| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,663,858 | A→G | 14.8% | S84G (AGT→GGT) | ynfH → | oxidoreductase, membrane subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,663,858 | 0 | A | G | 14.8% | 158.7 / 2.1 | 75 | S84G (AGT→GGT) | ynfH | oxidoreductase, membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/25); new base G (5/7); total (43/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.54e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 | |||||||||||
GCCACTGGTTATCTTTACCGTATTGGGTCAATGCGTAGTAGGCGCGCTGATTGTTAGCGGAATTGGCTGGTTCGCCGCCAAAAATGACGCAGACCGTCAGCGTATTGTCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTATCAAATCGACACCGTGCCAACCTGGCATAACGGTTACACTACGCTGGCTTTCTTCCTGACGGTATTGTTG > NC_000913/1663632‑1664085 | gCCACTGGTTATCTTTACCGTATTGGGTCAATGCGTAGTAGGCGCGCTGATTGTTAGCGGAATTGGCTGGTTCGCCGCCAAAAATGACGCAGACCGTCAGCGTATTGTCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGGGCTTCTGGTCTGa > 1:483149/1‑227 (MQ=255) ttATCTTTACCGTATTGGGTCAATGCGTAGTAGGCGCGCTGATTGTTAGCGGAATTGGCTGGTTCGCCGCCAAAAATGACGCAGACCGTCAGCGTATTGTCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAAATCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGGGTAACggga > 1:391207/1‑228 (MQ=255) cGTATTGGGTCAATGCGTAGTAGGCGCGCTGATTGTTAGCGGAATTGGCTGGTTCGCCGACAAAAATGACGCAAGCGGTCAGCGTATTGTCCGTGGCATGTTTTTCATCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCATCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGGGGGCGTTTAATTCCCTGACTCGCATCGGGCGTTTCT‑GTCTGGGGAACGAGATTGCTccccg > 2:308045/1‑226 (MQ=255) ggTCAATGCGTAGTAGGCGCGCTGATTGTTAGCGGAATTGGCTGGTTCGCCGCCAAAAATGACGCAGACCGTCAGCGTATTGTCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCCCTCCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGCATC‑GTGGCTTCTGGCTTGAGTAACGCAATTGCTGCCGGTTCCa‑ta > 1:664777/1‑228 (MQ=255) ggTCAATGCGTAGTAGGCGCGCTGATTGTTAGCGGAATTGGCTGGTTCGCCGCCAAAAATGACGCAGACCGTCAGCGTATTGTCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCa‑ta > 1:14658/1‑228 (MQ=255) ggTCAATGCGTAGTAGGCGCGCTGATTGTTAGCGGAATTGGCTGGTTCGCCGCCAAAAATGACGCAGACCGTCAGCGTATTGTCCGGGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATTGCCCCTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGGGCTTCTGGTCTGAGAAACGAGATTGCTTCCGGTTCCaaa > 1:314019/1‑226 (MQ=255) aTGCGTAGTAGGCGCGCTGATTGTTAGCGGAATTGGCTGGTTCGCCGCCAAAAATGACGCAGACCGTCAGCGTATTGTCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCCCCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTTGGTGACGAGATTGCTGCGGGTTCCA‑TAttttt > 1:296209/1‑228 (MQ=255) aTGCGTAGTAGGCGCGCTGATTGTTAGCGGAATTGGCTGGTTCGCCGCCAAAAATGACGCAGACCGTCAGCGTATTGTCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGGGATTGCTGCCGGTTCCA‑TAttttt > 1:625094/1‑228 (MQ=255) tGCGTAGTTGGCGCGCTGATTGTTAGCGTAATTGGCTGGTTCGCCGTCAAAAATGACGCAGACAGTCAGCGTACTGTCCGCGGCCTGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCCTCGGGATTAGTGCCCCTTTCATACACCCGGGATACCCACTGGTGGGGTTTAAATCCCCAACTCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGCAAGTGCCCGAGGTTCCA‑tttttttt > 2:133288/1‑228 (MQ=255) tGCGTAGTAGGCGCGCTGATTGTTAGCGGACTTGGCTGGTTCGCCGCCAAAAATGACGCAGACCGTCAGCGTATTGTCCGTGGCATGTTTTTCCCCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCTTGCACCTGGGATAGCCACAGCGGGCGTTTAATTCCCTCATTCGAATC‑GGAGTCTCCGGCCTGCTCACCGAGACTCCTTCCGGTTCCT‑TAtttttt > 2:466857/1‑228 (MQ=255) tagtagGCGCGCTGATTGTTAGCGGAATTGGCTGGTTCGCCGCCAAAAATGACGCAGACCGTCAGCGTATTGTCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTGCCTGAATCGGATC‑CGAGCTTCTGTCCTTGGTAACGGGGTGTCTGCGGGGTCCACTAtattttcct > 2:381983/1‑225 (MQ=255) agtagGCGCGCTGATTGTTAGCGGAATTGGCTGGTTCGCCGCCAAAAATGACGCAGACCGTCAGCGTATTGTCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGGGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGt > 1:488655/1‑228 (MQ=255) tggtgtgcTGTTTTTTAGGGGAATGGGCTGGTTCGCCGCCAAAAATGGCGCAGACCGGCAGCGTATTGGCCGTGGCCTGTTTTGCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCGGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTg < 2:175084/221‑1 (MQ=255) agGCGCGCTGATTGTTAGCGGAATTGGCTGGTTCGCCGCCAAAAATGACGCAGACCGTCAGCGTATTGTCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTg < 1:194845/227‑1 (MQ=255) agGCGCGCGGATTGTTAGCGGAATTGGCCGGTTCGCCGTCAAAAATGATGCAGTCCGTCAGCGTATTGTCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTg < 1:466857/227‑1 (MQ=255) gcgcTGATTGTTAGCGGAATTGGCTGGTTCGCCGCCAAAAATGACGCAGACCGTCAGCGTATTGTCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGGGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGtt > 1:175084/1‑222 (MQ=255) gATTGTTAGCGGAATTGGCTGGTTCGCCGCCAAAAATGACGCAGACCGTCAGCGTATTGTCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTCTTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGTATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTAt > 1:549087/1‑227 (MQ=255) gAATTGGCTGGTTCGCCGCCAAAAATGACGCAGACCGTCAGCGTATTGTCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAAGGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGCAGGGTTAtggtggctgttgg > 1:483416/1‑228 (MQ=255) gAATTGGCTGGTTCGCCGCCAAAAATGACGCAGACCGTCAGCGTATTGTCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGCCTGCGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTg > 1:74923/1‑207 (MQ=255) atttGGCTTGTTCGCCGCCAAAAATGACGCGGACCGTCAGCGTGTTGGCCGTGGCATGTTCTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGTCGTTTATCTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTgg < 2:74923/205‑1 (MQ=255) aTTGGCTGGTTCGCCGCCAAAAATGACGCAGACCGTCAGCGTATTGTCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTTAGTAACGTGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGCTTTTGGGGGCTGGTGGCa > 2:413236/1‑228 (MQ=255) ccggcAAAAATGGCGCAGACCGTCAGCGTATTGTCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTaaaa < 1:593881/228‑1 (MQ=255) aaaaaTGACGCAGACCGTCAGCGTATTGTCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATTGCCACGGGGGGCGTTTAACTCCCCTAATCGAATC‑GGCGCTTCTGGTCGGAGTAACGACATTGCTGCCGGTTCAC‑TATTTTTTGCCGTTGTCGGATTATGTGTGATGGTGGGAGTCATCGTTgaaagacgg > 2:64617/1‑223 (MQ=255) gtcgtctttttGTCCTTGGCATGTTTTTCCCGTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTTTGTCATGCCCCTGGGATTGGCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAAc < 2:255725/219‑1 (MQ=255) ttttttttcttGGCTTTTTTTTCCTCGGGCTGTGGATGGGCGTGGGGTTTATTCCCTTCGGCATGCCCCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGt < 2:14658/218‑1 (MQ=255) tCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGGGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGACTGCGTAACGGAATTGCCGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATAATGGGGGCTGGGGGCAGTCCTCGGTTAAATGCCGGAACAGTTGGGGAACATCGGGTTACtt > 2:69615/1‑227 (MQ=255) tCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGTGTGCTGGTGCCAGTCAGCGGTAAAATGCCCCAACCGTTGGGGAAACTCTGGTTACtt > 1:369149/1‑227 (MQ=255) tCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACtt > 1:452573/1‑227 (MQ=255) gTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTCATTTTCa > 1:359930/1‑228 (MQ=255) ggCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCCAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTTAGc > 1:144254/1‑228 (MQ=255) cttggggtGTTGAGGGGGGTCGGTTTTATTGCCCCTGGCATGCCCCTGGGTTCGCCCCTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGc < 2:20315/221‑1 (MQ=255) ggCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TCTTTTTTGCCCTTGGCGGCTTATGGTGGCTGGCGGGGGTCTTTGGTAAACTGCCCAACGCGGTGGGGGAATTCTGGTTAATTTTCCGCATGGGGCCCcgcggcc > 2:92729/1‑225 (MQ=255) cgtttgttgGGCGGCGGGTTTATTGCCTCGGCTATGCACCGGGGTGGGCCTGTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAAACGAATC‑GGGGCTTCTGGTCTGGGTAACGAGTTTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCAtt < 2:695413/225‑1 (MQ=255) gaggtgcttCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGt < 1:164784/220‑1 (MQ=255) gATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTATGTCATGCCCCTGGGATCGCCACTGCGGGCGGTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGATTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGt < 1:409561/228‑1 (MQ=255) tGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTTATGGCTCTGGGCTCGGCACTGGGGGCGTTTACCTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGATTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCt < 1:308045/228‑1 (MQ=255) gtggggtggggTTTATTGCCTCTGTCCGTCCCCTGGGATCGCCACTGGGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGGGCTTCTGGGTTGGGTAAAGGGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGGTGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCt < 2:483149/220‑1 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACTTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGGCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCGAGCGTTGGGGAAATTCTGGTTGATTTTCAGCATGGCGTTCGGCGGCATTTTGGTCTgg > 1:645976/1‑228 (MQ=255) ggCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTgg < 1:92729/228‑1 (MQ=255) tCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTTGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGCGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TCTTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGAGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGGAACTCTGGGTCATTTTAACCAAGGCGCCCGACGCCATTTTGGCCTGgttga > 2:167013/1‑228 (MQ=255) tCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCAACGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCAAGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGgatgc > 1:375420/1‑227 (MQ=255) tCGGGGTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑CGAGCTTCTGGTCTGAGGACCGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGAGTATGGTGGCTGGTGGCAGACATCGGCAAAATGCCGCAGGCGTTGGGGGAACTCTGGTTACTTTTCACAATGCGGCCCGGGGTAATTTTCGGCTggtgga > 2:164784/1‑224 (MQ=255) ttccctcttgtaTGCCCCGGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCGGGTCTGAGTAGCGGGAGTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGc < 2:369149/216‑1 (MQ=255) tctGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGCCGTCAttt > 1:186968/1‑202 (MQ=255) ttgttcggccccTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTAt < 1:413236/217‑1 (MQ=255) ttGTCATGCCCCGGGGATCGCCCCTTCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGGTCTTCTGGTCTGAGTAACGGGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTAt < 2:452573/226‑1 (MQ=255) ctGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCCTCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTTGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCCCCGCGCCATTTTTGTCTGGATGATGACCTGCGTGTATc > 2:358386/1‑228 (MQ=255) ctGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCTTTTTCGGCTGGATATTGACCttccggga > 2:368170/1‑219 (MQ=255) ctGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTCTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTAt < 1:561984/227‑1 (MQ=255) aggTCATGCCCCTGGGTTCGCCACGGCGGGCTTTTAACCCCCTGAATTGAATC‑GGAGCTTCTGGTCGGGGTAACGGGGTTGGGGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTAt < 2:476679/225‑1 (MQ=255) cccggggATCGCCCCTGCGGGCGTTTAACTCCTTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTATCAAATCGaca < 1:381983/224‑1 (MQ=255) ccTGGGTTCGCCACTGCGGGCGTTTAACGCCCTGAATCGAATC‑GGATCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTATCAAATCGacac < 1:69615/228‑1 (MQ=255) cTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGcc > 2:670447/1‑75 (MQ=255) tGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCg < 1:670447/75‑1 (MQ=255) gggATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTa > 1:476679/1‑213 (MQ=255) gggATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTATCAAATCGACACCGt > 1:565263/1‑228 (MQ=255) gggATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGAGGATGACCTTCGTGTTTCAAATCgcatccgt > 1:249830/1‑221 (MQ=255) gggATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCCCGGCGTCCTTTTGGTCTGGTGGGTGACCTGCGTGTTTAAAATctggctct > 2:166318/1‑220 (MQ=255) ggATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAAct < 1:144151/152‑1 (MQ=255) ggATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGc < 1:166318/207‑1 (MQ=255) gCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGCAATTTTCGTCTGGATGGTTACTTTGGTGTATCAAAACGAACCCGTGCCacc > 2:687356/1‑226 (MQ=255) gCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGGGGCTGGTGGCAGTCATCGGTACAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTTCGTCTGTCAAATCGACACCGGTCCAAc > 2:115288/1‑228 (MQ=255) ccACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGTTGACCTGCGTGTATCAAATCGACACCTGGCCAAcc > 1:183485/1‑228 (MQ=255) ccACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACCTTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCCAGGCGTCATTTTCGGTTGGATGGTTACCTGCGGGGTTAAAAGCGACACCGTGCCAAcc > 2:32888/1‑228 (MQ=255) cGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTATCAAATCGACACCGGCCCAACCTGCCAt > 1:370165/1‑228 (MQ=255) ggggGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCGGAGTAACGGGATTGCGGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTGTGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTATCAAATCGACACCGTGCCAACCTGGCAt < 2:664777/227‑1 (MQ=255) gggCGTTTAACTCCCTGAATCGATGC‑GGAGCTTCGTGTCTGAGTTACTAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTGCTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTATCAAATCGACACCGTGCCAACCTGGCAt < 1:687356/227‑1 (MQ=255) cggtgTTTAACTCCCGTGATTGAATT‑GGAGCTTCTTGTCTGGGTAACGAGATTGCTGGCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGGTGGCGGAGTATGGTGGCTTGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTATCAAATCGACACCGTGCCAACCTGGCAt < 1:133288/223‑1 (MQ=255) ggCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAACCTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTATCAAATCGAACCCGTGCCAACCTGTCATa > 1:143849/1‑227 (MQ=255) gctttttACCCCCTTAATTGAATC‑GTGTCTTCTGGTGTGGGTAACGGGATTGCTGTCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGGGGATTATGGTGGCTGGTGTCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTATCAAATCGACACCGTGCCAACCTGGCATaa < 2:382600/224‑1 (MQ=255) ttttATCTCCTTGAATCGATTC‑GGAGCTTCTGGTCTGGGTAACGGGATTGCTGCCGGTTCCA‑TTTTTTTTGCCGGTGGCGGATTATGGCGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGAAGACCTGCGTGTATCAAATCGACACCGTGCCAACCTGGCATAACgg < 2:625094/227‑1 (MQ=255) gTTTATCTCCCTGTTTTGATTC‑GGGGTTTTTGGTCTGGGTAAGGGGATTGCTGCGGGGTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTATCAAATCGACACCGTGCCAACCTGGCATAACgg < 2:359930/228‑1 (MQ=255) cTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTATCAAACCGACACCGTGCCAACCTGGCATAACGGTTCCACAAc > 1:693048/1‑227 (MQ=255) gaatcgaatc‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTGGTCTGGCTGATGACTTGCGTGGTTCAAATCGACACCCTGCCAACCTGGCATAACGGttcaaccaccca > 2:88669/1‑218 (MQ=255) atcTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTATCAAATCGACACCGTGCCAACCTGGCATAACGGTTACACTACGCTGGCTTTCTTCCt < 1:336916/226‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTCTGAGTAACGTGTTGTCTGCTGGTTCCT‑TATTGTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGACTGGTGGCATGTATCGGGAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGTATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGGCCTGCGTGTATCAAATCGACACCGTGCCATCCTGGCATAACGGTTACACTACGCTGGCTTTCTTCCt < 1:9688/227‑1 (MQ=255) aGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTATCCAATCGACACCGTGCCAACCCGGCATACCGGTTCAACCACGCTTGCTTTCTTCCTTACgggtttcttt > 2:77800/1‑220 (MQ=255) aGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTATCAAATCGACACCGTGCCAACCTGGCTTAACGGTTACACTACGCTGGCTTTATTCCTGACGGTAttgtt > 1:20360/1‑227 (MQ=255) aGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAAATCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTATCAAATCGACACCGTGCCAACCTGGCATAACGGTTACACTACGCTGGCTTTCTTCCTGACGGTAtggttg > 1:96673/1‑228 (MQ=255) | GCCACTGGTTATCTTTACCGTATTGGGTCAATGCGTAGTAGGCGCGCTGATTGTTAGCGGAATTGGCTGGTTCGCCGCCAAAAATGACGCAGACCGTCAGCGTATTGTCCGTGGCATGTTTTTCCTCTGGCTGTTGATGGGCGTCGGGTTTATTGCCTCTGTCATGCACCTGGGATCGCCACTGCGGGCGTTTAACTCCCTGAATCGAATC‑GGAGCTTCTGGTCTGAGTAACGAGATTGCTGCCGGTTCCA‑TATTTTTTGCCGTTGGCGGATTATGGTGGCTGGTGGCAGTCATCGGTAAAATGCCGCAAGCGTTGGGGAAACTCTGGTTACTTTTCAGCATGGCGCTCGGCGTCATTTTCGTCTGGATGATGACCTGCGTGTATCAAATCGACACCGTGCCAACCTGGCATAACGGTTACACTACGCTGGCTTTCTTCCTGACGGTATTGTTG > NC_000913/1663632‑1664085 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |