Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | 100% | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 458790 = | 1 (0.010) | 70 (1.000) | 47/432 | NT | 98.6% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
* | ? | NC_000913 | = 458795 | 1 (0.010) | 77 (1.110) | 51/430 | NT | 98.7% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region |
ATCGCCGCTTCCAGACAACGGATAGATTTTTCCCGCCCGACAAATAAGGGGATGACCATGTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/459018‑458790 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACT > NC_000913/608008‑608247 acgGCCGCTTCCAGACAACGGAAAGATTTTTCCCGCCCGACAAATAAGGGGATGACCATGTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCG < 2:559758/236‑1 ATCGCCGCTTCCAGACAACGGATAGATTTTTCCCGCCCGACAAATAAGGGGATGACCATGTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGAATATGGGGATGTTTCCCAATAAGCG > 2:114656/1‑239 TCGCCGCGTCCAGACAACGGATAGATTTTTCCCGCCCGACAAATAAGGGGATGACCATGTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGC < 1:694617/239‑1 cccccCTTCCCGACAACGGATAGATTTTTCCCGCCCCACAAATAAGGGGATGTCCATTTGCGGATAAACCCCCCCATCGCGCAGCGGCAATTCGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCT < 2:745247/234‑1 cccccCTTCCAAACAAAGGATAGATTTTTCCCGCCCGACAAATAAGGGGATGGCCCTGTGCGGATAAACCACCCCAGCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCT < 2:719966/234‑1 CTTCCAGACAACGGATAGATTTTTCCCGCCCGACAAATAAGGGGATGACCATGTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTTTTAACATGTACGTCAGTATATGGGGAGGTTTCCCCATAAGCGCTAACTT > 2:594652/1‑239 CTTCCAGACAACGGATAGATTTTTCCCGCCCGACAAATAAGGGGATGACCATGTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTT > 2:612875/1‑239 caACAACGGTATGATTTTTCCCCCCCGACAAATAAGGGGATGACCAGGTGCGGATAAACCCCCCCATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGG < 2:484702/237‑1 CAACGGATAGATTTTTCCCGCCCGACAAATAAGGGGATGACCATGTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTG < 1:397434/239‑1 CAACGGATAGATTTGTCCCGTCCGAAAAAGAAGGGGATGACCATGTGCGGAAAAACCACCACATCGGGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGG < 1:770865/236‑1 ccCGGATAGATTTTTCCCGCCCGGAAAATAAGGGGATGCCCATGTGCTGGTAAACCACCACATCGGTGAGCGGCAATTCCGGGATTTCAATGCGTTCAGTAC‑GCTTAGGATTCATAGAG‑CTTTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGT < 2:630132/237‑1 AACGGATAGATTTTTCCCGCCCGACAAATAAGGGGATGACCATGTGCGGATAATCCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGACTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGT < 1:257770/239‑1 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TTTTCCCCGCCGACAAATAAGGGGATGAACATGTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCC < 1:473385/239‑1 TTCCCGCCCGAAAAATAAGGGGATGGCCATGTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTG < 1:810911/239‑1 CCCGCCCGACAAATAAGGGGATGACCATGTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGAT < 1:14895/239‑1 GCCCGACAAATAAGGGGATGACCATGTTCGGATAAACCCCCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATG < 2:387578/239‑1 cgaaAAGGGGTTGACCATTTGCGGATAAACCCCCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGTATTTCAATGGGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAC < 2:61693/235‑1 AAATAAGGGGAGGACCATGTGCGGATAAACCACCACCTCGCGCAGCGGCAATACGGCGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GGTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGCCTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATTTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAC < 2:500035/239‑1 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ATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAACCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACTTGCCGATGAATTACTCTCACGAT > 1:441037/1‑239 TAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATAAATTACTCTCACGAaa > 2:748445/1‑237 CACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGAAAAATGGTaa > 2:558891/1‑237 CGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGAATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATAACTCTAACGATAACTTGTacaaaat > 2:12702/1‑232 gcaCAGCGGAAATTCGGGGTTTTCAATTCGTTCAGAACGGCTC‑GGATTTATAAAG‑TGCTCCTTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATT < 1:398701/236‑1 cccgAGCGGCAATTCGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCAGAGAG‑CGCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATT < 2:554/235‑1 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AATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAA < 1:600293/239‑1 AATGCGTTCAAAAC‑GCTCAGGATTCATATGG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTTATCAGATGAACCGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAA < 2:559830/239‑1 AATGCGTTAAGAAC‑GTTCAGGATTCATAGAG‑CTCTTTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAA < 1:537873/239‑1 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CACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGTGGCTCTAACCCTCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAAC > 1:869026/1‑238 CTGTGCTTCACGCCATCTATTAACGTTACCGGCAGTATAGGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTGCGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTATCCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCT < 1:376535/239‑1 TGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTAC > 2:129981/1‑238 CTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCCCGGAATGCCGGGGCTCTAACCGCCCGCCCCGAAACTCGTGATGGTTCAACTCgggaaagta > 2:376535/1‑230 TTCACGCCTTCTATTAACATGTTCGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGGGGTATTACGCCTTATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCCCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCT < 2:619856/239‑1 tTTAAAATGTTCGTTCGTGAATGGGGATGTTTCCCCATAAGGGCTAATTTAAGGGTTGTGGTATTACGCTTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATATCTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCAGAAGATCTGGATACTTCGGCACGTAAGGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTA < 2:693002/238‑1 taaccttacgGTCAGTATATGGGGAGGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACATGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACG < 1:47119/229‑1 TAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGAGGCTCTAACCCACCGCCGCGAAATTCGGGATGCTGCAAGCCTGCTACGGCTTGGCCTGGCTTACG > 1:508738/1‑239 GTACGTCAGTCTATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGC > 2:510936/1‑36 GTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGC < 1:510936/36‑1 TACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGGTTACGGCCCCGG > 2:759350/1‑239 TACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCG > 1:708519/1‑81 TACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCG < 2:708519/81‑1 GGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCACCTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGAGGTCATT > 1:766585/1‑238 GGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCCTT > 1:836913/1‑238 GGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATT > 1:93819/1‑238 TGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAATCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTACTGCCGGGTCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCCGGGGCTGGCTTACGCCCCCGGGGGGCTATCATTACGTGA > 2:608838/1‑239 TGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGCAGAACTGGATACTTCGGCACGTCATGCCGGGGCTCTAACCCGCCACCGCGGAATTCGGGATGCTGCAACTCTGTTCCTGCCTGGGCTGCCTTACGGCCCCGGGGGGGAGCCATTAgtgga > 2:870226/1‑234 TGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGA > 1:691399/1‑239 TGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGG < 1:16223/221‑1 TGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGG > 2:16223/1‑221 TGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGAATCCTCTGGCACGTAAGTCAGGGGCTCTAACCCTCCGCCGGGAAATTCGTGATGTGGCAAATCTGCAACGTCCGGGGATGGCCAAAGGCCCCGGGGGGATGCCATTAaggga > 2:279037/1‑234 GTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAA < 1:706344/239‑1 TTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCCCGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCAGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACAGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTAAAa > 2:34756/1‑238 TTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTA < 1:488269/210‑1 TTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTA > 2:488269/1‑210 CCCTTAAGCGCTACCTTAAGGGTTGGGTTTTTCCCCTTGAAATGATTTAACTGGCCGATGAATTCCCCTCCCGATAACTGGTCACCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTGCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCAC < 2:680217/239‑1 CCCAAAAGCCCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGGAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCAC < 1:333370/239‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTTAAGTCCCT > 1:796124/1‑238 ATCGCCGCTTCCAGACAACGGATAGATTTTTCCCGCCCGACAAATAAGGGGATGACCATGTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAAC‑GCTCAGGATTCATAGAG‑CTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/459018‑458790 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACT > NC_000913/608008‑608247 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |