New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | = 2760086 | 57 (0.650) | coding (1102/1410 nt) | yfjI | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
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tatatCTGTTACCGCAGTAAAAGCAGCAGTGGAGATAGTGGCTTGGTATATTGAAGAATACATCCGCTTGTTCTCTAAAAAAGAAGAGTTTTCTTTAGATGTTTCAGAAGCAGATGAGCTTTATTGTTGGATAAAAGATTACTGCACGCAAAAATTTTCTTCC‑TGCATCAAGAAAAATATTAT‑CTTACAATTTGGGCCAAATAAATTTAGAAATCGTGACAAGGCAAATGAattaatta > 1:113108/1‑239 (MQ=255) ttACCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgctgctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattactggcagctttcccttcaggc < 2:871343‑M2/200‑195 (MQ=255) ttACCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgctgctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggc > 1:871343‑M2/1‑6 (MQ=255) ttACCGCAGTAAAAGCAGCAGTGGAGATAGTGGCTTGGTATATTGAAGAATACATCAGCTTGTTCTCTAAAAAAGAAGAGTTTTCTTTAGATGTTTCAGAAGCAGATGAGCTTTATTGTTGGATAAAAGATTAAGGCACCCAAAAATTTTATACC‑TGACGTATGAAAAAAATTAT‑TTTACAATTTTGTCCAAATACATTTTAAAAACGACACAACACAAAGAAATAAATAAGAAtttaa > 2:1104573/1‑235 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |