGGGGAGTAATCCCCTAAGCGCTAACTTAAGGGATGTGGTATTACGCGTGatat > 2:541873/1‑227 (MQ=255) atatAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGG‑GCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCTCTGTGTGTGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGAAGACGTTGTTCGGGGCGTCATCTCATAAGCGCTACCTGCAGGGTTGTGGCCTTAAGCCTGATATGAttt > 1:418139/1‑228 (MQ=255) 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1:676689/225‑1 (MQ=38) cccTTGCGGCGGTCTTGGGGTTGTGTTTAAGGGT‑GCTGGGATTTACGCTTCTGGGTGGAGACGCGTTGTTTGAGTTTAAGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCAc < 2:322827/228‑1 (MQ=37) cGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGT‑GCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAACGGCTAACTTAAGGGGTGTGGGATTACGCCTGAATAGATTTAAGCGGCCGATGAATTATCCTCACgcaaac > 2:84280/1‑223 (MQ=255) gCTGTGTTTAACGGT‑GCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGGGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAGGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAAtt < 1:107000/227‑1 (MQ=255) 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1:100569/227‑1 (MQ=255) tttttACGGTGGCTGGGATTTACGGTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATTTTGAGGTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGc < 2:181899/227‑1 (MQ=255) ttttAACGGT‑GCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGCGACTCGGTGTGTGAGCTTACGGTGAAGGAACGTAAGATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGc < 1:156333/226‑1 (MQ=255) gtTTAACGGT‑GCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGc < 1:538502/227‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) aTTTACGCTTCGTGTCGGAGACTCGGTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGGAATAATGAGGTTAAGGCTGGTCTCGCGTACGAACCGAAGAAGTAGCCTTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCg < 1:100441/228‑1 (MQ=21) tACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGATTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGTCAACTTAAGGGTTGTGGTATTGGGCCCGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATACCTGGTCGGAAATTCAGGCCCATATTGGTAAAcccacaa > 2:614143/1‑224 (MQ=37) cTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGGGGTATTACGCCTGATCTGATTTAACGAGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTTTGGCCCAAATTGTTAAGCCCGAGGACCTggc > 1:337576/1‑227 (MQ=25) tACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGGTGGGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGGCAGCAATTCTGGCCCATATTGGGAAGCCCGAAGAAATGGATAATTCTGCACGAAATGCCGGGGct > 2:526631/1‑227 (MQ=21) tGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTTCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGCTTTAACGTGCCGCTGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGCAATCCTGGGGCACTAACCCGCCGCCGCGAAAta > 1:406856/1‑226 (MQ=255) tGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATCCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCCCGAAAtt > 1:246045/1‑227 (MQ=255) tGTTCGCGCATAGGAACCGAAGACGTAACCGTTGTGGGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCaa < 1:28020/228‑1 (MQ=255) ttCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCACATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAAGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAGGCCCTACGAACTGGATACTTCGTCACGTAATGCTGGGGCTTTAACCCGCCGCCGCGAACTTCGTGTTGCTGCAAct > 1:246732/1‑228 (MQ=17) aGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATg > 1:675183/1‑228 (MQ=32) | AACAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGT‑GCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATG > NC_000913/607790‑608229 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |