| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,809,086 | C→A | 9.3% | Q183K (CAA→AAA) | waaA → | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonic‑acid transferase (KDO transferase) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,809,086 | 0 | C | A | 9.3% | 222.5 / 2.8 | 91 | Q183K (CAA→AAA) | waaA | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonic‑acid transferase (KDO transferase) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (51/30); new base A (2/8); total (53/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.49e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
CGTATGATCTGCCCGATGCACTCAACCGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCG‑CCGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTA > NC_000913/3808859‑3809307 | cGTATGATCTGCCCGATGCACTCAACCGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTgcgc > 1:694343/1‑228 (MQ=255) gaaacaggCCCGATGCAATTATCCGGTTCCTGAATAACGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTAGGGCCTATCCTGATGGCGGCGCTACATAAACGTAAAATCCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCaaa < 2:409208/221‑1 (MQ=255) aTGATCTGCCCGGTGGACTCAACCGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCaaa < 1:683899/228‑1 (MQ=255) tGCCCGATGCACTCAACCGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTATGCCCGCTAGGCCGCAGGTTATGCCAACCTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCCTCGTTTTACGCGGATTGCTGCGaaa > 2:683899/1‑221 (MQ=255) cccGATGCACTCAACCGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATAGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTACATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGCCGGATAACGCTCATTGCTGCGAaaaacaaaaaa > 2:310881/1‑221 (MQ=255) ccGATGCACTCAACCGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCCAAGGTTAGGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCTCCGCTTGCTGGGCCGTATTACGCTGTTTGCGGCGCAAAATgaagaaa > 2:459301/1‑227 (MQ=255) agacagaCTCAACCGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACCGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAagaaga < 1:240314/222‑1 (MQ=255) acgcAACCGTTTCCTGAATAAAGGCGACCCTAAACGGGTGTTGATTATGGAAACCGAACGATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGc < 1:392076/225‑1 (MQ=255) tCAACCGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCCCTTGCTGCGTCGTATTACCCTGCTGGCTGCCCAAAATGTagaagacctgccc > 1:409208/1‑220 (MQ=255) cGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGATATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGGGCACGttt > 1:396765/1‑227 (MQ=255) ttCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGCATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCCCGTTTtgtg > 1:482540/1‑228 (MQ=255) tCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATAGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCCCTGCCCGCTCGGCCGCAGGGTATGCCAAACAGGGGAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGGTTTACGCTGCTTTGTGTGCAAAATGAAGCAAATGGGGCACGTTCtgac > 2:240314/1‑225 (MQ=255) aGTCGCCCCTAAACTGGGTTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGgcgc < 1:466604/228‑1 (MQ=255) aGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGCCTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCCCTTGCTGCGTCGGATTACGCTGATTGCTGCGCAAAAAGATGAAGATGTGGCCCGTTTTGTGGCGCTgggggg > 2:674987/1‑225 (MQ=255) ccagACCCTAACTTGTGGTTGATTAAGGAAACCGAACTTTGGCCTAACCTGATTCCGGGCCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGGTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTCGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCa < 2:290759/225‑1 (MQ=255) aCCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGGTGCGCTGGGCCCaaaaa > 2:68823/1‑228 (MQ=255) aaCTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTCCATAAACGTAAAACTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGCAGAAGATGGTGCACGTTTTTTGGCGCTGGGCGCAAAAaataat > 1:124005/1‑227 (MQ=255) gtgtTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTTATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGCTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGGCGCTTGCTCCGTCGTCTTCCGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAAAAAAGGGGGCACGTTTTGTGGCCCTCGGCGCAAAAAAAAAACAgggg > 2:257444/1‑226 (MQ=255) gtgtTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTgcgc > 1:423159/1‑172 (MQ=255) gtgtTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGTCGCTGGGCGCCAAAAATAATCAGGTg > 1:596288/1‑228 (MQ=255) gtgtTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGGGCACGTTTTTTGGCGCTGGgcgc > 1:290759/1‑212 (MQ=255) tgtTTATTTAGGAAACCCAACTAGGGCCTATCAGGATTGCGGCGCTGCATAAACGTAAAATTCCGGTGGTGATCGCGAACGCGCGACTCTCTTCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCCCGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGa < 2:432925/228‑1 (MQ=255) tgtTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCa < 2:423159/172‑1 (MQ=255) tgtTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGGCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGAAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATAAGGTGa > 1:370428/1‑228 (MQ=255) gATTATGGAAACCGATCTTTGGCCTACCCTTATTGCGGCGCTTCATAACCGGAAAATTCCGCTTGTGGTCGCTAACGGGCGACTCTCTGCCCGCTTGGCCGCAGGTTATGCCCAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGt < 2:366853/228‑1 (MQ=255) gATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTTGCGTTGGGCGCCAAAAATAATAAGGTGAcc > 1:702696/1‑226 (MQ=255) gATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGCCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGt > 1:149398/1‑228 (MQ=255) gATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGCCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGCAGATGTGGCCCGTTTTTTGGCGCTGGGCGCAAAAAAAAAACAGGGAACCGt > 2:685852/1‑228 (MQ=255) tATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTAc > 1:70236/1‑228 (MQ=255) tATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGGGACCGTTAc > 1:162958/1‑228 (MQ=255) tGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGCCCTTCGCTTGCTGCGCCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGGGCACGTTTTGTGGCGCGGGGGGCCAAAAATAATCAGGTg > 2:662823/1‑218 (MQ=255) tGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGGTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGAGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTTTGGCGCTGGGCGCACAAACATATCAGGGGAACGATACCg > 2:597333/1‑228 (MQ=255) ggAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGa < 1:662823/218‑1 (MQ=255) aCCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGACGCAGATGGTGCCCGTTTTTTGGCGCTGGGCGCACAAAATAATCAGGGGACCGTTACCGGTAGc > 1:704124/1‑228 (MQ=255) aCCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTGGCTGCGTCGCATTACGCTAATTGCTGAGCAAAATGAAGAAGATGGTGCCCGTTTTGTGGCGCGGGGCGCAAAAAATAATAAGGAGACCGTTACCGGTAGc > 2:651473/1‑228 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aCCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGGTTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGGGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATAAGGGAGCCGGTACCGGTAGCCGGAAATTCGGTAttt > 2:430720/1‑228 (MQ=255) aCCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATATTCAGGTGACCGTTACCGGTAACCTGAAATTCGATCttt > 1:34154/1‑228 (MQ=255) aCCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATAtt > 1:29754/1‑227 (MQ=255) aTTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGGGCCCGTTTTTTGGCCCTGGGGGCAAAAAATAATAAGGTGACCGTACCCGGTAGCCGGAAATTCGTAATTTCttaa > 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ggcgCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGGCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTTGGCGCAAAAAATAATAAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGAAATTTCTGTAAagc > 2:567186/1‑227 (MQ=255) gcgcTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAAACAGGGGACCGTTACCGGTAGCCTGAACTGCGAATTTTCTGTAAagccg > 2:112398/1‑228 (MQ=255) gcgcTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGGGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGGGACCGTTCCCGGTAACTTGAAATTCGAAAtttttaaaaaacca > 2:150753/1‑217 (MQ=255) taTAGACGTGAAATTCCCGTGTGGATCGTGCACGCGAGCCTCTCTGCCCGCGCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTTGGTAAATTCTTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTg < 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(MQ=255) aCGGGCGACTCTTCGCCCGCTCGGCCGTCGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCG‑CCGCCAGt < 1:674987/228‑1 (MQ=255) cgtcccttcccccGCTGGGCCCGCGGTTATGCCAAACGGGGTAAATTCGCCCGTCGCTTGCTGGGTCGTATTGCGCTGATGGCGGCGAAAAATGAAGAAGGTGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTCCCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCATTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCG‑CCGCCAGTGGGca < 2:510934/218‑1 (MQ=255) ttctGCCCGCCTGGCCGCAGGTTACGCCAAACTGGGAAAATTCGGCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCG‑CCGCCAGTGGGCACcaca < 1:182007/227‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |