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cGCAGTCACCAGCGCCAATCCTCAGCAAGCGACGGCGATGCTGGCGGACGGGTCGACCGTCGCATTGAGTATGGAAGGCGTTCGCTGG‑GCGCGTCCTTACCGTTCGGATACTCAGCAAGGACCGACGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCGGGCACAAGGGCCGGAAGTGAACTGGGCGCTGGGGTCgt > 1:519968/1‑238 (MQ=255) aatccccAGCGCCAATCCGCAACAAGGTGCGGCGATGCTGGCGGACGGGTCGACCGTCGCATTGAGTATGGAAGGCGTTCGCTGG‑GCGCGTCCTTACCGTTCGGATACTCAGCAAGGACCGACGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCa < 1:540296/234‑1 (MQ=255) gcCAATCCTCAGCAAGCGACGGCGATGCTGGCGGGCGGGTCGACCGTCGCATTGAGTATGGAAGGCGTTCGCTGG‑GCGCGTCCTTACCGTTCGGATACTCAGCAAGGACCGACGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCaaaa < 1:66021/239‑1 (MQ=255) 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cggtgCATTGGGTATGGAAGGCGTTCGCTGG‑GCGCGTCCTTACCGTTCGGATACTCAGCAAGGACCGACGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCCGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCaga < 1:401611/235‑1 (MQ=255) cGTCGCATTGGGTAGGGAAGGCGTTCGCTGG‑GCGCGTCCTTACCGTTCGGATACTCAGCAAGGACCGACGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCCGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCaga < 2:474851/239‑1 (MQ=255) tCGCATTGAGTATGGAAGGCGTTCGCTGG‑GCGCGTCCTTACCGTTCGGATACTCAGCAAGGACCGACGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGTTCAATCCGCAAAACGGTGCCGTTATGGCGCTGGCCGGTGGCGTTGATTTCaacaaaaga > 2:748215/1‑232 (MQ=255) | CAGCAGGCCGCGCAGCAGGCGGTACGTAATAACGTGCTGGACTACGACATGCGCCACGGCTATCGCGGCCCGGCAAATGTGCTGTGGAAAGTGGGCGAGTCGGCGTGGGATAACAACAAGATTACCGATACGCTGAAGGCGCTGCCAACCTATGGTCCGCTGCTGCCTGCCGCAGTCACCAGCGCCAATCCTCAGCAAGCGACGGCGATGCTGGCGGACGGGTCGACCGTCGCATTGAGTATGGAAGGCGTTCGCTGG‑GCGCGTCCTTACCGTTCGGATACTCAGCAAGGACCGACGCCGCGTAAAGTGACCGATGTTCTGCAAACGGGTCAGCAAATCTGGGTTCGTCAGGTTGGCGATGCATGGTGGCTGGCACAAGTGCCGGAAGTGAACTCGGCGCTGGTGTCGATCAATCCGCAAAACGGTGCCGTTATGGCGCTGGTCGGTGGCTTTGATTTCAATCAGAGC > NC_000913/3523756‑3524223 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |