| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,532,543 | 0 | A | T | 10.3% | 341.6 / 2.9 | 126 | intergenic (‑104/‑275) | yhgE/pck | DUF4153 family putative inner membrane protein/phosphoenolpyruvate carboxykinase [ATP] |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (73/35); new base T (2/12); total (75/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.82e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.36e-01 | |||||||||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
ACGCCATAAACAATCCAACTGTGATTTTTTCCGGAAAGCCAGGCGATCAGCAGGTAGCAAACCAGACCCTGAAGTAATCCGGTAGCAATCATCCCCCAGCGTGTTGCGGGTGAAAGTTCAACGTTATCCATGTTGGTTATCCAGAATCAAAAGGTGGGTTAATTATCGCATCCGGGCAGTAGTATTTTGCTTTTTTCAG‑AAAATAATCAAAAAAAGTT‑AGCGTGGTGAATCGATACTTTACCGGTTGAATTTG‑CATCAATTTCATTCAGGAATGCGATTCCA‑CTCACAATATTCCCG‑CCATATAAACCAAGATTTAACCTTTTGAGAACATTTTCCACACCTAAAATGCTATTTCTGCGATAATAGCAACCGTTTCGTGACAGGAATCACGGAGTTTTTTGTCAAATATGAATTTCTCCAGATACGTAAATCTATGAGCCTTGTCGCGGTTAACACCCCCAAAAAGACTTT > NC_000913/3532309‑3532779 | aCGCCATAAACAATCCAACTGTGATTTTTTCCGGAAAGCCAGGCGATCAGCAGGTAGCAAACCAGACCCTGAAGTAATCCGGTAGCAATCATCCCCCAGCGTGTTGCGGGTGAAAGTTCAACGTTATCCATGTTGGTTATCCAGAATCAAAAGGTGGGTTAATTATCGCATCCGGGCAGTAGTATTTTGCTTTTTTCAG‑AAAATAATCAAAAAAAGTT‑AGCGTGGTGAATCGATACtt < 1:479452/238‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |