| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1226035 | 90 (1.270) | 3 (0.040) | 3/434 | NT | 2.9% | coding (46/696 nt) | minC | inhibitor of FtsZ ring polymerization |
| ? | NC_000913 | = 1226307 | 110 (1.570) | intergenic (‑227/‑293) | minC/ycgJ | inhibitor of FtsZ ring polymerization/uncharacterized protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCCCCATCTTTTCAATTTCGGCTTTAAGTTGCGCATCTTTGCAGCCACTTACGCCAATAACCCGCAAACCGGTTGCCGAAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAG‑GCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCC > NC_000913/1225798‑1226270 | gCCCCAGTTTTTCAATTTCGGTTTTAAATTGCGCATCTTTGCTGCCACTTACGCCAATAACCCACAAACCGGTTGCCGAACCCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGAt < 1:859979/239‑1 (MQ=255) cccATCTTTTCAATTTCGGCTTTAAGTTGCGCATCTTTGCAGCCACTTACGCCAATAACCCGCAAACCGGTTGCCGAAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATaa > 2:487646/1‑239 (MQ=255) tCAATTTCGGCTTTAAGTTGCGCATCTTTGCAGCCACTTACGCCAATAACCCGCAAACCGGTTGCCGAAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGGCTTCCAGCGCCTGATGGCTAACCTTAGGTTCGGCCTCATGCAGCTGAACCACAGATAACGTGAAGCt > 1:318930/1‑239 (MQ=255) cAATTTCTGCCTTAAGTTGCCCCTTTTTGCACCCACTTCCCCCATTACCCCGCAAACCGTTTGCCGAAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTa < 2:829795/239‑1 (MQ=255) aTTTCGGCTTTAAGTTGCGCATCTTTGCAGCCACTTACGCCAATAACCCGCAAACCGGTTGCCGAAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCGCTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACt < 1:125560/239‑1 (MQ=255) ttCGGCTTTAAGTTGCGCATCTTTGCAGCCACTTACGCCAATAACCCGCAAACCGGTTGCCGAAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACAACAGATAAAGTGAAGCTACTg > 1:456223/1‑238 (MQ=255) tcgcttttAATTTGCGCATTTTTGCACCCACTTACGCCAATACCCCGCAAACCGGTTGCCGAACCCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGGCGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACt < 2:796068/231‑1 (MQ=255) cGGCTTTAAGTTGCGCATCTTTGCAGCCACTTACGCCAATAACCCGCAAACCGGTTGCCGCAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACCGGGGCATGTTTTAACAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGTTTACCCCCAGAtaaaggaaagcaaccacct > 2:464248‑M1/1‑220 (MQ=255) cGGCTTTAAGTTGCGCATCTTTGCAGCCACTTACGCCAATAACCCGCAAACCGGTTGCCGAAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGAAACCCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCCCAGATAAAGTGAAGCTACTGCCt > 1:3752/1‑239 (MQ=255) ccATCTTTGCAGCCACTTACGCCAATAACCCGCAAACCGGTTGCCGAAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTg < 1:814342/237‑1 (MQ=255) gCAGCCACTTACGCCAATACCCCGCAAACCGGTGGCCGAACCCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGG‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCATAGGGTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTg < 1:109685/239‑1 (MQ=255) cccTTCCGCCAAAAACCCCAAAACCGGTTGCCGAAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATc < 2:825898/237‑1 (MQ=255) aCTTACGCCAATAACCCGCAAACCGGTTGCCGAAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACAGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATcc < 1:445376/239‑1 (MQ=255) 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cccagaaaCCGTTTTCCGAAACCGCCTTTGGGAT‑GCGTACACAGTTTCACGGTGCTTCCAGGGCCACGACGT‑TGATGACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCATCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCATCATGCAGAGGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAAt < 2:806724/234‑1 (MQ=255) ccgaaccctggTTTCCCAAACCCCTTTATGCATTCCGTAC‑CAATTTACCCGGTCTTCCAGTGCCCTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCCATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAAtt < 2:11805/230‑1 (MQ=255) ccctaactccgTTGCCAAAACTGTCTTGTGCAACGCTGGC‑CAGTTTACCGGGTTTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGTCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAAtt < 2:617934/229‑1 (MQ=255) ccGCAACCGTGTTCCCCAACCCCCCTTTTGGCTCGCTGGC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACCGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAAtt < 2:563679/239‑1 (MQ=255) ccGCAAACCGGTTGCCGAAACCGCCTTAGTCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAAtt < 1:431696/239‑1 (MQ=255) ccGCAAACCGGTTGCCGAAACCGACTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAAtt < 1:175655/239‑1 (MQ=255) 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aaCCGCCTTTTGTCTCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTTTTCCAGTGCACTGACGG‑TGAGTACAAGGGGGGCATGTTTTAAAAATGGGGGGGCCTGAGCGATTTTGTATTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTGCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGcc < 2:5353/238‑1 (MQ=255) cGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATaa > 2:868498/1‑147 (MQ=255) cGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATaa < 1:868498/147‑1 (MQ=255) cGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGAAGt > 1:105543/1‑238 (MQ=255) 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aC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGGGTTTGACATCCTGGCCTTACCCCATTAGCTTTTAATAATCCCCAACGCGCGGAGATTTTCCCaa > 2:854425/1‑239 (MQ=255) tACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCGTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGGCATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACtata < 1:88426/239‑1 (MQ=255) aCCGGGTTTTCCAGTGCACTGGCGT‑TTGGTTCACCGGGGGCATTGTTTAAAAATGCGGGGGCCTGGGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCG‑AGACTATAAg < 2:647647/239‑1 (MQ=255) ccGGGTTTTCCAGTGCACTGGCGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCGTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAg < 2:641064/239‑1 (MQ=255) ccGGGTCTTCCAGTGGCCTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAg < 1:467143/239‑1 (MQ=255) ccGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAg < 1:888019/239‑1 (MQ=255) 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gtgccttGACTT‑TTAGTTCAACGGGGGCATTTTTTAAAAATGCGGGGGCCTTGGCGATTTTGGTTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCAGGGAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGt < 2:181036/233‑1 (MQ=255) gTGCTCTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCAGGTTTTAAAAAGGGGGGGGCCTGGGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCGGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCCTGTTATAGt < 2:3752/239‑1 (MQ=255) gTGCACTTAAGG‑TGATTACAACGGGAGGAGTGTTTAAAAAGGGGGGGGCAGGAGCGATTTGGGCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAGTCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGt < 2:118255/239‑1 (MQ=255) 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1:50295/1‑80 (MQ=255) cagtttaaCCCCAGATAAATGGAAGTTACTTGCTTTAAGGCTCG‑TTGGCTTGTTTGACATCCTTGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAG‑GCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAGGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGtcaatc < 2:419988/233‑1 (MQ=255) caGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAG‑GCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCCCTGATTCATAGCTTAAAAAAAACCCTTTTCAATAAACCCATTGcc > 2:228930/1‑239 (MQ=255) gATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAG‑GCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTaaaaa < 1:56856/211‑1 (MQ=255) gATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAG‑GCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTaaaaa > 2:56856/1‑211 (MQ=255) | GCCCCATCTTTTCAATTTCGGCTTTAAGTTGCGCATCTTTGCAGCCACTTACGCCAATAACCCGCAAACCGGTTGCCGAAACCGCCTTATGCATCGCTGAC‑CAGTTTACCGGGTCTTCCAGTGCACTGACGT‑TGAGTACAACGGGGGCATGTTTTAAAAATGCGGGGGCCTGAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAA‑GCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAG‑GCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCC > NC_000913/1225798‑1226270 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |